[发明专利]两个黑芥重复DNA序列及其应用

说明书

本发明公开了两种黑芥基因组DNA序列及其应用。本发明提供了用于鉴定芸薹属植物B基因组的成套DNA分子，为由序列表的序列1所示的单链DNA分子和序列表的序列2所示的单链DNA分子组成。本发明的实验证明，BNSAT28和BNSAT68的获得使芸薹属作物的染色体的识别更容易、准确，填补了芸薹属作物染色体鉴定上无理想探针可用的空缺。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，尤其涉及两种黑芥基因组DNA序列及其应用。

背景技术

十字花科芸薹属蔬菜包括以白菜为代表的A基因组Brassica rapa(AA,n＝10)，黑芥的B基因组，Brassica nigra(BB,n＝8)，和甘蓝为代表的C基因组Brassica oleracea(CC,n＝9)，以及他们自然加倍形成的三个异缘四倍体复合种：甘蓝型油菜类B.napus(AACC,n＝19),芥菜类B.juncea(AABB,n＝18)，和埃塞俄比亚芥B.carinata(BBCC,n＝17)，组成了著名的U三角。包含了世界范围内最重要的食用，油用及调味用蔬菜，也是研究属内遗传多样性和物种及多倍性演化的模式材料。

黑芥是芸薹属的野生种，在长期的生态适应下保留了很多优良性状，如抗多种病原菌(Groat,2003；Pradhan et al.,2011)，和优异的种油质量(Chèvre et al.,1991；Pradhan et al.,2011)。这些都是芸薹属育种的重要基因源，然而，B基因组遗传和细胞学信息的缺乏阻碍了其基因的转移和利用。芸薹属物种进化和倍性演化研究也受到B基因组信息缺乏的限制。

随着A、C基因组的快速研究，黑芥B基因组的研究也将越来越受到重视，黑芥基因组测序计划也已启动，因此其细胞遗传学研究也必须先前一步。开发稳定的细胞学标记和建立方便可靠的核型鉴定方法是基础。

芸薹属蔬菜染色体小，尤其是B基因组的黑芥，完全不可能靠形态识别所有染色体，核型是细胞遗传学研究的基础和关键。目前，关于芸薹属B基因组的染色体核型分析鲜有报道，基本还停留在染色体形态和C显带技术上，重复性差，辨别受主观因素影响大，方法繁琐。

发明内容

本发明的一个目的是提供用于鉴定芸薹属植物B基因组的成套DNA分子。

本发明提供的成套DNA分子，为如下1)或2)：

1)由序列表的序列1所示的单链DNA分子和序列表的序列2所示的单链DNA分子组成；

2)由序列A所示的单链DNA分子和序列B所示的单链DNA分子组成；

序列A为与序列1同源性大于90％的序列；

序列B为与序列2同源性大于90％的序列。

本发明另一个目的是提供用于鉴定芸薹属植物B基因组的成套载体。

本发明提供的成套载体，由表达序列1所示的单链DNA分子的重组载体和表达序列2所示的单链DNA分子的重组载体组成。

表达序列1所示的单链DNA分子的重组载体为将序列1所示的BNSAT28序列克隆到PMD-18T载体上得到的质粒。

表达序列2所示的单链DNA分子的重组载体为将序列2所示的BNSAT68序列克隆到PMD-18T载体上得到的质粒。

本发明第3个目的是提供用于鉴定芸薹属植物B基因组的试剂盒。

本发明提供的试剂盒，包括上述的成套DNA分子或上述的成套载体。

上述中，所述序列1所示的单链DNA分子的核苷酸和所述序列2所示的单链DNA分子的核苷酸标记不同的荧光基团。