[发明专利]确定胰腺癌存在的方法、阵列以及用途

说明书

本申请是申请日为2012年3月5日，申请号为201280021793.4，发明名称为“确定胰腺癌存在的方法、阵列以及用途”的中国发明专利申请的分案申请。

技术领域

本发明涉及用于诊断胰腺癌的方法，以及在该方法中使用的生物标志物和阵列。

背景技术

虽然花费了大量力气，但胰腺癌(PaC)仍然难以预测[1]。尽管PaC仅为第10大常见的癌症，但其在美国是癌症死亡的第4主要原因[2-4]。实际上，胰腺癌的5年存活率<5％，是所有恶性肿瘤中最低的[2-3]。但是，近期的数据已经显示这种现象可以通过早期检测来获得显著克服，早期检测是当癌症还主要在I期，如在早期PaC切除之后所显示的5年存活率为30-60％(≤20mm大小的肿瘤)和甚至>75％(≤10mm大小的肿瘤)的存活率[2-4]。

PaC的特征在于快速的肿瘤进展、早期转移、以及对于大部分传统治疗不敏感[1,5]。难以预测主要是由于缺乏有效的早期诊断方法以及在疾病的过程中较晚出现的疾病特异性临床症状。在确诊的时刻，肿瘤通常已经达到30-40mm大小并且全部患者中的大部分(52％)已经发生转移，26％患者为局部晚期癌症，仅7％的患者具有局限在胰腺的肿瘤[2,4]。此时，约15％的患者仍可进行手术，但他们的平均存活时间仅为20个月。

已经有大量非侵入性的方法用于PaC诊断，包括(内窥镜)超声波、计算机断层成像和/或内窥镜逆行胰胆管造影[1-2,6]。尽管功能强大，但这些方法不是PaC特异性的，并且不是针对在肿瘤仍较小且潜在可治愈时的早期诊断而设计的。使该情况变得更为复杂的是使用目前存在的诊断工具难以将PaC与良性状况(诸如慢性胰腺炎)区分[2]。因此，利用对于PaC特异性并且用于早期诊断PaC的生物标志物将具有无价的临床价值。

虽然花费了大量力气，但与PaC相关的分子指纹(特别是来自未经加工、未分离的血清和血浆)仍需要被破译[2,7-9]。在到目前为止已经被提及的大量单生物标志物(包括CRP、CA 242、GDF-15、结合珠蛋白、M2-丙酮酸激酶、血清淀粉样蛋白A、IGFBP-1)中，还没有任何一个被证明临床效果优于CA 19-9[2,8-10]。CA 19-9的使用仍然显著地受到发现的如下的事实所阻碍：i)在非-恶性状况(例如胰腺炎和急性胆管炎)以及其他肠胃癌(例如胃癌和大肠癌)中均有升高，ii)针对早期PaC缺乏敏感性，以及iii)在约10％的人群中是缺失的[2,8-10]。当筛查PaC时，CA 19-9仅获得了中等的灵敏性(范围为69％～98％)和特异性(46％～98％)[2,9-11]。

针对上述背景，本发明人在WO 2008/117067中开发了进行癌症的预后诊断的蛋白质组学方法，由此鉴定出用于检测胰腺癌和用于预测存活率的第一组血清生物标志物。

发明内容

受到近期研究(其中我们指出了亲和蛋白质组学[12-13]可以用作PaC血清生物标志物签名(biomarker signatures)的查明候选物(pin-point candidate)[14])的启发，我们还进一步解码了PaC的血清蛋白质组。

在本研究中，我们第一次预先验证了用于PaC诊断的复合血清生物标志物签名，其表明诊断信息可以从未加工血液样品中提取，并表现出高度的特异性和灵敏度。这提供了改善的PaC诊断以及从而提高了预测，带来了显著增加的临床价值，以及向相关的、复杂的疾病生物学射出了进一步的光芒。

由此，本发明的第一方面提供用于检测个体中胰腺癌存在的方法，该方法包括以下步骤或由以下步骤构成：

a)提供来自个体的待检测样品；

b)通过检测一种或多种生物标志物在检测样品中的表达来确定检测样品的生物标志物签名，该一种或多种生物标志物选自表III中定义的组；

其中，选自表III中定义的组的一种或多种生物标志物在检测样品中的表达是罹患胰腺癌的个体的指示。

“待检测样品”、“检测样品”或“对照样品”，适当地包括来自待检测个体或对照个体的组织，流体蛋白质组和/或表达性样品(expressome sample)。

“表达(expression)”表示基因产物诸如mRNA或蛋白质的水平或量。

检测和/或测定蛋白质和/或核酸的浓度的方法对于本领域技术人员而言是熟知的，参见例如Sambrook and Russell,2001,Cold Spring Harbor Laboratory Press。