[发明专利]病原体生物标志物及其用途

权利要求书

1.一种用于确定在评价受试者具有VaSIRS的存在、不存在或程度的可能性中使用的指示物的方法，所述方法包括以下、由以下组成或基本上由以下组成：(1)确定生物标志物值，所述生物标志物值针对从所述受试者采集的样品中的至少一种(例如，1种、2种、3种、4种、5种、6种、7种、8种、9种、10种或更多种)对应的VaSIRS生物标志物测量或导出并且至少部分地指示所述样品中VaSIRS生物标志物的水平；以及(2)使用所述生物标志物值确定指示物，其中所述受试者具有至少一种SIRS临床征象并且所述至少一种VaSIRS生物标志物不是选自由以下组成的组的至少一种其他SIRS状况的生物标志物：细菌相关SIRS、自身免疫疾病相关SIRS、癌症相关SIRS和创伤相关SIRS。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述至少一种VaSIRS生物标志物为选自由以下组成的组的基因的表达产物：ZBP1、TMEM62、CD38、ISG15、IFI44、RSAD2、HERC5、MX1、HERC6、OAS2、XAF1、IFI6、PARP12、EIF2AK2、DHX58、UBE2L6、DDX60、USP18、RTP4、PHF11、IFIH1、ZBP1、STAT1、LAP3、TAP1、C19orf66、CUL1、POLB、ZC3HAV1、IL16、ITPKB、CAMK2G、CTDSP2、DPEP2、LTB、CBX7、FNBP1、FOXO1、MAST3、LDLRAP1、TMEM204、FAIM3、RGS14、IKBKB、ZXDC、PHF20、DGKA、XPC、PPARD、C2orf68、NLRP1、IL27RA、ABLIM1、JAK1、METTL3、SAFB2、PPM1F、TYK2、BANP、CRTC3、ATM、PAFAH1B1、PIK3IP1、WDR37、TGFBR2、ZNF274、STAT5B、MAML1、SATB1、DOCK9、CHMP7、BRD1、BTG1、ATF7IP2、DIDO1、LEF1、TNRC6B、SERTAD2、CEP68、BCL2、VPS8、CHD3、PUM2、TGOLN2、NDE1、CCR7、PSTPIP1、TIAM1、PECAM1、PDE3B、MYC、FOXJ2、PRMT2、CSNK1D、RPL10A、SERINC5、ARHGEF2、HGSNAT、TRAK1、PHF2、PBX3、SESN1、DPF2、IL4R、NOSIP、MPPE1、NR3C1、ABAT、GCC2、ZFC3H1、SETD2、ITSN2、R3HDM2、ARHGAP15、PCF11、MAPRE2、ST3GAL1、NACA、WDR47、SSBP2、CLK4、EIF3H、FRY、ZNF238、PTGER4、PCNX、NECAP2、CASC3、MSL1、VEZF1、KIAA0232、RASSF2、RPL22、ACAA1、MAP4K4、BEX4、NCBP2、LRMP、CAMK1D、UTP14A、STX6、RPS6KA3、PRKAA1、GOLGA7、ZNF143、SNRK、SYPL1、CYLD、PRUNE、CRLF3、CD93、GPS2、FBXO11、UBE2D2、USP10、CCNG2、SOS2、ARRB1、CEP170、SMAD4、CIAPIN1、KLF7、PHF20L1、ALDH3A2、PDCD6IP、WASF2、TGFBI、GPBP1L1、PCBP2、DCP2、LYST、ERBB2IP、ANKRD49、NDFIP1、ATAD2B、ZNF292、CCNT2、MARCH7、ACAP2、MED13、IL6ST、PHF3、SP3、SEC62、ZFYVE16、NEK7、POLD4、GNA12、TRIB2、YTHDF3、PPP2R5A、PPP1R2、ZDHHC17、STK38L、ST13、FAM134A、PFDN5、MARCH8、POLR1D、OASL、N4BP1、NOD2、RNF19B、PRKAG2、IGSF6、MEF2A、LPIN2、PPP1R11、USP15、BACH1、SSFA2、MKLN1、FYB、NSUN3、MAX、STAM2、HHEX、CLEC4A、ZFAND5、ABI1、MORC3、RC3H2、MAP1LC3B、TM2D3、CHST11、NAB1、KLF3、YPEL5、MXI1、CD97、CYTH4、HCK、ARHGAP26、RARA、XPO6、TNFRSF1A、SLCO3A1、ICAM3、PTPN6、PRKCD、RAB11FIP1、CSF2RB、LCP2、TYROBP、PHC2、RHOG、PSAP、LYN、TMEM127、LILRA2、AOAH、FGR、PLEKHO2、ARAP1、RBM23、PTPRE、KLF6、LIMK2、LILRB3、TLR2、GPR97、GMIP、SIRPA、LRP10、LPAR2、TREM1、IL13RA1、ITGAX、ARHGAP25、SIRPB1、ZDHHC18、TLE3、ITGB2、SNX27、PGS1、ATP6V1B2、RAB31、MAP3K11、PACSIN2、KIAA0513、EMR2、RERE、NUMB、RALB、ETS2、STAT5A、LST1、RIN3、TNK2、IQSEC1、PISD、SORL1、FES、KIAA0247、IL6R、LAPTM5、VAMP3、FAM65B、MAP3K5、TRIM8、ZYX、MAPK14、PLEKHO1、NCOA1、RNASET2、APBB1IP、RXRA、PTAFR、CNPY3、TNFSF13、RPS6KA1、OSBPL2、MTMR3、TMBIM1、TFEB、TFE3、RAF1、STX3、LAT2、GRB2、NDEL1、SEMA4D、FCGRT、DOK3、HIP1、UBN1、PLXNC1、NRBF2、INPP5D、SH2D3C、MMP25、IL10RB、FLOT2、PIAS1、PITPNA、APLP2、CTBP2、GPSM3、RNF130、DGCR2、ZMIZ1、CAP1、GSK3B、RGS19、RAB7A、CREBBP、RBMS1、IL1RAP、RTN3、PPP4R1、TRIOBP、GABARAP、MCTP2、NFKB1、CST3、ABHD2、SH2B3、STX10、TSC22D3、TLE4、HAL、ARRB2、MAP3K3、NPL、CCND3、SERINC3、GNAQ、USP4、PSEN1、KBTBD2、LYL1、AIF1、MBP、ACVR1B、RAB4B、PTEN、ASAP1、MANSC1、RYBP、CSAD、UBXN2B、TNIP1、WBP2、OGFRL1、SNN、HPCAL1、CD37、RNF146、RAB14、TOPORS、NFYA、FOXO3、CREB1、MAPK1、SOAT1、UBQLN2、OSBPL11、KLHL2、VAV3、BRD4、MARK3、BAZ2B、ZNF148、CASP8、CHMP1B、HPS1、RNF141、MOSPD2、PINK1、CDIPT、NCOA4、PPP3R1、MKRN1、GYPC、BMP2K和FBXO9。