[发明专利]陆地棉4号染色体与纤维强度相关的SNP分子标记有效

专利信息
申请号: 201710097731.6 申请日: 2017-02-22
公开(公告)号: CN106929574B 公开(公告)日: 2020-12-29
发明(设计)人: 巩万奎;商海红;张震;范森淼;袁有禄;石玉真;葛群;刘爱英;龚举武;李俊文 申请(专利权)人: 中国农业科学院棉花研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6858
代理公司: 北京知本村知识产权代理事务所(普通合伙) 11039 代理人: 刘江良
地址: 455000 河*** 国省代码: 河南;41
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摘要:
搜索关键词: 陆地棉 染色体 纤维 强度 相关 snp 分子 标记
【说明书】:

发明属于棉花分子育种技术领域,公开了一种与陆地棉纤维强度相关的SNP分子标记及其检测和应用。所述的SNP分子标记是以棉花稳定的RIL群体为材料,通过基因组重测序的方法得到。利用本发明所公开的这些SNP标记,进行分子标记辅助育种选择,可大大缩短育种周期,提高棉花纤维强度的育种效率。

技术领域

本发明属于棉花分子育种技术领域,具体涉及一种与陆地棉纤维强度相关的SNP分子标记及其检测和应用。

背景技术

棉花作为一种主要的纤维作物,在世界经济中占有重要的地位。在全世界广泛栽培的四个棉种中,陆地棉占据着最重要的地位,其产量占世界棉花总产量的90%以上。随着人们对中高档纺织品需求的增长,对纤维品质的要求日益提高,但传统的育种手段主要是通过表型进行选择,育种效率低,难以满足品质育种的需要。分子标记技术的发展使直接选择数量性状的基因型成为了可能。通过构建棉花遗传图谱进行QTL定位可以使育种者直接选择纤维品质等数量性状的基因型,通过利用F2和RIL等作图群体进行了纤维品质QTL定位研究也取得了丰硕的成果。尤其是第三代标记技术SNP标记的开发和应用,更可为以后的标记辅助育种打下基础。SNP 标记是目前最具发展潜力的分子标记,因在基因组中数量多,分布广且在基因分析过程中不需要根据片段大小将DNA分带,适合于大规模的自动化和数量庞大的检测分析,目前已得到广泛的应用在医学和生物等领域。但在棉花中的研究还较少。

Kristen L等将SNP 标记作为判断染色体重组事件的最小单位(recombinationbin),判断子代每个 bin 来源于父母本的情况,得到每个子代的全基因组物理图谱,从而构建出Bin 图谱,用于后续高精度遗传连锁图谱构建和QTL定位(Kristen L Kump, PeterJ Bradbury et al.Genome-wide association study of quantitative resistance tosouthern leaf blight in the maize nested association mapping population[J].Nature Genetic,2011,43(2):163-168);Yu等应用全基因组重测序对241 株水稻RILs 群体进行低深度重测序,以SNP 为基础构建Bin 图谱,Bin 图谱具有超高密度,能够检测到更多的QTL,同时检测到的QTL 也更加精细(Yu H,Xie W,Wang J,et al.Gains in QTLdetection using an ultra-high density SNP map based on population sequencing

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