[发明专利]一种同时检测五种致病菌的引物探针组合物及多重实时荧光PCR方法有效
申请号: | 201710136218.3 | 申请日: | 2017-03-08 |
公开(公告)号: | CN106811535B | 公开(公告)日: | 2020-01-14 |
发明(设计)人: | 张鹏;宋智斌;王萌竹;官宁;张加美 | 申请(专利权)人: | 山东众合天成检验有限公司 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6851;C12Q1/14;C12Q1/10;C12Q1/04;C12R1/42;C12R1/63;C12R1/445;C12R1/01 |
代理公司: | 37241 青岛中天汇智知识产权代理有限公司 | 代理人: | 赵翠 |
地址: | 266000 山东省青岛市*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 同时 检测 致病菌 引物 探针 组合 多重 实时 荧光 pcr 方法 | ||
1.一种同时检测五种致病菌的引物探针组合物,其特征在于,包括序列表中SEQ IDNo.1-15的序列,其中SEQ ID No.1、2、4、5、7、8、10、11、13、14分别为引物序列invA-F、invA-R、vvhA-F、vvhA-R、ipaH-F、ipaH-R、nuc-F、nuc-R、prfA-F、prfA-R,SEQ ID No.3、6、9、12、15分别为探针序列invA-P、vvhA-P、ipaH-P、nuc-P、prfA-P;所述各探针序列的5’端均修饰有报告基团,3’端均修饰有淬灭基团;所述报告基团有:FAM、FITC、HEX、JOE、CY3,淬灭基团有:TAMRA,BHQ、Eclipse;所述五种致病菌为沙门氏菌、创伤弧菌、志贺氏菌、金黄色葡萄球菌和单增李斯特菌。
2.根据权利要求1所述的同时检测五种致病菌的引物探针组合物,其特征在于,所述SEQ IDNo.1-15的序列,应用于荧光定量PCR反应中,反应体系中各序列的用量为invA-F0.6μM、invA-R 0.6μM、invA-P 0.3μM、vvhA-F 0.4μM、vvhA-R 0.4μM、vvhA-P 0.3μM、ipaH-F0.6μM、ipaH-R 0.6μM、ipaH-P 0.7μM、nuc-F 0.4μM、nuc-R 0.4μM、nuc-P 0.3μM、prfA-F0.3μM、prfA-R 0.3μM、prfA-P 0.4μM。
3.一种同时检测五种致病菌的多重实时荧光PCR方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)、提取待检食品样本的基因组DNA,备用;
(2)、将提取的基因组DNA作为模板加入到五重实时荧光定量PCR反应体系中,所述反应体系为:Taq酶1-4U、Mg2+5mM、dNTP 300μM、pH8.3的Tris-HCl 100mM、KCl 500mM、invA-F 0.6μM、invA-R 0.6μM、invA-P 0.3μM、vvhA-F 0.4μM、vvhA-R 0.4μM、vvhA-P 0.3μM、ipaH-F0.6μM、ipaH-R 0.6μM、ipaH-P 0.7μM、nuc-F 0.4μM、nuc-R 0.4μM、nuc-P 0.3μM、prfA-F0.3μM、prfA-R 0.3μM、prfA-P 0.4μM、模板100-200ng,补水至25μL;
(3)、将反应体系放置于荧光定量PCR仪中,反应程序为95℃25s→95℃3s,60℃25-60s,40个循环;收集PCR扩增过程中的荧光信号,若待测样本中某基因的Ct值小于36,则判断该样本含拥有该基因的致病菌;若待测样本中某基因的Ct值大于等于36,则判断该样本不含有拥有该基因的致病菌。
4.一种同时检测五种致病菌的试剂盒,其特征在于,主要包括荧光定量2×PCR mix,所述2×PCR mix包含以下组份:Taq酶2-8U、Mg2+10mM、dNTP 600μM、pH8.3的Tris-HCl 200mM、KCl 1000mM、invA-F 1.2μM、invA-R 1.2μM、invA-P 0.6μM、vvhA-F 0.8μM、vvhA-R 0.8μM、vvhA-P 0.6μM、ipaH-F 1.2μM、ipaH-R 1.2μM、ipaH-P 1.4μM、nuc-F 0.8μM、nuc-R 0.8μM、nuc-P 0.6μM、prfA-F 0.6μM、prfA-R 0.6μM、prfA-P 0.8μM。
5.根据权利要求4所述的同时检测五种致病菌的试剂盒,其特征在于,其使用方法为:吸取PCR mix 12.5μL,加入100-200ng DNA模板,补水至25μL组成PCR反应体系。
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