[发明专利]基于转录组测序技术用于早期肝癌诊断和预后评估的基因群及其应用有效
申请号: | 201710306521.3 | 申请日: | 2017-05-04 |
公开(公告)号: | CN107058550B | 公开(公告)日: | 2020-11-10 |
发明(设计)人: | 杨田;李超;梁磊;邢昊;韩骏;张汉 | 申请(专利权)人: | 上海东方肝胆外科医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 南京新慧恒诚知识产权代理有限公司 32424 | 代理人: | 王月霞 |
地址: | 200438 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 转录 组测序 技术 用于 早期 肝癌 诊断 预后 评估 基因 及其 应用 | ||
1.用于肝癌早期诊断及预后评估的基因群,其特征在于,所述基因群由如下4个基因组成:GPC3、HSP70、GS和PIVKA-Ⅱ;根据基因群中4个基因的表达量计算复发风险值,根据复发风险值对待测患者做出是否为早期肝癌以及判断肝癌患者预后复发率;
所述的表达量计算复发风险值的算法为:RS=0.080×GP3+0.098×HSP70+0.047×GS+0.13×PIVKA-Ⅱ;
复发风险值小于3分的,建议不判断为原发性肝癌,大于及等于3分的建议判断为原发性肝癌;得分大于3分小于12分的复发风险较低,得分大于等于12分小于27分的复发风险为中等,得分大于等于27分的复发风险较高。
2.用于肝癌早期诊断及预后评估的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中包括用于检测待测患者的离体样本中基因群中各个基因的表达量的试剂,所述基因群为GPC3、HSP70、GS和PIVKA-Ⅱ4个基因组成的基因群;根据基因群中4个基因的表达量计算复发风险值,根据复发风险值对待测患者做出是否为早期肝癌以及判断肝癌患者预后复发率。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中包括用于qPCR反应检测GPC3、HSP70、GS、PIVKA-Ⅱ四个基因的引物对。
4.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:所述的表达量计算复发风险值的算法为:RS=0.080×GP3+0.098×HSP70+0.047×GS+0.13×PIVKA-Ⅱ。
5.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:根据复发风险值对待测患者做出是否为早期肝癌以及判断肝癌患者预后复发率的方法为:复发风险值小于3分的,建议不判断为原发性肝癌,大于及等于3分的建议判断为原发性肝癌;得分大于3分小于12分的复发风险较低,得分大于等于12分小于27分的复发风险为中等,得分大于等于27分的复发风险较高。
6.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:所述离体样本为离体肝组织。
7.检测权利要求1所述的基因群表达量的产品或权利要求2-5中任意一项所述的试剂盒在制备预测或辅助预测早期肝癌或者肝癌患者预后复发率的产品中的应用。
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