[发明专利]一种预测阿德福韦酯治疗反应性建模的方法及装置

权利要求书

1.一种预测阿德福韦酯治疗反应性建模的方法，其特征在于，该方法包括：

处理采集样本的HBV慢性感染病人的血清样本，获取所述采集样本的RT区基因序列信息；

基于所述采集样本的RT区基因序列信息，建立初步的预测模型，采用三折交叉验证循环获取多个所述初步的预测模型，用所述初步的预测模型预测出的HBV DNA滴度与实际观测值进行比较，选取二者差异最小的模型作为最优模型，获得预测模型；

通过采集到的进行ADV治疗的病人的血清样本作为验证样本，对所述预测模型进行验证。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述处理采集样本的HBV慢性感染病人的血清样本，获取所述采集样本的RT区基因序列信息，包括：

采集HBV慢性感染病人的血清样本，得到采集样本；

对所述采集样本分别进行HBV DNA提取，获得与所述采集样本相对应的HBV DNA，并配置成HBV DNA溶液；

利用所述HBV DNA溶液作为模版对目标DNA进行PCR扩增，将得到的PCR扩增产物进行454测序，获得扩增后的DNA序列；

根据NCBI来源的参考序列，对所述扩增后的DNA序列进行数据处理，将得到的有效序列还原到所述每个样本中，并提取所述采集样本的RT区基因序列信息。

3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述基于所述采集样本的RT区基因序列信息，建立初步的预测模型，采用三折交叉验证循环获取多个所述初步的预测模型，用所述初步的预测模型预测出的HBV DNA滴度与实际观测值进行比较，选取二者差异最小的模型作为最优模型，获得预测模型，包括：

统计所述采集样本HBV RT区位点上各个碱基的准种频率、位点频率和位点香农熵指标，筛选获取影响指标，利用弹性净回归的方法建立初步的预测模型，并预测终点HBV DNA滴度；

采用三折交叉验证循环获取多个初步的预测模型，用所述初步的预测模型预测出的HBV DNA滴度与实际观测值进行比较，选取二者差异最小的模型作为最优模型，获得预测模型。

4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述采用三折交叉验证循环获取多个初步的预测模型，用所述初步的预测模型预测出的HBV DNA滴度与实际观测值进行比较，选取二者差异最小的模型作为最优模型，获得预测模型之后，包括：

通过所述最优模型，筛选出与ADV反应性相关的典型位点；

利用所述典型位点的碱基信息，构建预测ADV反应性的分类模型，对所述样本进行ADV反应性预测和分类。

5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述通过采集到的进行ADV治疗的病人的血清样本作为验证样本，对所述预测模型进行验证，包括：

采集进行ADV治疗病人的血清样本作为验证样本；

提取所述验证样本进行ADV治疗前后的两个时间点的HBV DNA，分别进行RT区克隆测试，获取对应的序列信息；

将所述序列信息带入到所述预测模型中，对所述预测模型进行验证。

6.一种预测阿德福韦酯治疗反应性建模的装置，其特征在于，该装置包括：

处理模块，用于处理采集样本的HBV慢性感染病人的血清样本，获取所述采集样本的RT区基因序列信息；

建立模块，用于基于所述采集样本的RT区基因序列信息，建立初步的预测模型，采用三折交叉验证循环获取多个所述初步的预测模型，用所述初步的预测模型预测出的HBV DNA滴度与实际观测值进行比较，选取二者差异最小的模型作为最优模型，获得预测模型；

验证模块，用于通过采集到的进行ADV治疗的病人的血清样本作为验证样本，对所述预测模型进行验证。

7.根据权利要求6所述的装置，其特征在于，所述处理模块包括：

采集单元，采集HBV慢性感染病人的血清样本，得到采集样本；

提取单元，对所述采集样本分别进行HBV DNA提取，获得与所述采集样本相对应的HBV DNA，并配置成HBV DNA溶液；

扩增单元，用于利用所述HBV DNA溶液作为模版对目标DNA进行PCR扩增，将得到的PCR扩增产物进行454测序，获得扩增后的DNA序列；

数据处理单元，用于根据NCBI来源的参考序列，对所述扩增后的DNA序列进行数据处理，将得到的有效序列还原到所述每个样本中，并提取所述采集样本的RT区基因序列信息。