[发明专利]棉花全基因组SNP芯片及其应用有效
申请号: | 201680077963.9 | 申请日: | 2016-11-08 |
公开(公告)号: | CN108779459B | 公开(公告)日: | 2022-09-09 |
发明(设计)人: | 郭旺珍;张天真;蔡彩平 | 申请(专利权)人: | 南京农业大学 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/6895;C40B40/06 |
代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人: | 徐冬涛;李晓峰 |
地址: | 210095 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 棉花 基因组 snp 芯片 及其 应用 | ||
1.用于检测棉花全基因组SNP位点集合的探针在制备棉花全基因组SNP芯片中的应用,其特征在于,所述的棉花全基因组SNP位点集合包含82,259个SNP位点,每个SNP位点包含两个不同碱基变异位点,用于检测该位点的等位基因变化,所述的SNP位点位于如SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:82,259所示核苷酸序列的第61位;所述的探针依据如SEQ ID NO:1-SEQ IDNO:82,259所示的核苷酸序列设计,能够用于相应SNP位点基因分型。
2.用于检测棉花全基因组SNP位点集合的探针在棉花种质资源指纹图谱构建、棉花杂交后代基因型鉴定、棉花全基因组关联分析、棉花品种身份鉴定或棉花育种材料选择中的应用,其特征在于,所述的棉花全基因组SNP位点集合包含82,259个SNP位点,每个SNP位点包含两个不同碱基变异位点,用于检测该位点的等位基因变化,所述的SNP位点位于如SEQID NO:1-SEQ ID NO:82,259所示核苷酸序列的第61位;所述的探针依据如SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:82,259所示的核苷酸序列设计,能够用于相应SNP位点基因分型。
3.用于检测棉花全基因组SNP位点集合的芯片在棉花种质资源指纹图谱构建、棉花杂交后代基因型鉴定、棉花全基因组关联分析、棉花品种身份鉴定或棉花育种材料选择中的应用,其特征在于,所述的芯片含有一套用于检测棉花全基因组SNP位点集合的探针;所述的棉花全基因组SNP位点集合包含82,259个SNP位点,每个SNP位点包含两个不同碱基变异位点,用于检测该位点的等位基因变化,所述的SNP位点位于如SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:82,259所示核苷酸序列的第61位;所述的探针依据如SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:82,259所示的核苷酸序列设计,能够用于相应SNP位点基因分型。
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