[发明专利]小麦穗密度QTL连锁的HRM分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种小麦穗密度QTL连锁的HRM分子标记及其应用。本发明提供一种与小麦穗密度QTL Qsd.sau‑7A连锁的分子标记，该分子标记为0C32‑715，核苷酸序列如SEQ ID No:1所示。检测分析表明，该分子标记能密切跟踪所述小麦穗密度QTL，可以预测小麦的小穗密集着生的特性，进而通过分子辅助育种选育高穗密度的品种(系)。本发明还提供分子标记0C32‑715在小麦育种中的应用。利用本发明提供的方法能够在一定范围内提高小麦穗密度预测的准确性，以便快速筛选出具有增加穗密度值的QTL的小麦品种或品系用于育种，可大大加快小麦高产品种的选育进程。

技术领域

本发明涉及分子生物学以及作物遗传育种，特别是涉及小麦的穗密度性状相关的分子标记，具体地说是涉及了小麦的穗密度QTL位点Qsd.sau-7A连锁的HRM标记，以及该标记的应用。

背景技术

小麦(Triticum aestivum L.)是世界上最重要的粮食作物之一，目前世界可耕地面积减少，人口增加，迫切期望小麦年产量快速增加。构成小麦产量的三因素有穗粒数，亩穗数和粒重。穗部性状决定了小穗粒数，在一定程度上与产量有关。另一方面，穗部形态对于小麦物种鉴定也有意义。影响小麦穗粒数的因素有穗长、每穗小穗数以及穗密度，且都属于数量性状。

穗密度不仅与小麦的小穗数有关，还与穗长有关，属于数量性状，与穗长、总小穗数、可育小穗数以及不可育小穗数皆属于小麦穗部性状。在一定范围下，增加穗密度值，可以有效的提高小麦的产量。

西藏半野生小麦是中国西藏特有的一种小麦资源。它与中国的一般普通小麦具有相同的AABBDD染色体构型，主要分布在雅鲁藏布江隆子河流域、澜沧江流域和察隅河流域耕作粗放的农田里，与冬小麦混生，而没有野生群落。特殊的生长环境赋予了西藏半野生小麦特殊的性状，如包壳、脆碎和休眠等特性。西藏半野生小麦种蕴藏着待鉴定和发掘的宝贵基因资源，对其优良基因资源的利用较普通小麦以外的其他资源更加容易和快捷。

分子标记，是在DNA水平上直接反应遗传的多态性。分子标记，不受季节环境限制，表达稳定，遍及整个基因组，数量多，高通量，多态性高，检测手段简单、快速，成本低，并且多数标记表现为共显性，可以区分纯合子与杂合子，由于这些特性，分子标记在遗传育种中被广泛地应用。

高分辨熔解曲线(HRM)标记是2003年由美国Utah大学和Idaho Technology公司联合开发的一项新技术，其原理是，双链核苷酸(ds DNA)的热稳定受其长度和碱基组成的影响，序列变化导致升温过程中ds DNA解链行为的改变，而荧光染料只能嵌入并结合到dsDNA上，利用实时PCR技术，通过实时检测ds DNA熔解过程中荧光信号值的变化，就能以生成不同形状熔解曲线的方式将PCR产物中存在的差异直观的展现出来。HRM的优势在于操作简单，分析时间短，灵敏度高和特异性高，PCR产物无需后处理，可实现真正的闭管操作从而降低污染风险。

前人在小麦的1A、1B、2A、2D、3D、4A、4D、5A、5B、5D、6A、7A、7B和7D上检测出控制穗密度的QTL位点，但是相较于穗长、穗粒数和总小穗数，对于穗密度的研究仍然较少。

发明内容

本发明的目的是提供小麦穗密度QTLQSd.sau-7A连锁的HRM分子标记及其应用。

为了实现本发明目的，本发明以西藏半野生小麦(Q1028)为母本，以普通小麦品种郑麦9023(ZM9023)为父本，杂交得到F1，F1代单株自交获得F2，在F2随机选取186个单株，进行自交，分别收获单株，下一年继续自交，如此重复直到F8代，获得含有186个系的重组自交系，构建该群体的全基因组遗传连锁图谱。