[发明专利]一种钙黄绿素可视化RT‑LAMP试剂盒及其应用在审
| 申请号: | 201710038122.3 | 申请日: | 2017-01-17 | 
| 公开(公告)号: | CN107058615A | 公开(公告)日: | 2017-08-18 | 
| 发明(设计)人: | 黄淑坚;梁国智;黄兴国;梅敏敏;黄雯晶;李晓文;陈绮汶;刘明文;蔡跃佳;李秋艺;李文俊;傅禹铭;陈灿君 | 申请(专利权)人: | 佛山科学技术学院 | 
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 | 
| 代理公司: | 深圳市君胜知识产权代理事务所(普通合伙)44268 | 代理人: | 王永文,刘文求 | 
| 地址: | 528000 广*** | 国省代码: | 广东;44 | 
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 黄绿 可视化 rt lamp 试剂盒 及其 应用 | ||
1.一种钙黄绿素可视化RT-LAMP试剂盒,其特征在于,包括引物组、钙黄绿素、氯化锰;
所述引物组如下:
上游外引物F3:5’-CGTGGATGGTCAAAGTCGT-3’;
下游外引物B3:5’-ACCTACACTCCAGGAAGGAC-3’;
上游内引物FIP:
5’-TAGTTCTGGCATGGCCTCGC-CTTTACATGTGCTGCAGGGA-3’;
下游内引物BIP:
5’-TGTTCGGACGTTCTCTTCCGGA-TTTAATGGCGCGGACGAC-3’;
环引物LoopF:5’-AGCCTAGATTCGCACTCCG-3’;
环引物LoopB:5’-CGAGGAGACTACCCACGTT-3’。
2.根据权利要求1所述的钙黄绿素可视化RT-LAMP试剂盒,其特征在于,还包括新型鸭呼肠孤病毒RNA模板。
3.根据权利要求1所述的钙黄绿素可视化RT-LAMP试剂盒,其特征在于,还包括:RNase-free water、10倍反应缓冲液、dNTPs、甜菜碱、MgSO4、Bst DNA聚合酶和AMV反转录酶。
4.根据权利要求1所述的钙黄绿素可视化RT-LAMP试剂盒,其特征在于,还包括:2.5mmol/L的dNTPs、5mmol/L的甜菜碱、100mmol/L的MgSO4、625mmol/L的钙黄绿素、25mmol/L的MnCl2、8U/μL的Bst DNA聚合酶和10U/μL AMV的反转录酶。
5.根据权利要求1所述的钙黄绿素可视化RT-LAMP试剂盒,其特征在于,所述外引物F3+B3的浓度为10μmol/L,所述内引物FIP+BIP的浓度为10μmol/L,所述环引物LoopF+LoopB的浓度为10μmol/L。
6.一种钙黄绿素可视化RT-LAMP试剂盒的应用,其特征在于,包括步骤:
(1)配制RT-LAMP反应体系:加入钙黄绿素、氯化锰、硫酸镁、甜菜碱、dNTPs、AMV酶、Bst聚合酶、10倍反应缓冲液、上游外引物F3、下游外引物B3、上游内引物FIP、下游内引物BIP、环引物LoopF、环引物LoopB以及测试样品;
(2)反应:将步骤(1)配制好的反应体系反应,在59~66℃恒温条件下反应,然后灭活;
(3)结果判读:
在自然光或紫外光下判读反应的结果或者二者结合判读:
在自然光下,反应产物为绿色,说明测试样品中含有新型鸭呼肠孤病毒;在自然光下,反应产物为橙色,说明测试样品中不含新型鸭呼肠孤病毒;
在紫外光下,反应产物为荧光绿色,说明测试样品中含有新型鸭呼肠孤病毒;在紫外光下,反应产物为浅蓝色或接近透明,说明测试样品中不含新型鸭呼肠孤病毒。
7.根据权利要求6所述的钙黄绿素可视化RT-LAMP试剂盒的应用,其特征在于,所述步骤(1)中,钙黄绿素和氯化锰终浓度比为1:8~1:128,硫酸镁的终浓度为1mmol/L~6mmol/L,甜菜碱的终浓度为0.5mmol/L~1.5mmol/L,dNTPs的终浓度为0.2mmol/L~0.6mmol/L,AMV酶的终浓度为0.06U/μL~0.16U/μL,Bst聚合酶的终浓度为0.08U/μL~0.48U/μL,10倍反应缓冲液的终体积分数4%~16%。
8.根据权利要求6所述的钙黄绿素可视化RT-LAMP试剂盒的应用,其特征在于,所述步骤(1)中,内引物与外引物的终浓度比为2:1~12:1,环引物与外引物的终浓度比为0~6:1。
9.根据权利要求6所述的钙黄绿素可视化RT-LAMP试剂盒的应用,其特征在于,所述步骤(2)中,恒温反应的时间为10min~60min。
10.根据权利要求6所述的钙黄绿素可视化RT-LAMP试剂盒的应用,其特征在于,所述步骤(2)中,灭活的条件为温度85℃、时间5min。
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