[发明专利]一种联合利用lncRNA及其靶基因筛选杨树生长性状的方法、试剂盒及应用

说明书

本发明提出了预测杨树生长性状的方法、杨树选育方法、用于预测杨树生长性状的试剂盒、用于预测杨树生长性状的设备、杨树选育系统以及预定位点的基因型在预测杨树生长性状中的用途。所述方法包括：(1)确定所述杨树下列预定位点的基因型：Lnc‑CK基因的第221位、Pto‑CKX6基因的第1490位和2153位；以及(2)基于所述预定位点的基因型，预测所述杨树的生长性状。利用本发明的方法能够预测出杨树的生长性状，选育出速生杨树，缩短育种周期。

技术领域

本发明涉及生物领域。具体地，本发明涉及一种联合利用lncRNA及其靶基因筛选杨树生长性状的方法、试剂盒及应用。更具体地，本发明涉及预测杨树生长性状的方法、杨树选育方法、用于预测杨树生长性状的试剂盒、用于预测杨树生长性状的设备、杨树选育系统以及预定位点的基因型在预测杨树生长性状中的用途。

背景技术

杨树是北半球地区广泛栽培的重要用材树种，具有广泛的工业与经济价值。并且杨树作为我国北方主要的造林及绿化树种，也具有非常重要的生态价值。随着杨树定向培育的发展，对杨树新品种也提出了相应要求。在杨树优良品种定向培育中，树高、胸径等生长指标，是杨树速生、丰产优异种质选育的主要考虑因素。随着现代育种技术的不断发展，分子标记辅助育种，即利用分子标记对育种材料进行选择，克服了传统杂交育种周期长、稳定性差等缺点，可以有效地提高育种效率。目前，通过对表型和基因型进行联合遗传学研究，利用功能性标记位点对林木优良种质资源进行选育，已经成为杨树新品种选育的另一重要途径。

由于林木生长周期长，杂合度高，基因组较为庞大且多数经济性状为复杂的数量性状，基于候选基因的SNP关联分析常被用来解析等位变异与表型性状之间的调控关系，以鉴定出与林木生长及材性相关的功能标记。

然而，目前利用功能SNP位点对杨树生长性状的选育方法仍有待开发。

发明内容

本发明旨在至少在一定程度上解决现有技术中存在的技术问题至少之一。

在本发明的一个方面，本发明提出了一种预测杨树生长性状的方法。根据本发明的实施例，所述方法包括：(1)确定所述杨树下列预定位点的基因型：Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位；以及(2)基于所述预定位点的基因型，预测所述杨树的生长性状，其中，所述Lnc-CK基因的第221位基因型为CC、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AC，是所述杨树的生长性状优的指示；所述Lnc-CK基因的第221位基因型为CG、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AA，是所述杨树的生长性状差的指示。发明人发现，Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位是与杨树生长性状显著关联的SNP位点，通过确定其基因型，能够预测出杨树的生长性状，选育出优质杨树，缩短育种周期。

根据本发明的实施例，所述预测杨树生长性状的方法还可以具有下列附加技术特征：

根据本发明的实施例，在步骤(1)中，确定所述预定位点的基因型是利用第一引物至第九引物进行的，其中，所述第一引物至第九引物分别具有SEQ ID NO：1～9所示的核苷酸序列。发明人发现，利用上述引物，能够确定Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位的基因型，从而预测出杨树的生长性状，选育出优质杨树，缩短育种周期。

根据本发明的实施例，所述生长性状包括胸径值。由此，根据本发明实施例的方法能够有效地预测出杨树的胸径值，选育出速生杨树，缩短育种周期。

根据本发明的实施例，所述杨树为毛白杨。由此，根据本发明实施例的方法能够有效地预测出毛白杨的生长性状，选育出优质毛白杨，缩短育种周期。