[发明专利]与杜氏盐藻细胞抗盐能力相关的miRNA在审
| 申请号: | 201710284159.4 | 申请日: | 2017-04-26 |
| 公开(公告)号: | CN107058322A | 公开(公告)日: | 2017-08-18 |
| 发明(设计)人: | 贾岩龙;王喜成;郭潇;王绪娟;王稳;邱乐乐 | 申请(专利权)人: | 新乡医学院 |
| 主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12N15/11;C12Q1/68;C12N15/82;A01H5/00 |
| 代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司11002 | 代理人: | 王文君 |
| 地址: | 453003 河南*** | 国省代码: | 河南;41 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 杜氏盐藻 细胞 能力 相关 mirna | ||
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体地说,涉及与杜氏盐藻细胞抗盐能力相关的miRNA。
背景技术
MicroRNA(miRNA)是在真核生物中发现的一类内源性的具有调控功能的非编码RNA,其长度约为21-25个核苷酸。成熟miRNA的产生是由较长的初级转录本(pri-miRNA)经过一系列核酸酶的剪切加工而成的,随后组装进RNA诱导的沉默复合体,通过碱基互补配对的方式识别靶mRNA,并根据互补程度的不同指导沉默复合体降解靶mRNA或者阻遏靶mRNA的翻译。研究表明miRNA参与了生命过程中多种重要进程,包括发育、细胞增殖和凋亡、细胞分化、脂肪代谢等等。目前在miRBase数据库中收录有人(Homo sapiens)的pre-miRNA(miRNA前体)1881条,小鼠(Mus musculus)有1193条,大鼠(Rattus norvegicus)有495条,莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)有50条,而在杜氏盐藻(Dunaliella salina,D.salina)中发现的miRNA少之又少。杜氏盐藻是一种比较独特的高度耐盐单细胞真核生物,属绿藻门绿藻纲团藻目多睫毛科。杜氏盐藻细胞没有细胞壁,具双鞭毛而能游动,含有一个较大的杯状叶绿体能进行光合作用;可在含有0.05M-5M NaCl的盐水中生长,抗逆性极佳,是一种较为理想的抗逆境生物。杜氏盐藻细胞因含有丰富的β-胡萝卜素而具有独特经济价值。极其耐盐的能力、简单的细胞结构、便利的培养条件及丰富的营养价值使杜氏盐藻成为进行生物能源、耐盐抗逆性等研究的重要模式生物和遗传学研究的良好材料。miRNA具有物种和组织特异性,最近几年关于植物miRNA的各类研究越来越多,例如抗旱、抗盐等抗逆性研究。
发明内容
本发明以杜氏盐藻为研究对象,发现了一些在miRBase数据库中未被收录的预测miRNA,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1-16所示。经试验证实,其与杜氏盐藻细胞抗盐能力相关。
因此,本申请提供了新的与抗盐胁迫相关的miRNA序列。
在此基础上,所述miRNA的前体序列及其前体序列的编码序列也属于本发明的保护范围。
经试验研究发现,前述miRNA的表达量受到盐胁迫的调节,且调节效果明显,说明其在杜氏盐藻适应高盐胁迫机制中发挥重要作用。
所述试验研究具体为,通过对高盐(含3.0M NaCl)和低盐(含0.75M NaCl)培养条件下测序获得的杜氏盐藻样品小RNA序列进行数据分析并采用Fisher精确检验分析发现,上述miRNA与杜氏盐藻细胞的抗盐能力显著相关。具体表现为:相对在低盐环境中的表达量,上述其中一条miRNA(SEQ ID NO.1)在高盐环境中的表达量显著降低(P<0.05),其余15条miRNA(SEQ ID NO.2-16)在高盐环境中的表达量显著升高(P<0.05)。
因此,本发明进一步提供了所述miRNA在杜氏盐藻抗盐胁迫中的应用,以及其在培育耐盐转基因植物中的应用,具体为在所述转基因植物中过表达所述miRNA或抑制所述miRNA的表达。
更进一步地,基于前述研究及发现,检测本发明所述miRNA的试剂也应当属于本发明的保护范围,所述试剂可用于判断/检测杜氏盐藻细胞的抗盐能力。
不仅如此,基于前述研究及发现,可从本发明提供的miRNA(SEQ ID NO.1-16)中单独取其中一个/多个进行抗盐胁迫研究,并且还能够联合目前已发现的miRNA一起用于定制芯片,用于藻类或植物耐盐抗逆性等研究。
因此,本发明还提供了一种miRNA芯片,其可鉴定本发明所述的miRNA是否表达,或检测本发明所述miRNA表达量的高低,但并不限于仅检测本发明所提供的miRNA。应当理解的是,只要所述miRNA芯片可用于检测本发明所述的miRNA,该miRNA芯片均属于本发明的保护范围。
本发明的有益效果在于:
本发明发现并提供了新的与杜氏盐藻细胞抗盐能力相关的miRNA,可以选取其中一个或多个进行杜氏盐藻抗盐活动的研究,并且还能够与目前已发现的miRNA一起用于定制芯片,用于藻类或植物耐盐抗逆性等研究。
具体实施方式
下面将结合实施例对本发明的优选实施方式进行详细说明。需要理解的是以下实施例的给出仅是为了起到说明的目的,并不是用于对本发明的范围进行限制。本领域的技术人员在不背离本发明的宗旨和精神的情况下,可以对本发明进行各种修改和替换。
下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法。
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