[发明专利]一种检测方法及装置有效

专利信息
申请号: 201710326413.2 申请日: 2017-05-10
公开(公告)号: CN107273715B 公开(公告)日: 2020-03-17
发明(设计)人: 李阳 申请(专利权)人: 安吉康尔(深圳)科技有限公司
主分类号: G16B25/10 分类号: G16B25/10;G16B30/10
代理公司: 深圳中一联合知识产权代理有限公司 44414 代理人: 张全文
地址: 518000 广东省深圳市南山区粤海街道*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 检测 方法 装置
【说明书】:

发明适用于分子生物信息检测技术领域,提供了一种检测方法及装置,所述方法包括:获取对样本进行高通量测序得到的结果数据;根据所述结果数据,采用贝叶斯方法统计所述样本的污染率的概率集合;根据统计得到的所述概率集合确定所述样本的污染水平。本发明的技术方案实现了对高通量测序数据的样本污染水平的准确检测,避免了在测序前进行样本污染控制带来的难度和不确定性,极大的提高后期分析结果的准确率。

技术领域

本发明属于分子生物信息检测技术领域,尤其涉及一种检测方法及装置。

背景技术

在使用高通量测序进行遗传病基因检测时,会产生大量短读长序列来进行脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)测序和基因突变检测,但是在此过程中,交叉污染尤其是样本间交叉污染对高通量测序的影响较大,即使是少量的污染即可导致检测结果不准确,出现假阳性或者假阴性的错误结果。

在现有的高通量测序流程中,往往通过前期的实验流程和样本处理来减少交叉污染的发生,但通过这种方式控制交叉污染难度较大,并且具有不确定性,由于测序深度和计算方法的局限性,目前尚没有对高通量测序数据直接的交叉污染检测方法,也没有可以定量分析遗传病基因检测过程中的高通量测序样本交叉污染的方法。

发明内容

有鉴于此,本发明实施例提供了一种检测方法及装置,以解决现有技术中无法对高通量测序数据进行样本污染检测的问题。

本发明实施例的第一方面提供了一种检测方法,包括:

获取对样本进行高通量测序得到的结果数据;

根据所述结果数据,采用贝叶斯方法统计所述样本的污染率的概率集合;

根据统计得到的所述概率集合确定所述样本的污染水平。

本发明实施例的第二方面提供了一种检测装置,包括:

获取模块,用于获取对样本进行高通量测序得到的结果数据;

统计模块,用于根据所述结果数据,采用贝叶斯方法统计所述样本的污染率的概率集合;

确定模块,用于根据统计得到的所述概率集合确定所述样本的污染水平。

本发明实施例与现有技术相比存在的有益效果是:获取对样本进行高通量测序得到的结果数据,根据结果数据采用贝叶斯方法统计样本的污染率的概率集合,并根据该概率集合确定样本的污染水平,实现了对高通量测序数据的样本污染水平的准确检测,避免了在测序前进行样本污染控制带来的难度和不确定性,极大的提高后期分析结果的准确率。

附图说明

为了更清楚地说明本发明实施例中的技术方案,下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍,显而易见地,下面描述中的附图仅仅是本发明的一些实施例,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动性的前提下,还可以根据这些附图获得其他的附图。

图1是本发明实施例一提供的一种检测方法的实现流程图;

图2是本发明实施例二提供的一种检测方法的实现流程图;

图3是本发明实施例三提供的一种检测装置的结构框图;

图4是本发明实施例四提供的一种检测装置的结构框图。

具体实施方式

以下描述中,为了说明而不是为了限定,提出了诸如特定系统结构、技术之类的具体细节,以便透彻理解本发明实施例。然而,本领域的技术人员应当清楚,在没有这些具体细节的其它实施例中也可以实现本发明。在其它情况中,省略对众所周知的系统、装置、电路以及方法的详细说明,以免不必要的细节妨碍本发明的描述。

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