[发明专利]一种获取胎儿游离DNA浓度的方法有效
申请号: | 201710140534.8 | 申请日: | 2017-03-08 |
公开(公告)号: | CN107133491B | 公开(公告)日: | 2020-05-29 |
发明(设计)人: | 梁志坤;吴英松;杨学习;李明;胡天亮;欧阳国军;翁荣涛 | 申请(专利权)人: | 广州市达瑞生物技术股份有限公司 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 禹小明;凌衍芬 |
地址: | 510665 广东省广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 获取 胎儿 游离 dna 浓度 方法 | ||
1.一种获取胎儿游离DNA浓度的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1:获取母血游离DNA,并统计游离DNA片段长度;
S2:将统计游离DNA片段长度输入到高斯混合模型,采用拥有K个正态分布的高斯混合模型,对母体和胎儿的游离DNA进行量化,获取K个波峰和对应的分布范围,得到胎儿游离DNA的浓度;
所述高斯混合模型表示为:
其中,K为正整数,N(x|μi,σi)为正态分布,μi表示期望,σi表示方差,样本x以πi的概率隶属于正态分布N(x|μi,σi);
步骤S2中,具体步骤包括:
S21:计算样本xj发生的概率p(xj),其中j=1…n,n为正整数,p(xj)的公式为:
其中
S22:则样本xj存在,第k(k=1,2,…,K)个正态分布发生的概率为:
S23:目标函数为:通过最大似然法求得属于母体和胎儿的游离DNA片段数量:
更新参数:
S24:返回步骤S21,循环直到实现最大化结束;
S3:通过搜索比对正态分布的期望的大小,从K个正态分布分布中找出属于母体和胎儿的分布,得到对应的属于母体和胎儿的游离DNA片段数量Ni,其中i表示1到K中属于母体和胎儿的编号;
S4:与已知确定的胎儿游离DNA浓度进行三维线性拟合,得到三维线性拟合的系数,对测得的胎儿游离DNA浓度进行优化并输出结果。
2.根据权利要求1所述的获取胎儿游离DNA浓度的方法,其特征在于,取K的值为:K=5。
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