[发明专利]一种微量核酸释放剂、制备方法及其应用在审

专利信息
申请号: 201710378608.1 申请日: 2017-05-25
公开(公告)号: CN107299097A 公开(公告)日: 2017-10-27
发明(设计)人: 邢江峰 申请(专利权)人: 北京一立科技发展有限公司
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12Q1/68
代理公司: 北京递进知识产权代理事务所(特殊普通合伙)11414 代理人: 田丰,郭超栋
地址: 100053 北京市西*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 微量 核酸 释放 制备 方法 及其 应用
【说明书】:

技术领域

发明属于分子生物学领域,具体涉及一种微量核酸释放剂、制备方法及其应用。

背景技术

自1985年PCR技术问世以来,这一技术已被广泛应用到生命科学各个领域,其特点是敏感性高、特异性强、操作简便、所需时间短等。由于临床或直接获得标本中含有蛋白质、脂类等可干扰PCR反应的物质,故在做PCR反应前必须进行核酸提取与纯化。PCR检测技术的第一步就是模板DNA/RNA的制备,这直接影响后续PCR反应的结果。一直以来,样本中核酸的提取和纯化是整个实验中最耗时,最繁琐的过程,严重影响样本检测的速度。

样本中核酸的提取主要包括两个步骤:裂解细胞和提取核酸。裂解细胞使核酸从细胞中释放,蛋白解离的常用方法包括物理法(煮沸、冻融、微波、超声、研磨等)、化学方法(高盐、表面活性剂、苯酚等)和酶消化法(溶菌酶、蛋白酶K等)。

苯酚-氯仿抽提法、异丙醇沉淀法及甲酰胺裂解法是提取DNA最为经典的方法,目前很多方法的改进都是在这些方法的基础上进行的,这三种方法均是利用蛋白酶K和十二烷基硫酸钠(SDS)消化裂解细胞。在前两种方法中,裂解液先用苯酚-氯仿去除蛋白质,再分别用乙醇或异丙醇双醇沉淀DNA。甲酰胺法是利用高浓度的甲酰胺解聚蛋白质与DNA的结合,然后利用透析来处理DNA样品。这些经典方法在不计样本量情况下获得的DNA纯度很高,能够满足各种试验的要求,但操作繁琐,用时长,且所用试剂具有一定的毒性。

碱裂解法是在NaOH提供的高pH(12.0~12.6)条件下,用强阳离子去垢剂SDS破坏细胞壁,裂解细胞,与NaOH共同使细胞的蛋白质发生变性,释放出DNA。裂解后,细胞壁碎片与变性的蛋白质和其他杂质形成大的复合物,这些复合物在高钾盐条件下,可有效沉淀,而DNA保留于上清液中,再通过无水乙醇沉淀、乙醇洗涤等步骤纯化DNA。碱裂解法虽然快速简便,但去蛋白效果欠佳,明显影响了后续PCR效果。

煮沸裂解法原理,是在煮沸时将样品中的DNA通过含蛋白酶K等裂解缓冲液的作用释放出来,溶解在缓冲液中,沸水浴裂解细胞的同时,可破坏DNA链的碱基配对,并使细胞的蛋白质与染色体DNA变性。通过离心沉淀去除变性的蛋白质和其他杂质,然后回收上清液中的DNA用于PCR扩增。然而,经高温煮沸,蛋白凝固使部分核酸被包裹并随离心沉淀丢失,直接导致上清液中模板核酸量减少;另外,虽经煮沸并高速沉淀,上清液中仍含有少量抑制扩增的成分如蛋白、肝素及微量血红蛋白等,抑制了扩增效率。

磁珠法是近几年才发展起来的核酸提取方法,磁珠法提取核酸是通过细胞裂解液裂解细胞,从细胞中游离出来的核酸分子被特异的吸附到磁性颗粒表面,而蛋白质等杂质不被吸附而留在溶液中。反应一定时间之后,再在磁场作用下,使磁性颗粒与液体分开,回收颗粒(即磁珠-DNA混合物),再用洗脱液洗脱,得到纯净的DNA。由于其系列试剂不含氯仿、苯酚等毒性大的有机溶剂,提取步骤更简单,对核酸样本的回收率高和纯度好等优势而倍受研究者青睐。不过产品基本上为国外所垄断,价格非常昂贵,从而限制了其在我国的广泛应用。

目前,国内外临床应用于荧光定量PCR扩增核酸提取方法主要有:(1)碱裂解煮沸法,在样本中加入裂解液煮沸提取核酸;(2)硅胶膜吸附柱法,采用硅胶膜层析柱吸附、清洗、洗脱获得核酸;(3)磁珠吸附法,采用磁珠吸附、清洗、洗脱获得核酸。这三种方法都需要经过多步骤离心(或负压抽吸、磁棒分离)、换管或移液操作才能获得核酸,存在操作步骤繁多、过程中核酸容易丢失或污染的不足。

因此由于临床上样本的量比较少,例如临床样本包括血液、唾液、擦拭物等,无法通过常规核酸提取方法得到符合要求的核酸,影响后续的核酸检测结果,因此迫切需要一种可以进行微量核酸释放的试剂,既可以灵敏地进行核酸的检测,又免去核酸的回收步骤,避免核酸丢失或污染。

发明内容

针对上述技术问题,本发明的目的提供了一种微量核酸释放剂,其中,所述核酸释放剂的各组分配比为:体积百分比0.2%~2.5%的表面活性剂、质量体积百分比0.5%~8%的氯化钾、质量体积浓度0.02mg/ml~1.5mg/ml的蛋白酶K、质量体积百分比0.5%~10%的牛血清白蛋白和2mg/ml~50mg/ml氢氧化钠,余量为水。

其中表面活性剂Tween-20(聚氧乙烯失水山梨醇单月桂酸酯;吐温-20)。

本发明是在经典碱裂解煮沸法的基础上,加入多项试剂优化而来的。经典碱裂解法可以释放大部分液体样本DNA,但有诸多缺点:

1、裂解不够充分,如果低于1000拷贝/毫升DNA,样本无法得以有效裂解。

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