[发明专利]一种番茄斑萎病毒属病毒基因及其应用有效
申请号: | 201710251104.3 | 申请日: | 2017-04-18 |
公开(公告)号: | CN106929520B | 公开(公告)日: | 2020-11-10 |
发明(设计)人: | 董家红;郑宽瑜;张仲凯;吴阔;张丽珍 | 申请(专利权)人: | 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所 |
主分类号: | C12N15/40 | 分类号: | C12N15/40;C12Q1/70;C12N15/11;C12R1/94 |
代理公司: | 昆明知道专利事务所(特殊普通合伙企业) 53116 | 代理人: | 姜开侠;谢乔良 |
地址: | 650223*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 番茄 病毒 基因 及其 应用 | ||
1.一种番茄斑萎病毒属病毒基因,其特征在于所述番茄斑萎病毒属病毒为辣椒黄化环斑病毒,其基因的碱基序列如SEQ ID NO:2所示,能够编码病毒的运动蛋白NSm和糖蛋白Gn或Gc;如SEQ ID NO:2所示的病毒基因序列编码的氨基酸序列如SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7所示。
2.一种用于检测番茄斑萎病毒属病毒基因的检测试剂盒,其特征在于所述番茄斑萎病毒属病毒基因为如SEQ ID NO:2所示的辣椒黄化环斑病毒基因,试剂盒含有浓度为100pmol的正义引物50μL、浓度为100pmol的反义引物50μL、浓度为100pmol的探针50μL、RT-PCR反应液2.5ml;正义引物的序列为SEQ ID No:2中第1320-1340位,反义引物的序列为SEQ ID No:2中第2700-2720 位的互补序列,探针的序列为SEQ ID No:2中第1986-2200位。
3.根据权利要求2所述的检测试剂盒,其特征在于操作步骤如下:
病样总RNA的提取,去感病植物,液氮研磨后,提取病样的总RNA,用12µL总RNA为模板,1µL100µM下游引物混合,cDNA合成体系为20µL,70℃预变性10min后,迅速插入冰上5min,加入5×RT Buffer 4μL,10mmol/L dNTP 2μL,5U/μL M-MLV 1μL,40U/μL RNase Inhibitor 1μL,42℃延伸90min;以cDNA为模板或以带有进行PCR扩增;反应体系为50µL: cDNA 3µL,上游引物1µL,下游引物1µL,dNTP1µL,rTaq 1µL,10´buffer 5µL,H2O 38µL;反应条件为:94℃下预变性4min;然后94℃下变性1min,55℃退火1 min,72℃下延伸1 min 30s,循环扩增30次;最后72℃下延伸10min;
PCR产物用UNIQ-10柱式PCR纯化试剂盒或UNIQ-10柱式胶回收试剂盒回收,回收的片段用于作为探针,或连接到pMD18-T载体上,连接体系:2.5μL Ligation mix,0.5μL pMD18-T,2μL PCR回收产物,16℃的条件下连接过夜;42℃热激转化到大肠杆菌DH5α,菌落PCR筛选阳性克隆,测序。
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