[发明专利]一种数据存储方法及数据存储装置

说明书

本发明涉及信息处理技术领域，公开了一种数据存储方法及数据存储装置。该数据存储方法包括：从原始数据文件中读取2*M个数据；按照原始数据文件中数据的存储规律，将读取的数据分别存入预设的C个长度为DX的一维变量中；计算每一个一维变量的第一个数据在预设的二维变量中的开始位置，其中，该二维变量的行数为N，列数为P；从开始位置按照存储规律将所述一维变量中的有效数据填充到二维变量。本发明实施方式，剔除了原始数据文件中的冗余数据，并根据原始数据文件中数据的存储规律将有效数据保存至预设的二维变量中。这种存储方式不仅会减少内存空间，还会减小查找相关反应单元的输出数据的时间，从而提高工作效率。

技术领域

本发明涉及信息处理技术领域，特别涉及一种数据存储方法及数据存储装置。

背景技术

为了测试芯片的性能，需要用测序仪采集芯片中各反应单元(即芯片中进行相关反应的反应腔)的输出数据进行研究。现有技术中，为了方便数据的采集，常会设计简单的数据采样原则或采集方法。但本发明的发明人发现，这些数据采样原则或采集方法通常会每次采集的数据的个数有要求，芯片中实际的反应单元的个数要远远小于该要求的个数，而为了满足该要求的个数，采集数据时往往会引入大量的冗余数据(即无效数据)，也就是说原始数据文件中既包括有效数据(芯片中各反应单元的输出数据)，也包括冗余数据。由于冗余数据是虚假、无效、不参与数据计算的，尤其是对于高通量测序仪而言，冗余数据个数的量级是十万、百万级别的，它们的存在不仅占用大量的内存空间。更重要的是，在查找相关反应单元的输出数据时，为了避开冗余数据，常常需要设置很多判断条件来参与数值计算，这必将造成计算时间的大量浪费。

发明内容

本发明实施方式的目的在于提供一种数据存储方法及数据存储装置，使得可以剔除原始数据文件中采集的冗余数据，只存储芯片中各反应单元的输出数据，从而减小内存空间，并提高查找相关反应单元的输出数据的速度。

为解决上述技术问题，本发明的实施方式提供了一种数据存储方法，包括：从原始数据文件中读取2*M个数据；按照原始数据文件中数据的存储规律，将读取的数据分别存入预设的C个长度为DX的一维变量中；计算每一个一维变量的第一个数据在预设的二维变量中的开始位置，其中，该二维变量的行数为N，列数为P；从开始位置按照存储规律将所述一维变量中的有效数据填充到二维变量；其中，(M/2)P≤N≤M，N、P为自然数，M＝2^m，m为自然数。

本发明的实施方式还提供了一种数据存储装置，包括：读取模块、缓存模块、计算模块及存储模块；读取模块用于从原始数据文件中读取2*M个数据；缓存模块用于按照原始数据文件中数据的存储规律，将读取的数据分别存入预设的C个长度为DX的一维变量中；计算模块用于计算每一个一维变量的第一个数据在预设的二维变量中的开始位置，其中，该二维变量的行数为N，列数为P；存储模块用于从开始位置按照存储规律将一维变量中的有效数据填充到二维变量；其中，(M/2)P≤N≤M，N、P为自然数，M＝2^m，m为自然数。

本发明实施方式相对于现有技术而言，先从原始数据文件中提取出部分原始采集的数据，并将该原始采集的数据按照原始数据文件中数据的存储规律，存储至预设的一维变量中；再从该预设的一维变量中，将该原始采集的数据中的有效数据(芯片中各反应单元输出的数据)从计算出的开始位置起按照相应的规律(这些数据在原始数据文件中的存储规律)存储至预设的二维变量中，这样二维变量中的数据就全是有效数据。这种存储方式不仅会减少内存空间，还会减小查找相关反应单元的输出数据的时间，从而提高工作效率。

进一步地，在从开始位置按照该存储规律将一维变量中的有效数据填充到二维变量之后，还包括：判断从原始数据文件中读取数据的次数是否达到P/2次；在没有达到P/2次时，则接着前一次读取数据从原始数据文件中读取当前的2*M个数据。

进一步地，在按照原始数据文件中数据的存储规律，将读取的数据分别存入预设的C个长度为DX的一维变量中，将读取的每一个数据在原始数据文件中的位置索引整除C，并按照余数将读取的数据分别存入对应的一维变量中。