[发明专利]一种用于鉴定番茄萼片形态的SSR分子标记、引物及应用

说明书

本发明公开了一种鉴定番茄萼片形态的SSR分子标记引物，为：正向引物：TGGAAAGAAGCAGTAGCATTG；反向引物：CAACGAACATCCTCCGTTCT。同时本发明还公开了SSR分子标记及鉴定番茄萼片形态的方法。该SSR分子标记适用于番茄外观形态种质资源的遗传评价、种质鉴定及分子标记辅助育种研究，重复性好、可靠性高。为培育出新型外观形态的番茄新品种提供行之有效的鉴定方法，从而增加鲜食番茄外观多样性及美观度，同时本发明为番茄外观形态种质资源的遗传评价提供新的依据。

技术领域

本发明属于分子生物学技术领域，具体涉及一种用于鉴定番茄萼片形态的SSR分子标记、引物及应用。

背景技术

番茄是目前世界上栽培和消费最广泛的蔬菜作物，萼片是番茄花和果实的重要组成部分，也是重要的商品品质之一。健康平整的萼片不仅能够体现出果实的新鲜度、增加其美观度，而且在贮运过程中平展的萼片有助于减少果实在运输过程中的机械损伤，从而保证其良好的外观品质、增加其商品价值，所以萼片形态特征的研究显得尤为重要。

一般番茄萼片形态有基平、上翘、直立、上卷四种类型，我们发现了一种新的番茄萼片包被形态，该形态进一步提升了番茄的商品品质。但番茄萼片包被形态的遗传规律还不是很清楚，控制形态基因的遗传定位也有待深入研究。SSR分子标记技术是研究植物分子遗传水平差异的一项重要技术，根据PCR扩增产物的条带数、片段大小可以找到有差异的基因组EST。

但是，并没有相关文献报道用于鉴定番茄萼片形态的SSR分子标记。

发明内容

本发明提供的一种用于鉴定番茄萼片形态的SSR分子标记、引物及应用，适用于番茄外观形态种质资源的遗传评价、种质鉴定及分子标记辅助育种研究，重复性好、可靠性高。

本发明提供了一种用于鉴定番茄萼片形态的SSR分子标记引物，所述SSR分子标记引物的序列如下：

正向引物：5’-TGGAAAGAAGCAGTAGCATTG-3’；

反向引物：5’-CAACGAACATCCTCCGTTCT-3’。

本发明还提供了一种利用上述SSR分子标记引物扩增得到的用于鉴定番茄萼片形态的SSR分子标记，所述SSR分子标记为SEQ ID NO.3核苷酸序列和SEQ ID NO.4所示的核苷酸序列，其中SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列是：5’-TGGAAAGAAGCAGTAGGCATTGTAAAGAAGAAACATCTAGATATACTCTAGAATAACTAAAACCCTGTTTTCTCTTTCCTTTTTTCTTCTTCTTCTTCTCTCTCTCTACTGTTCCGTCGTCTGCTCATTTTTATCTTTCAGTATGAGTAAGGAGAAAGAACGGAGGATGTTCGTTG-3’；

SEQ ID NO.4所示的核苷酸序列是：

5’-TGGAAAGAAGCAGTAGGCATTGTAAAGAAGAAACATCTAGATATACTCTAGAATAACTAAAACCCTGTTTTCTCTTTCCTTTTTTCTTCTTCTTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACTGTTCCGTCGTCTGCTCATTTTTATCTTTCAGTATGAGTAAGGAGAAAGAACGGAGGATGTTCGTTG-3’。

本发明的还提供了上述用于鉴定番茄萼片形态的SSR分子标记引物在番茄分子标记辅助选择中的应用。

本发明的还提供了上述用于鉴定番茄萼片形态的SSR分子标记在番茄分子标记辅助选择中的应用

本发明的还提供了一种应用上述SSR分子标记引物鉴定番茄萼片形态的方法，包括以下步骤：

步骤1，提取待检测番茄材料的基因组DNA；

步骤2，PCR扩增：