[发明专利]筛选杨树生长和木材品质性状的miRNAs及其靶基因内SNP位点及筛选方法有效
| 申请号： | 201710100533.0 | 申请日： | 2017-02-23 |
| 公开（公告）号： | CN108467899B | 公开（公告）日： | 2020-07-21 |
| 发明（设计）人： | 张德强;陈蓓蓓;陈金辉 | 申请（专利权）人： | 北京林业大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12M1/34 |
| 代理公司： | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人： | 赵天月 |
| 地址： | 100083 *** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 筛选 杨树 生长 木材 品质 性状 mirnas 及其 基因 snp 方法 | ||
1.一种预测杨树木材品质性状的方法，其特征在于，包括：
(1)确定所述杨树下列预定位点的基因型：Pto-miR167e基因的第536位、Pto-miR167g-5p基因的第456位以及Pto-TPS5基因的第1378位；以及
(2)基于所述预定位点的基因型，预测所述杨树的木材品质性状，
其中，所述Pto-miR167e基因的第536位基因型为TT、Pto-miR167g-5p基因的第456位基因型为GG和Pto-TPS5基因的第1378位基因型为AA，是所述杨树的木材品质性状优的指示；
所述Pto-miR167e基因的第536位基因型为TC、Pto-miR167g-5p基因的第456位基因型为CC和Pto-TPS5基因的第1378位基因型为GA，是所述杨树的木材品质性状差的指示；
所述Pto-TPS5基因具有SEQ ID NO.10所示的核苷酸序列，所述Pto-miR167e基因具有SEQ ID NO.11所示的核苷酸序列，所述Pto-miR167g-5p基因具有SEQ ID NO.12所示的核苷酸序列；
所述杨树为毛白杨；
所述品质性状为综纤维素含量。
2.一种杨树选育方法，其特征在于，包括：
(a)提供多个杨树候选株；
(b)根据权利要求1所述的方法，预测所述杨树候选株的木材品质性状；和
(c)基于步骤(b)的预测结果，选择并培育木材品质性状优的候选株。
3.一种用于预测杨树木材品质性状的设备，包括：
基因型确定单元，所述基因型确定单元用于确定所述杨树下列预定位点的基因型：Pto-miR167e基因的第536位、Pto-miR167g-5p基因的第456位以及Pto-TPS5基因的第1378位；以及
计算单元，所述计算单元与所述基因型确定单元相连，用于基于所述预定位点的基因型，预测所述杨树的木材品质性状，
其中，所述Pto-miR167e基因的第536位基因型为TT、Pto-miR167g-5p基因的第456位基因型为GG和Pto-TPS5基因的第1378位基因型为AA，是所述杨树的木材品质性状优的指示，
所述Pto-miR167e基因的第536位基因型为TC、Pto-miR167g-5p基因的第456位基因型为CC和Pto-TPS5基因的第1378位基因型为GA，是所述杨树的木材品质性状差的指示，
所述Pto-TPS5基因具有SEQ ID NO.10所示的核苷酸序列，所述Pto-miR167e基因具有SEQ ID NO.11所示的核苷酸序列，所述Pto-miR167g-5p基因具有SEQ ID NO.12所示的核苷酸序列；
所述杨树为毛白杨；
所述品质性状为综纤维素含量。
4.一种杨树选育系统，其特征在于，包括：
候选株获取设备，所述候选株获取设备用于提供多个杨树候选株；
性状预测设备，所述性状预测设备与所述候选株获取设备相连，所述性状预测设备为权利要求3所述的用于预测杨树木材品质性状的设备，并且用于预测所述杨树候选株的木材品质性状；和
培育设备，所述培育设备与所述性状预测设备相连，所述培育设备用于基于所述性状预测设备的预测结果，选择并培育木材品质性状优的候选株，
所述品质性状为综纤维素含量，
所述杨树为毛白杨。
5.预定位点的基因型在预测杨树木材品质性状中的用途，其特征在于，所述预定位点包括：Pto-miR167e基因的第536位、Pto-miR167g-5p基因的第456位以及Pto-TPS5基因的第1378位；
其中，所述Pto-miR167e基因的第536位基因型为TT、Pto-miR167g-5p基因的第456位基因型为GG和Pto-TPS5基因的第1378位基因型为AA，是所述杨树的木材品质性状优的指示，
所述Pto-miR167e基因的第536位基因型为TC、Pto-miR167g-5p基因的第456位基因型为CC和Pto-TPS5基因的第1378位基因型为GA，是所述杨树的木材品质性状差的指示；
所述Pto-TPS5基因具有SEQ ID NO.10所示的核苷酸序列，所述Pto-miR167e基因具有SEQ ID NO.11所示的核苷酸序列，所述Pto-miR167g-5p基因具有SEQ ID NO.12所示的核苷酸序列；所述杨树为毛白杨；
所述品质性状为综纤维素含量。
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