[发明专利]一种针对亚洲乳腺癌21基因检测方法在审

专利信息
申请号: 201710140287.1 申请日: 2017-03-10
公开(公告)号: CN108570492A 公开(公告)日: 2018-09-25
发明(设计)人: 刘雷;侯文洪;魏卫卫;徐峰 申请(专利权)人: 上海美迪维康生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6851 分类号: C12Q1/6851;C12Q1/6886
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 200135 上海市浦东新区*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 基因检测 乳腺癌 基因 实时荧光定量PCR 生物技术领域 癌症组织 技术检测 目的基因 医疗样本 运算公式 表达量 冰冻的 样本 采集 新鲜 评估
【说明书】:

发明涉及生物技术领域,特别涉及一种针对亚洲乳腺癌21基因检测方法。本发明中首先以标准的医疗样本采集流程收集冰冻的新鲜癌症组织样本,对选取目的基因共21个基因进行实时荧光定量PCR技术检测基因的表达量数值,根据这些数值以不同种类基因编好的运算公式进行风险值的计算,并进行评估。本发明能够提供一种更为精确的针对亚洲乳腺癌21基因检测方法。

技术领域

本发明涉及生物领域,特别涉及一种针对亚洲乳腺癌21基因检测方法。

背景技术

乳腺癌是一种常见的女性恶性肿瘤,严重威胁女性身心健康。统计数据表明,乳腺癌每年造成45.8万人死亡,其发病率在世界范围内呈上升趋势。近年来中国的乳腺癌发病率在迅速上升,并有年轻化的趋势。乳腺癌成为了中国女性最常见的癌症,中国每年乳腺癌新发数量和死亡数量分别占全世界的12.2%和9.6%。据统计,美国乳腺癌五年生存率是89%,中国乳腺癌患者五年生存率是73.1%。随着人们对肿瘤早诊意识的觉醒,尤其是在40岁以上的女性人群中大力推广乳腺癌筛查,大量的I,II期乳腺癌能够在肿块小于5cm,腋下淋巴结为阴性被检出。这类病人的预后较好,经术前辅助治疗,手术切除或放化疗之后,5年生存率得到大幅提升。

乳腺癌的治疗主要通过手术和化疗或者放疗。常规的治疗是手术尽量切除肿瘤病灶。但是,并不是所有的乳腺癌患者都需要接受化疗,化疗对于某些乳腺癌患者效益并不明显。研究表明,有将近一半的病人承受了额外的化疗之苦。

目前临床上仍是以肿瘤病人的临床病理特征来作为主要标准区分不同预后的患者,例如肿瘤越大,数目越多,则认为病人越需要化疗,已经出现腋下淋巴结转移的病人比没有转移的病人更需要化疗,相应的有在线平台Adjuvant。然而,这种分类方法相对比较粗放,临床实践过程中也发现该种分类准确性有限,有相当一部分被认为是低复发风险的患者后期也出现了复发转移。在这种情况下,急需一种更精确的针对亚洲乳腺癌21基因检测方法。

发明内容

鉴于以上问题,本发明提供了一种精确的针对亚洲乳腺癌21基因检测方法。

为了实现上述发明目的,本发明提供以下技术方案,本发明中的乳腺癌21基因检测方法,包括如下步骤:

S1:样本采集

以标准的医疗样本采集流程收集冰冻的新鲜癌症组织样本;

S2:实时荧光定量PCR技术检测基因的表达量数值

选取目的基因共21个基因,包括16个肿瘤相关基因和5个参考基因,其中肿瘤相关基因包括:HER2相关基因有GRB7、ERBB2,雌激素相关基因有ESR1、PGR、BCL2、SCUBE2,增殖相关基因有BIRC5、MKI67、CCNB1、MYBL2、AURKA,侵袭相关基因有MMP11、CTSL2,还包括GSTM1、CD68、BAG1,对所选目的基因按照操作手册依次进行cDNA合成和实时荧光定量PCR,获得21基因表达量数值;

S3:风险值的计算

首先对基因表达值标准化处理,使基因表达值在0到15之间,其计算公式为:

genex=(xi-Mingene)*15/(Maxgene-Mingene)

genex表示标准化后到值,xi表示实验测出来的表达值,Mingene是此基因在已有患者中的最小表达值,Maxgene是此基因在已有患者中的最大表达值。

根据上述步骤计算复发风险值,计算各组别算法如下:

HER2分组值=0.9*GRB7+0.1*HER2;如果结果小于8,把分值设为8。

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