[发明专利]灰霉病菌对QoIs杀菌剂抗性风险的快速评定方法在审
| 申请号: | 201710122876.7 | 申请日: | 2017-03-03 |
| 公开(公告)号: | CN106755538A | 公开(公告)日: | 2017-05-31 |
| 发明(设计)人: | 张传清;胡小然;时浩杰;戴德江 | 申请(专利权)人: | 浙江农林大学 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645 |
| 代理公司: | 杭州中成专利事务所有限公司33212 | 代理人: | 金祺 |
| 地址: | 311300 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 病菌 qois 杀菌剂 抗性 风险 快速 评定 方法 | ||
1.用于检测含有BCbi143/144内含子的灰霉病菌的环介导等温扩增引物,其特征在于:LAMP引物组合物由以下4条引物组成:
F3:CCTAATCAAATGGCTAAACGTATT;
TB3:CGTACAGTAACCATGGGATA;
FIP:TGAGAATCACCTAAGAGTGAACCATGCTTTTAAACGAATAGGACCG;
BIP:CCGATTACATGGAAACGGAACTCAAAAGTCATGCAGTCACAAT。
2.用于检测含有BCbi143/144内含子的灰霉病菌的环介导等温扩增试剂盒,其特征在于:包含如权利要求1所述的LAMP引物组合物。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:LAMP引物组合物的浓度为:1.6μM的正内向引物FIP,1.6μM的反向内引物BIP、0.2μM正向外引物F3、0.2μM反向外引物B3。
4.根据权利要求2或3所述的试剂盒,其特征在于:试剂盒还包含:10×ThermoPol Buffer、dNTPs、MgCl2、甜菜碱、羟基萘酚蓝、8U/μL Bst DNA聚合酶、ddH2O。
5.用于检测含有BCbi143/144内含子的灰霉病菌的环介导等温扩增方法,其特征在于:25μL反应体系由以下成分组成:8U/μL Bst DNA聚合酶0.5μL、10×ThermoPol Buffer 2.5μL、20μM FIP 2.0μL、20μM BIP 2.0μL、10μM F3 0.5μL、10μM B3 0.5μL、25mM MgCl2 5.0μL、10mM dNTPs 2.5μL、5M甜菜碱4.0μL、3.75mM羟基萘酚蓝1μL、DNA模板1μL,ddH2O补足至25μL。
6.根据权利要求5所述的环介导等温扩增方法,其特征在于:
利用所述25μL检测反应体系进行LAMP扩增反应,扩增结果的分析和判定方法为选择以下任一:
方法一、先在扩增前加入染料羟基萘酚蓝作为反应指示剂,以羟基萘酚蓝的颜色变化做为结果判定标准,然后进行LAMP扩增反应,反应结束后,颜色发生变化,即显色结果为天蓝色判断为阳性,即显示检测到含有BCbi143/144内含子的灰霉病菌;颜色没有发生变化,显色结果仍为蓝紫色判断为阴性,即显示样品无含有BCbi143/144内含子的灰霉病菌,或所含有BCbi143/144内含子的灰霉病菌含量未达检测限;
方法二、取5μL扩增产物,用2%琼脂糖凝胶电泳检测,如果出现梯形条带判断为阳性,即显示检测到含有BCbi143/144内含子的灰霉病菌;无扩增条带则判断为阴性,即显示无含有BCbi143/144内含子的灰霉病菌,或所含的有BCbi143/144内含子的灰霉病菌未达检测限。
7.根据权利要求6所述的环介导等温扩增方法,其特征在于LAMP扩增反应程序为:65℃扩增60min;80℃灭活10min。
8.根据权利要求7所述的环介导等温扩增方法,其特征在于:所述方法一、方法二中的检测限DNA浓度为1pg/μL。
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