[发明专利]与豌豆抗白粉病等位基因er1‑9共分离的分子标记及其应用在审
申请号: | 201710175612.8 | 申请日: | 2017-03-22 |
公开(公告)号: | CN107058306A | 公开(公告)日: | 2017-08-18 |
发明(设计)人: | 朱振东;孙素丽;邓东;段灿星 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院作物科学研究所 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司11002 | 代理人: | 王文君 |
地址: | 100081 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 豌豆 白粉病 等位基因 er1 分离 分子 标记 及其 应用 | ||
1.与豌豆抗白粉病等位基因er1-9共分离的分子标记,其特征在于,所述分子标记位于豌豆遗传图谱第VI连锁群上,与er1-9的遗传距离为0cM,用于扩增所述分子标记的3条特异性引物具有如下核苷酸序列:
正向引物序列1:TGTTATATGGGCAGGGTGGTATC
正向引物序列2:TTTTGTTATATGGGCAGGGTGGTATT
通用反向引物序列:CAAAATGTAGATTATGCTTACAATTAGTGGA。
2.用于扩增与豌豆抗白粉病等位基因er1-9共分离的分子标记的引物组合,其特征在于,其含有:
正向引物序列1:TGTTATATGGGCAGGGTGGTATC
正向引物序列2:TTTTGTTATATGGGCAGGGTGGTATT
通用反向引物序列:CAAAATGTAGATTATGCTTACAATTAGTGGA。
3.权利要求1所述的分子标记或权利要求2所述的引物组合在豌豆抗白粉病的分子标记辅助选择育种中的应用。
4.权利要求1所述的分子标记或权利要求2所述的引物组合在鉴定豌豆抗白粉病种质资源中的应用。
5.根据权利要求3或4所述的应用,其特征在于,PCR扩增待测豌豆的基因组DNA,当扩增产物长度为75bp时,待测豌豆为含有er1-9的抗白粉病豌豆;当扩增产物长度为79bp时,待测豌豆为不含有er1-9的抗白粉病或感白粉病豌豆。
6.根据权利要求3或4所述的应用,其特征在于,包括以下步骤:
1)提取待测豌豆的基因组DNA;
2)以待测豌豆的基因组DNA为模板,利用特异性引物进行PCR扩增反应;所述特异性引物为:
FAM正向引物序列1:TGTTATATGGGCAGGGTGGTATC
HEX正向引物序列2:TTTTGTTATATGGGCAGGGTGGTATT
COM通用反向引物序列:CAAAATGTAGATTATGCTTACAATTAGTGGA;
3)利用KASP分析技术检测PCR扩增产物。
7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,步骤2)中PCR扩增反应使用的扩增体系以5μl计为:10ng/μl豌豆基因组DNA 2.0μl,KASP Master Mix 2.5μl,混合引物0.07μl,ddH2O 0.43μl。
8.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,步骤2)中进行PCR扩增反应的条件为:95℃热激活15分钟;95℃变性20秒,65-55℃退火和延伸25秒,10个循环,每循环降低1.0℃;95℃变性10秒,56℃退火和延伸60秒,30个循环。
9.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,步骤3)中利用KASP分析技术检测PCR扩增产物,利用LGC系统的SNPline平台进行SNP基因型分型检测。所有含有等位基因er1-9的豌豆资源均出现在红色散点区域,该基因具有FAM标签序列;而不含有等位基因er1-9的抗白粉病和感白粉病豌豆资源均出现在蓝色散点区域,该基因具有HEX标签序列;抗感亲本杂交获得的群体中的杂合株系均出现在绿色散点区域,该基因具有FAM和HEX两种标签序列。
10.用于检测抗白粉病豌豆资源的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中含有权利要求2所述的特异性引物组合。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于中国农业科学院作物科学研究所,未经中国农业科学院作物科学研究所许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201710175612.8/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。