[发明专利]一种CYP2C19基因*2、*3、*17位点多态性检测试剂盒在审
申请号: | 201710160439.4 | 申请日: | 2017-03-17 |
公开(公告)号: | CN106854680A | 公开(公告)日: | 2017-06-16 |
发明(设计)人: | 龚戬;夏懿;杨志军;王家敏;肖君华;周宇荀;李凯 | 申请(专利权)人: | 上海星耀医学科技发展有限公司;上海翼和应用生物技术有限公司;东华大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 201315 上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 cyp2c19 基因 17 多态性 检测 试剂盒 | ||
1.一种CYP2C19基因*2、*3、*17位点的多态性检测试剂盒,其特征在于:该试剂盒包括:PCR缓冲液,DNA聚合酶,LDR缓冲液,DNA连接酶,阳性对照,阴性对照。
2.如权利要求1所述的一种CYP2C19基因*2、*3、*17位点的多态性检测试剂盒,其特征在于:
用于扩增CYP2C19基因*17位点的上游引物序列为:
5’- GCAGTGATGGAGAAGG -3’( SEQ ID No.1);
用于扩增CYP2C19基因*17位点的下游引物序列为:
5’- TCAAATGGGAAAAGGG -3’( SEQ ID No.2);
用于扩增CYP2C19基因*3位点的上游引物序列为:
5’- ATCCCACTTTCATC -3’( SEQ ID No.3);
用于扩增CYP2C19基因*3位点的下游引物序列为:
5’- AACTTTGCCATCTT -3’( SEQ ID No.4);
用于扩增CYP2C19基因*2位点的上游引物序列为:
5’- TAAAAATTTCCCCATC -3’( SEQ ID No.5);
用于扩增CYP2C19基因*2位点的下游引物序列为:
5’- TCAATAAAGTCCCGAG -3’( SEQ ID No.6);
用于检测CYP2C19基因*17位点的三条探针序列分别为:
5’- CTTTGAGAACAGAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-3’ ( SEQ ID No.7),5’端磷酸化,3’端标记FAM荧光基团;
5’- TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATCTCTTACATCAGAGATG -3’ ( SEQ ID No.8);
5’- TTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTATCTCTTACATCAGAGATA -3’ ( SEQ ID No.9);
用于检测CYP2C19基因*3位点的三条探针序列分别为:
5’- CAGGGGGTGCTTACAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT -3’ ( SEQ ID No.10),5’端磷酸化,3’端标记FAM荧光基团;
5’- TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAACTTGGCCTTACCTGGATT -3’ ( SEQ ID No.11);
5’- TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAACTTGGCCTTACCTGGATC -3’ ( SEQ ID No.12);
用于检测CYP2C19基因*2位点的三条探针序列分别为:
5’- GGGAAATAATCAATGATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT -3’ ( SEQ ID No.13),5’端磷酸化,3’端标记FAM荧光基团;
5’- TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTATGGGTTCCT -3’ ( SEQ ID No.14);
5’- TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTATGGGTTCCC -3’ ( SEQ ID No.15);
用于检测内参的两条探针序列分别为:
5’- GAATATATACCAYATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-3’ ( SEQ ID No.16),5’端磷酸化,3’端标记FAM荧光基团;
5’- TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCAAACMTTAGTTATTCT -3’ ( SEQ ID No.17);
引物、探针序列也可以是上述序列向前或向后延伸10~20个核苷酸的序列,或者和上述序列同源性大于85%以上。
3.如权利要求1所述的一种CYP2C19基因*2、*3、*17位点的多态性检测试剂盒,其特征在于:所述用于扩增靶基因的上下游引物使用浓度为5-20pmol,优选扩增靶基因的上下游引物使用浓度为8pmol;所述用于检测靶基因的探针使用浓度为0.5-5pmol,优选检测靶基因的探针使用浓度为1pmol;所述用于检测内参的探针使用浓度为0.5-5pmol,优选检测内参的探针使用浓度为1pmol。
4.如权利要求1所述的一种CYP2C19基因*2、*3、*17位点的多态性检测试剂盒,其特征在于:试剂盒每个测试分别取24µl PCR缓冲液,3µl DNA聚合酶,7.5µl LDR缓冲液,0.5µl DNA连接酶,由此组成的反应体系中含有10mM Tris-HCl(PH8.3),4-10mM MgSO4,0.2mM dNTPs,8pmol扩增靶基因的上下游引物,1pmol检测靶基因的探针,1pmol检测内参的探针,1-5U DNA聚合酶,0.1U-5U UDG酶,1-5U DNA聚合酶。
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