[发明专利]基于合成生物学样本实体库的信息处理系统及方法在审

专利信息
申请号: 201710229228.1 申请日: 2017-04-10
公开(公告)号: CN107016520A 公开(公告)日: 2017-08-04
发明(设计)人: 周晓;李飞飞;李炳志;元英进 申请(专利权)人: 天津大学
主分类号: G06Q10/08 分类号: G06Q10/08;G06F19/28
代理公司: 北京集佳知识产权代理有限公司11227 代理人: 王宝筠
地址: 300072 天津市*** 国省代码: 天津;12
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摘要:
搜索关键词: 基于 合成 生物学 样本 实体 信息处理 系统 方法
【说明书】:

技术领域

发明涉及生物技术领域,尤其涉及一种基于合成生物学样本实体库的信息处理系统及方法。

背景技术

合成生物学是基于生物学工程化的思想,通过对生命体的设计、改造和重建的方法,以实现特定功能的目的的一门交叉学科。工程领域的元器件、装置和系统,即对应于合成生物学上的元件(Part)、模块(Module)、生命系统(System),合成生物学上各种元器件用于发挥其功能的细胞载体即为底盘(Chassis)。随着合成生物学的深入研究和广泛应用,针对各种元件、模块和底盘的需求日益增加。

长久以来,生命科学领域各种各样的种源库或样本库提供了数以万计的生物资源,如菌种库、藻种库、细胞库和医学样本库等等。但由于其中很多属于非模式生物,遗传背景不清晰并缺乏有效的遗传操作手段,或者培养技术难度及成本高,因此,难以加以工程化地改造和利用。每种生命所携带的独特的遗传信息蕴含巨大的利用价值和潜力,如果以合成生物学的思想对其解耦,抽提出其中各种元件模块,并在新的可控的底盘背景下实现其功能的研究验证,则可以更好地利用这些遗传资源,同时来自于各种生命系统的经过解耦抽提的遗传资源则汇集构成完全不同于其起始来源的可被工程化利用的元件模块库。

例如,国际遗传工程机器大赛(The International Genetically Engineered Machine Competition,简称iGEM)是学生组队参与的合成生物学比赛,该比赛通过收集参赛项目的结果形成标准生物元件注册库(Registry of Standary Biological Parts)。该元件注册库由于主要通过收集学生们短时间内自由探索的多样的参赛项目形成,导致该元件注册库内容重复规模虚大,同时又内容繁杂,因此,对该元件注册库中存储的元件、模块等进行查询时,不利于查找到对应的元件。

发明内容

有鉴于此,本发明的主要目的在于提供一种基于合成生物学样本实体库的信息处理系统及方法,能够便于查找合成生物学样本实体库中的样本对象。

本发明提供了一种基于合成生物学样本实体库的信息处理系统,所述合成生物学样本实体库用于存储至少一个样本对象;所述系统包括服务器和客户端,所述服务器包括精准存储单元;

所述精准存储单元,用于模拟所述合成生物学样本实体库,生成三维形式的虚拟样本库;

所述客户端,用于响应用户查询目标样本的请求,定位并显示所述目标样本在所述虚拟样本库中的空间位置,所述目标样本为所述合成生物学样本实体库中存储的一个样本对象。

可选的,所述精准存储单元,还用于对所述合成生物学样本实体库中的存储设备按照分层进行唯一编号,并建立每一分层编号与对应分层存放的样本对象之间的关联关系;

则,所述客户端,还用于根据所述关联关系查询与所述目标样本关联的分层编号,显示该分层编号对应的分层位置信息。

可选的,所述服务器还包括以下一个或多个单元:

实体库监控单元,用于获取监控设备对所述合成生物学样本实体库的监控图像;

操作记录单元,用于存储所述合成生物学样本实体库中每个样本对象的被操作记录;

物品管理单元,用于根据所述合成生物学样本实体库的当前库存信息,确定所述合成生物学样本实体库的库存是否欠缺,如果是,则向预设的客户端发送欠缺提示信息;

则,所述客户端,还用于响应用户查询所述监控图像的请求,获取请求的监控图像;还用响应于用户查询所述被操作记录的请求,获取请求的被操作记录。

可选的,当所述合成生物学样本实体库包括至少两个样本分库时,则其中一个样本分库中存储的样本对象用于正常使用,其它样本分库中存储的样本对象用于备份。

可选的,所述合成生物学样本实体库中存储的元件之间、模块之间、以及元件与模块之间能够兼容适配。

可选的,所述服务器还包括以下一个或多个单元:

项目管理单元,用于存储所述合成生物学样本实体库中每一样本对象所属项目的项目信息;

编码管理单元,用于根据预制编码规则,对所述合成生物学样本实体库涉及的所有项目、每一项目下的子课题以及每一子课题下的分任务进行逐层编号,并对各个所述分任务下入库的样本对象进行分类编号。

信息更新单元,用于响应不同账户下的用户对负责样本对象的信息更新;

管理员设置单元,用于响应管理员对所述不同账户的权限设定;

信息查询单元,用于响应每一合法用户的样本信息查询请求。

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