[发明专利]水稻抽穗期相关基因、功能标记及应用在审
申请号: | 201710206317.4 | 申请日: | 2017-03-31 |
公开(公告)号: | CN106967725A | 公开(公告)日: | 2017-07-21 |
发明(设计)人: | 占小登;孙滨;程式华;曹立勇;张迎信;沈希宏 | 申请(专利权)人: | 中国水稻研究所 |
主分类号: | C12N15/29 | 分类号: | C12N15/29;C12N15/82;A01H5/00;C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京方韬法业专利代理事务所11303 | 代理人: | 朱贝贝 |
地址: | 311400 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 水稻 抽穗期 相关 基因 功能 标记 应用 | ||
1.水稻抽穗期相关基因qHD5,其特征在于,所述基因是如下a)或b)或c)的基因:
a)其cDNA的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.1所示,命名为qHD5-NIL(BG1);
b)其cDNA的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.2所示,命名为qHD5-NIL(XLJ);
c)与a)或b)的基因具有90%以上的同源性,且编码相同功能的蛋白质。
2.权利要求1所述的基因的PCR扩增引物,其特征在于,为如下引物a)或b):
a)具有SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列的正向引物qHD5-cDNA-F,以及具有SEQ ID NO.4所示的核苷酸序列的反向引物qHD5-cDNA-R;
b)具有SEQ ID NO.5所示的核苷酸序列的正向引物qHD5-com-F,以及具有SEQ ID NO.6所示的核苷酸序列的反向引物qHD5-com-R。
3.含有权利要求1所述的基因的生物材料,所述生物材料为载体、宿主细胞或表达盒。
4.权利要求1所述的基因或其编码的蛋白在选育不同抽穗期水稻品种中的应用。
5.一种改变水稻抽穗期性状的方法,是将权利要求1中所述的基因a)导入目的水稻组织或细胞中,得到抽穗期提前的转基因水稻。
6.一种检测水稻抽穗期相关基因qHD5的功能标记,其特征在于,所述功能标记为qHD5-1032-dCAPs1,该功能标记的引物包括:
正向引物qHD5-1032-dCAPs1-F,其核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示;
反向引物qHD5-1032-dCAPs1-R,其核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示。
7.权利要求6所述的功能标记在选育不同抽穗期水稻品种中的应用。
8.一种鉴别水稻抽穗期性状的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1:利用权利要求6所述的功能标记的引物对待测水稻植株DNA/cDNA进行PCR扩增,获得扩增产物;
S2:将上述扩增产物用EspⅠ内切酶进行酶切,酶切产物经电泳分离,并根据电泳结果进行判断:
若获得141bp条带和120bp条带,则该水稻植株为早抽穗型;
若获得141bp的条带,则该水稻植株为早抽穗型;
若获得120bp的条带,则该水稻植株为晚抽穗型。
9.权利要求8所述的鉴别水稻抽穗期性状的方法,其特征在于,所述步骤S1中PCR扩增体系为12μL,包含H2O 3μL,2×PCR Mix 5.0μL,正反向引物各1μL,cDNA模板2.0μL;
PCR扩增条件为94℃预变性4min;94℃变性30s,60℃退火30s,72℃延伸1min,32个循环;72℃延伸10min。
10.权利要求8所述的鉴别水稻抽穗期性状的方法,其特征在于,所述步骤S2中EspⅠ内切酶体系为15μL,包含EspⅠ内切酶0.6μL,10×Buffer 1.2μL,PCR产物12μL,H2O 1.2μL;反应条件为37℃,5min。
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