[发明专利]新配杂交组合表型的预测方法在审
申请号: | 201710100968.5 | 申请日: | 2017-02-23 |
公开(公告)号: | CN108470112A | 公开(公告)日: | 2018-08-31 |
发明(设计)人: | 刘哲;封伟;刘玮;史梦莹;曲艺伟;李绍明;张晓东;朱德海 | 申请(专利权)人: | 中国农业大学 |
主分类号: | G06F19/20 | 分类号: | G06F19/20;A01H1/02 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王庆龙 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 杂交种 表型 指纹信息 自交系 表型预测 训练样本 杂交组合 差异度 基因型 配合力 组配 成功率 预测 历史测试 历史数据 目标区域 算法合成 指纹合成 预设 育种 环节 表现 | ||
本发明提供新配杂交组合表型的预测方法,包括:对所有自交系进行类群划分;计算划分后各群间的特殊配合力并根据特殊配合力或杂交种历史测试表现确定目标区域的杂优模式,确定参与组配的自交系;根据参与组配的自交系的指纹信息,通过预设指纹合成算法合成新配杂交种指纹信息;通过计算新配杂交种与训练样本中各已配杂交种指纹信息差异度,在训练样本中寻找新配杂交种的相似杂交种;根据新配杂交种与各相似杂交种的指纹信息差异度,对新配杂交种表型进行预测。能够提高表型预测各环节成功率,充分利用历史数据,从自交系表型、基因型和相似杂交种表型、基因型入手,寻找它们与新配杂交种表型的关系,从而提高表型预测准确性,最终提高育种成功率。
技术领域
本发明涉及玉米育种技术领域,尤其涉及一种新配杂交组合表型的预测方法。
背景技术
利用杂种优势进行玉米杂交组合设计需要先选择亲本进行杂交,然后再经过杂交种鉴定,筛选出强优势组合,此过程需耗费大量的人力、物力和时间成本,才能得到可靠的结果,因此有必要在杂交种鉴定之前预测杂交种表型,也迫切需要一种高效的预测杂交种表型的方法。
而且,每年进行杂交组合设计时,都要选配出数量巨大的杂交组合,但是由于玉米遗传的不确定性,优秀杂交种的比率即育种的成功率往往很低,如何提高杂交组合的成功率成为杂交组合设计成功与否的关键。
鉴于此,如何对新配杂交组合表型进行预测,提高表型预测的准确性,以最终提高杂交组合育种的成功率成为目前需要解决的技术问题。
发明内容
为解决上述的技术问题,本发明提供一种新配杂交组合表型的预测方法,能够提高表型预测各个环节的成功率,充分利用历史数据,从自交系表型、基因型和相似杂交种表型、基因型入手,寻找他们与新配杂交种表型的关系,从而提高表型预测的准确性,最终提高杂交组合育种成功率。
第一方面,本发明提供一种新配杂交组合表型的预测方法,包括:
对所有自交系进行类群划分;
计算类群划分后各群间的特殊配合力,并根据所述特殊配合力或杂交种历史测试表现确定目标区域的杂优模式,确定参与组配的自交系;
根据所述参与组配的自交系的指纹信息,通过预设指纹合成算法,合成新配杂交种的指纹信息;
通过计算所述新配杂交种与训练样本中各已配杂交种的指纹信息差异度,在训练样本中寻找所述新配杂交种的相似杂交种;
根据所述新配杂交种与其在训练样本中的各相似杂交种的指纹信息差异度,对所述新配杂交种的表型进行预测,获得新配杂交种的表型预测结果。
可选地,在所述获得新配杂交种的表型预测结果之后,所述方法还包括:
评价所述表型预测结果的可信度;
根据所述表型预测结果、所述表型预测结果的可信度和训练样本表型认知度,对所述新配杂交种的杂交组合进行评价筛选,确定最终组配方案。
可选地,所述评价所述表型预测结果的可信度,包括:
以训练样本中相似杂交种的权重均值,作为所述表型预测结果的可信度;
或者,
将所述表型预测结果作为已知值,将训练样本分为两部分,一部分作为验证样本,将所述验证样本作为新的训练样本,按照权利要求1所述方法,将获得的新配杂交种的第二表型预测结果,计算所述第二表型预测结果与所述已知值的相关系数,将所述相关系数作为所述表型预测结果的可信度。
可选地,所述对所有自交系进行类群划分,包括:
计算不同自交系的DNA指纹的差异度;
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