[发明专利]一种金黄色葡萄球菌的检测方法及检测试剂盒有效
申请号: | 201710160845.0 | 申请日: | 2017-03-17 |
公开(公告)号: | CN106868157B | 公开(公告)日: | 2019-08-27 |
发明(设计)人: | 陈俊华;李芳柏;王荣萍;陈曼佳 | 申请(专利权)人: | 广东省生态环境技术研究所 |
主分类号: | C12Q1/6834 | 分类号: | C12Q1/6834;C12Q1/14 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 许飞 |
地址: | 510650 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 金黄色 葡萄球菌 检测 方法 试剂盒 | ||
1.一种金黄色葡萄球菌的检测试剂盒,其特征在于,包括杂交缓冲液、识别双链切割单链的核酸内切酶、猝灭荧光的纳米颗粒和下列核酸序列:
核酸序列H1:依次具有A、B、C区域,其中A区域为金黄色葡萄球菌的核酸适体,C与A部分互补形成茎环结构的茎部分,A与C不互补的序列凸起于茎环结构外侧,B构成茎环结构的环部分,B中包含一段与H2的核酸内切酶识别位点互补配对的核酸序列;
核酸序列H2:具有茎环结构,H2的一端修饰基团,固定在能猝灭荧光的纳米颗粒上,另一端修饰相应的荧光基团;H2的环结构上包含有一段核酸内切酶的识别位点序列,与H1的B区域的相应序列互补。
2.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于:H1的A区域的核酸序列为5'-GCGCCCTCTCACGTGGCACTCAGAGTGCCGGAAGTTCTGCGTTAT-3'。
3.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于:核酸内切酶选自Nt.BbvCI、Bmtl、BseYI 、BstUI 。
4.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于:当核酸内切酶为Nt.BbvCI时,H2的环结构上包含有一段5'-CCTCAGC-3'的核酸内切酶识别位点序列,H1的B区域中包含一段与之互补的5'-GCTGAGG-3'序列。
5.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于:当核酸内切酶为Bmtl时,H2的环结构上包含有一段5'-GCTAGC-3'核酸内切酶识别位点序列,H1的B区域中包含一段与之互补的5'-GCTAGC-3'序列。
6.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于:能猝灭荧光的纳米颗粒包括金纳米颗粒、石墨烯纳米颗粒、碳纳米管、银纳米颗粒,所述作为固定材料的纳米颗粒直接与H2的修饰基团结合,或是通过纳米颗粒上修饰对应的基团与H2的修饰基团结合。
7.根据权利要求6所述的检测试剂盒,其特征在于:H2的一端修饰巯基,固定在金纳米颗粒上;或H2的一端修饰羟基,固定在修饰了羧基的纳米颗粒上;或H2的一端修饰了生物素,固定在修饰了SA的纳米颗粒上。
8.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于:荧光基团为FAM、Cy3、Cy5。
9.根据权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于:所述检测试剂盒包括核酸内切酶Nt.BbvCI和下列核酸序列:
核酸序列H1:
5'-GCGCCCTCTCACGTGGCACTCAGAGTGCCGGAAGTTCTGCGTTAT-GTGCTGAGGAT-ATAACGCA-3';
核酸序列H2: 5'-GCTACGTGATCCTCAGCACACCGTAGC-3'。
10.一种金黄色葡萄球菌的检测方法,所述检测方法不用于诊断目的,其特征在于,包括下列步骤:
(1)先用杂交缓冲液分别溶解核酸H1和H2,1μM的H2固定在纳米颗粒表面;
(2)在500 nM的H1中加入待测溶液,充分混匀,室温反应30分钟;然后加入到步骤(1)中的H2溶液中,充分混匀,室温反应30分钟;
(3)加入25 U的识别双链切割单链的核酸内切酶,充分混匀,室温反应90分钟;12000rpm离心后保留上清,用于荧光检测,激发峰为495 nm,发射峰为525 nm;根据荧光发射光强度与金黄色葡萄球菌浓度呈正相关来判断结果;
其中,杂交缓冲液、识别双链切割单链的核酸内切酶和核酸序列H1和H2如权利要求1~9任一项所述。
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