[发明专利]用于HLA分型的基因型序列有效
申请号: | 201710166620.6 | 申请日: | 2017-03-20 |
公开(公告)号: | CN108624671B | 公开(公告)日: | 2022-02-01 |
发明(设计)人: | 柴相花;杨晓琴;方俊彬;杨帆;陈琳;袁玉英;张红云;刘娜;尹烨 | 申请(专利权)人: | 深圳华大基因股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6881 | 分类号: | C12Q1/6881;C12N15/11 |
代理公司: | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人: | 孙银行;彭家恩 |
地址: | 518083 广东省深圳市盐田*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 hla 基因型 序列 | ||
一组用于HLA分型的基因型序列,包括SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列,以及任选地,还包括SEQ ID NO:2‑10所示的核苷酸序列中的至少一个。本发明的用于HLA分型的基因型序列,丰富了HLA数据库,可以有效提高分型精度,从而提高相关疾病的治疗效率,如地中海贫血治疗、急性白血病、骨髓移植等。
技术领域
本发明涉及HLA(human leukocyte antigen,人类白细胞抗原)分型技术领域,具体涉及一组用于HLA分型的基因型序列。
背景技术
二十世纪70年代到80年代,HLA分型技术主要是血清学和细胞学。90年代以来,分子生物学的发展,尤其是PCR技术的引入,使得分子技术在临床诊断方面得到广泛的应用,HLA分型也不例外(WoszczekG,et al.“Comparison of serological and molecular(PCR-SSP)techniques of HLA-DR typing in clinical laboratory routine”.AnnTransplant.1997;2(1):39-42)。1991年第11届国际HLA专题讨论上提出了HLA的DNA分型方法,随着测序技术的突飞猛进,基于DNA序列的分型方法已经取代了传统的血清学及细胞学分型方法。目前DNA分型方法主要分为两种:基于核酸序列识别的方法和基于序列分子构型的方法。基于核酸序列识别的方法主要有:PCR-RFLP、PCR-SSO、PCR-SSP和PCR-SBT(AnniaF,et.al.“Overview on HLA and DNA typing method”.BiotecnologíaAplicada 2005;22:91-101)。其中PCR-SBT测序方法是现世界卫生组织(WHO)推荐的HLA分型方法的“金标准”。
无论是以上哪种分型技术均依赖于HLA数据库,即IMGT/HLA数据库。HLA新基因型的发现就是一种直接丰富HLA数据库的手段,这种发现有助于提高造血干细胞移植配型的成功率和精确度。
IMGT/HLA数据库从1998年12月份第一个版本(V1.0)中的964个基因型已经被丰富到2016年10月第72个版本(V3.26)中的15819个基因型。
目前HLA新基因型的发现,主要依赖于实验技术,即PCR和Sanger测序,3730峰图分型。现有技术需要对两条单体型分别进行检测,检测耗时长,效率低。
发明内容
本申请提供一组用于HLA分型的基因型序列,包括SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列。
进一步地,还包括SEQ ID NO:2-10所示的核苷酸序列中的至少一个。
进一步地,还包括SEQ ID NO:2-10所示的核苷酸序列中的至少两个。
进一步地,还包括SEQ ID NO:2-10所示的核苷酸序列中的至少三个。
进一步地,还包括SEQ ID NO:2-10所示的核苷酸序列中的至少四个。
进一步地,还包括SEQ ID NO:2-10所示的核苷酸序列中的至少五个。
进一步地,还包括SEQ ID NO:2-10所示的核苷酸序列中的至少六个。
进一步地,还包括SEQ ID NO:2-10所示的核苷酸序列中的至少七个。
进一步地,还包括SEQ ID NO:2-10所示的核苷酸序列中的至少八个。
进一步地,还包括SEQ ID NO:2-10所示的核苷酸序列中的全部。
本发明的用于HLA分型的基因型序列,丰富了HLA数据库,可以有效提高分型精度,从而提高相关疾病的治疗效率,如地中海贫血治疗、急性白血病、骨髓移植等。
附图说明
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