[发明专利]用于蛋白质或多肽的混合物的从上到下多路复用质谱分析的方法

权利要求书

1.一种用于识别液体样本内的蛋白质或多肽分析物化合物的存在或不存在的方法，所述样本包括化合物的混合物，所述混合物包含多种蛋白质化合物或多种多肽化合物或多种蛋白质和多肽化合物，所述方法包括以下步骤：

(a)将所述液体样本的一部分引入到质谱仪的电喷射电离源中；

(b)通过电喷射电离形成所述液体样本的所述部分的所述化合物混合物的带正电离子，所述带正电离子包括多个离子物质；

(c)隔离包括第一质荷比(m/z)比率范围的所述离子物质的第一子集，所述范围包含所述分析物化合物的特定预定多质子化分子物质的质荷比；

(d)通过致使所述隔离的离子物质的第一子集在预定持续时间中与反应剂阴离子反应而从所述隔离的离子物质的第一子集产生多个第一代产物离子物质，所述反应剂阴离子在反应后从一或多个离子物质中的包括蛋白质或多肽化合物的质子化分子物质的每一者提取质子；

(e)使用质量分析器产生所述第一代产物离子物质或从所述第一代产物离子物质产生的第二代产物离子物质的质谱；

(f)从所述第一代或所述第二代产物离子物质的所述质谱辨识作为所述蛋白质或多肽分析物化合物的诊断的一或多个质荷比的集合；以及

(g)如果在所述质谱中识别出一或多个质荷比的所述集合，那么识别所述样本内的所述分析物化合物的存在，

其中辨识作为所述蛋白质或多肽分析物化合物的诊断的一或多个质荷比的所述集合的所述步骤(f)采用数学分析算法，其中所述质谱中观测到的峰的强度表示为布尔型值且每一峰的所述质荷比由变量T(m/z)表示，其中T(m/z)＝ln((m/z)-M_proton)且M_proton是质子的质量。

2.根据权利要求1所述的方法，其进一步包括第二次重复所述步骤(a)到(e)，其中在所述步骤(a)到(e)的所述第二次重复期间或之前执行所述步骤(f)和(g)。

3.根据权利要求1所述的方法，其进一步包括多次重复执行步骤(a)到(g)，其中步骤(a)的每一重复包括将来自对应于相应滞留时间的层析柱的溶离液引入到所述电喷射电离源中。

4.根据权利要求1所述的方法，其中辨识作为所述蛋白质或多肽分析物化合物的诊断的一或多个质荷比的所述集合的所述步骤(f)包括辨识对应于所述分析物化合物的多质子化离子物质序列的所述第一代产物离子物质的所述质谱内的一系列质荷比，所述分析物化合物的所述多质子化离子物质相对于所述特定预定多质子化分子物质的电荷态逐渐地减少电荷。

5.根据权利要求1所述的方法，其中：

所述步骤(c)包括进一步隔离所述离子物质的第二子集，所述第二子集包括第二质荷比范围，所述第二质荷比范围包含第二蛋白质或多肽分析物化合物的特定预定多质子化分子物质的质荷比；

所述步骤(f)包括从所述第一代或所述第二代产物离子物质的所述质谱且使用所述数学分析算法辨识作为所述第二蛋白质或多肽分析物化合物的诊断的一或多个质荷比的第二集合；且

所述步骤(g)包括如果在所述质谱中识别出质荷比的所述第二集合，那么识别所述样本内的第二分析物化合物的存在。

6.根据权利要求5所述的方法，其中所述第一子集的质荷比范围相同于所述第二质荷比范围。

7.根据权利要求5所述的方法，其中所述步骤(c)包括同时隔离包括所述第一子集的质荷比范围的所述离子物质的所述第一子集以及包括所述第二质荷比范围的所述离子物质的所述第二子集以使得所述第一子集的质荷比范围和第二质荷比范围是非邻接的。

8.根据权利要求1所述的方法，其中产生多个第一代产物离子物质的所述步骤(d)包括致使所述步骤(c)隔离的离子物质的第一子集和反应剂阴离子在一持续时间中反应，所述持续时间致使在步骤(e)中的所述质谱的后续产生期间所述步骤(d)的第一代产物离子物质稳定而不会分解。