[发明专利]与豌豆抗白粉病等位基因er1‑9共分离的分子标记及其应用在审

专利信息
申请号: 201710175612.8 申请日: 2017-03-22
公开(公告)号: CN107058306A 公开(公告)日: 2017-08-18
发明(设计)人: 朱振东;孙素丽;邓东;段灿星 申请(专利权)人: 中国农业科学院作物科学研究所
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/68
代理公司: 北京路浩知识产权代理有限公司11002 代理人: 王文君
地址: 100081 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 豌豆 白粉病 等位基因 er1 分离 分子 标记 及其 应用
【权利要求书】:

1.与豌豆抗白粉病等位基因er1-9共分离的分子标记,其特征在于,所述分子标记位于豌豆遗传图谱第VI连锁群上,与er1-9的遗传距离为0cM,用于扩增所述分子标记的3条特异性引物具有如下核苷酸序列:

正向引物序列1:TGTTATATGGGCAGGGTGGTATC

正向引物序列2:TTTTGTTATATGGGCAGGGTGGTATT

通用反向引物序列:CAAAATGTAGATTATGCTTACAATTAGTGGA。

2.用于扩增与豌豆抗白粉病等位基因er1-9共分离的分子标记的引物组合,其特征在于,其含有:

正向引物序列1:TGTTATATGGGCAGGGTGGTATC

正向引物序列2:TTTTGTTATATGGGCAGGGTGGTATT

通用反向引物序列:CAAAATGTAGATTATGCTTACAATTAGTGGA。

3.权利要求1所述的分子标记或权利要求2所述的引物组合在豌豆抗白粉病的分子标记辅助选择育种中的应用。

4.权利要求1所述的分子标记或权利要求2所述的引物组合在鉴定豌豆抗白粉病种质资源中的应用。

5.根据权利要求3或4所述的应用,其特征在于,PCR扩增待测豌豆的基因组DNA,当扩增产物长度为75bp时,待测豌豆为含有er1-9的抗白粉病豌豆;当扩增产物长度为79bp时,待测豌豆为不含有er1-9的抗白粉病或感白粉病豌豆。

6.根据权利要求3或4所述的应用,其特征在于,包括以下步骤:

1)提取待测豌豆的基因组DNA;

2)以待测豌豆的基因组DNA为模板,利用特异性引物进行PCR扩增反应;所述特异性引物为:

FAM正向引物序列1:TGTTATATGGGCAGGGTGGTATC

HEX正向引物序列2:TTTTGTTATATGGGCAGGGTGGTATT

COM通用反向引物序列:CAAAATGTAGATTATGCTTACAATTAGTGGA;

3)利用KASP分析技术检测PCR扩增产物。

7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,步骤2)中PCR扩增反应使用的扩增体系以5μl计为:10ng/μl豌豆基因组DNA 2.0μl,KASP Master Mix 2.5μl,混合引物0.07μl,ddH2O 0.43μl。

8.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,步骤2)中进行PCR扩增反应的条件为:95℃热激活15分钟;95℃变性20秒,65-55℃退火和延伸25秒,10个循环,每循环降低1.0℃;95℃变性10秒,56℃退火和延伸60秒,30个循环。

9.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,步骤3)中利用KASP分析技术检测PCR扩增产物,利用LGC系统的SNPline平台进行SNP基因型分型检测。所有含有等位基因er1-9的豌豆资源均出现在红色散点区域,该基因具有FAM标签序列;而不含有等位基因er1-9的抗白粉病和感白粉病豌豆资源均出现在蓝色散点区域,该基因具有HEX标签序列;抗感亲本杂交获得的群体中的杂合株系均出现在绿色散点区域,该基因具有FAM和HEX两种标签序列。

10.用于检测抗白粉病豌豆资源的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中含有权利要求2所述的特异性引物组合。

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