[发明专利]一种中医网络证候学分析平台及构建方法和应用

说明书

本发明涉及一种中医网络证候学分析平台及构建方法和应用；通过文献得到与证候相关的各种疾病，要求所采用的文献为中文核心期刊目录或科学引文索引所收录、报道临床研究的文献，包括题目、摘要或正文中报道证候与疾病的直接对应关系；蛋白靶点鉴定信息通过DisGeNet数据库查询疾病信息，得到与各疾病相关全部蛋白靶点及蛋白靶点名称缩写信息和蛋白靶点UniProt编号信息；生物通路信息由Reactome数据库收录生物通路的名称信息、生物通路编号信息及生物通路包含的蛋白信息得到；形成多层次网络构建的平台。应用网络证候与疾病对应关系、疾病与蛋白靶点的对应关系、蛋白与生物通路的对应关系，得到多层次中医证候生物学网络。

技术领域

本发明属于中医证候学和系统生物学领域，特别涉及一种中医网络证候学分析平台及利用中医证候生物学网络构建方法。

背景技术

证候作为中医学的基本概念，与西医“疾病”的概念既有区别又有联系。从涵义上讲，证候是对人体特定生理阶段各种体征的总结，因此同一疾病的不同发展阶段往往对应于不同证候，即“同病异证”；同时，不同疾病在各自特定的发展阶段可以对应于同一证候，即“异病同证”。而中医之证候与西医之疾病最重要的联系在于，当证候与疾病的特定阶段产生对应关系时，二者应具有共同的生物学基础；于是充分利用现代医学对疾病的研究成果，可为证候生物学基础的探究提供基础和切入点。

近年来，“网络”的概念在医学和生理学研究中得到了越来越多的重视和应用。在中医证候的研究中，以证候与相关疾病的联系为媒介，将相关的生物网络、蛋白靶标及生物通路与中医证候联接起来，便构成了“证候-疾病-蛋白靶标-生物通路”多层次复杂网络结构。此类中医证候生物学网络结构上具有网络的一般性特征，即由若干节点以及连接关联节点的边组成；节点代表系统内的不同个体，若2个节点以边相连，则表示它们之间有某种联系。网络证候学的概念和方法便是基于这些思想提出的，旨在通过证候生物学网络的构建和分析，全面准确地阐释其生物学基础。

发明内容

本发明的目的在于提供一种中医网络证候学分析平台及中医证候生物学网络构建方法，该分析平台及分析方法能结合中医证候的相关疾病和蛋白靶标，准确、高效地构建中医证候的生物学网络，为中医证候的生物学基础研究提供指导，并可协助新型中药的研发。

为达到上述目的，本发明采用的以下技术方案：

本发明的中医网络证候学分析平台，所述分析平台包括中医证候基本信息、证候相关疾病信息、蛋白靶点鉴定信息、生物通路信息的中医网络证候学数据库模块。

所述的中医证候基本信息包括证候编码信息、证候名称信息、证候分类信息、证候别名信息以及证候症状描述信息。

所述证候相关疾病信息包括各证候与各疾病的关联信息、疾病中文名称信息、疾病英文名称信息、疾病ICD-10编码信息以及疾病MeSH编码信息。

所述蛋白靶点鉴定信息包括蛋白靶点名称缩写信息、蛋白靶点UniProt编号信息、蛋白靶点对应的疾病信息、以及蛋白靶点的数据来源信息。

所述生物通路信息包括生物通路所包含的蛋白靶点名称缩写信息、生物通路的名称信息以及生物通路的编号信息。

本发明的中医网络证候学分析平台的构建方法，通过文献挖掘得到与证候相关的各种疾病，要求所采用的文献为中文核心期刊目录或科学引文索引(SCI)所收录、报道临床研究的文献，且文献的题目、摘要或正文中报道证候与疾病的直接对应关系；蛋白靶点鉴定信息通过在DisGeNet数据库(www.disgenet.org)查询疾病信息，得到与各疾病相关的全部蛋白靶点以及蛋白靶点名称缩写信息和蛋白靶点UniProt编号信息；生物通路信息由Reactome数据库(www.reactome.org)收录的生物通路的名称信息、生物通路的编号信息以及生物通路所包含的蛋白信息总结得到；形成多层次网络构建的平台。