[发明专利]与苎麻纤维细度相关联的SSR标记及应用

说明书

技术领域：

本发明涉及农业生产领域的苎麻相关联的SSR标记及应用，具体涉及一种与苎麻纤维细度相关联的SSR标记及应用。

背景技术：

苎麻是具有中国特色的天然纺织原料。苎麻纤维具有拉力强,富弹性,耐水湿,耐热力大,富绝缘性等特性。并且苎麻纤维吸湿散湿快,透气性好,可作为优良纺织原料，广泛用于服装制作、装饰用品和产业用纺织品等。另外，苎麻也可作为饲料作物种植。在我国南方, 由于夏季高温高湿, 苜蓿等北方牧草生长潜力受限。苎麻的生态适应性强，不仅可正常生长，还能获得较高的生物产量；且叶蛋白含量高，富含多种维生素和氨基酸，营养丰富，可以和苜蓿相媲美。有研究结果表明，苎麻叶蛋白含量和产量均高于杂交象草和多年生黑麦草等南方主要牧草。因此，苎麻除作为传统的纤维原料作物外，目前其作为我国南方地区的新型蛋白牧草资源已得到广泛认可，现有技术中已有育成了中饲苎、湘饲苎等系列品种。在家禽、牲畜、水产养殖方面，作为饲料或纤饲兼用作物具有良好的发展前景。

纤维细度是评定苎麻纤维等级、纤维质量及纺织利用价值的关键性指标。由于纤维细度和产量负相关，高细度品种其产量构成因素整体较低。现有苎麻品种纤维质量难以满足纺织高支、细薄产品的要求，主要原因是缺乏高细度，2500支以上的品种。蛋白质含量是许多作物重要的营养品质性状。研究表明，蛋白质含量是一个复杂的数量性状，受多基因控制。对于苎麻而言，叶片蛋白质或叫叶蛋白质含量是重要的饲用营养品质指标。有研究表明，不同苎麻品种之间叶蛋白含量差异显著，含量低的不及含量高的50%，且呈连续性变异。因此，如何来培育纤维细度高的品种是苎麻育种的现实要求，是苎麻产业经济发展瓶颈制约的重大突破，也是苎麻资源优势转变为经济优势的关键所在。

常规的育种方法是借助表型及育种家经验对作物的重要农艺性状进行选育, 其效率低, 周期长；而基于基因型选择和高效准确的分子辅助技术, 开启了作物育种的新方向。将分子标记技术用于作物重要农艺性状的辅助选择或者鉴定可大大缩短育种时间和提高选择效率。分子标记在苎麻上主要集中在分子标记开发（Chen et al.2011; Liu et al. 2013; Chen et al.2015)、种质资源的遗传多样性分析（揭雨成等，2002；郭安平等，2003；Liu et al. 2008；Luan et al. 2015b）、分子身份证构建（王晓飞等，2010；Luan et al. 2015a）、遗传连锁图谱构建（邹自征，2012；栾明宝等，2013；Liu et al. 2014）及QTL定位（Liu et al. 2014）。Chen et al.（2015）通过转录组开发了52个可能与纤维品质相关的SSR分子标记。但是到目前从事发掘纤维细度和叶片蛋白质含量分子标记的研究还鲜有报道。

现代育种有必要利用植物遗传多样性平台，并结合最新的基因组技术来发现新基因或等位基因，用于性状的改良。利用目标数量性状连锁分子标记，通过分子标记辅助选择，可有效提高数量性状的遗传改良进程。关联分析(Association analysis)是在植物数量性状研究和植物育种中应用的一种较新的分析方法。它以连锁不平衡为基础鉴定某一群体内性状与遗传标记或候选基因间的关系。与重组群体比较, 它的显著优点是高通量, 即能在全基因组范围有效地检测大量的具有不同遗传背景的种质资源材料的性状控制基因位点或区域; 除高通量外, GWAS 采用遗传背景丰富的自然群体为材料,不需要花多年时间构建特定的分离群体, 具有作图定位精度高、可达到单基因的水平。目前全基因组关联分析已经成功应用于玉米、水稻、拟南芥，油菜、大麦等重要作物。

如何来利用苎麻的自然群体为材料，利用具有多态性的SSR分子标记，分析其遗传多样性、群体结构等；同时对其纤维细度和SSR分子标记进行关联分析，开发并发掘与其相关的SSR 位点，从而为苎麻纤维细度性状的QTL定位及其改良等研究提供科学依据；并应用于苎麻新品种育种方面。

发明内容：

本发明提供一种与苎麻纤维细度相关联的SSR标记及应用，其是利用上百份的苎麻自然群体为材料，利用多态性的若干的SSR分子标记，分析苎麻遗传多样性及群体结构，从而对其纤维细度和SSR分子标记进行关联分析，并应用于苎麻的品种改良。

本发明目的之一是提供一种与苎麻纤维细度相关联的SSR标记，包括与苎麻纤维细度相关联的SSR标记R74。

所述的一种与苎麻纤维细度相关联的SSR标记，其优选是还包括与苎麻纤维细度相关联的SSR标记R51、R90。