[发明专利]使用遗传标记的甲基化状态区分转移性-致死性前列腺癌与惰性前列腺癌在审

申请号：	201680063233.3	申请日：	2016-12-22
公开（公告）号：	CN108474041A	公开（公告）日：	2018-08-31
发明（设计）人：	J·斯坦福;Z·风	申请（专利权）人：	弗莱德哈钦森癌症研究中心
主分类号：	C12Q1/6886	分类号：	C12Q1/6886
代理公司：	北京律盟知识产权代理有限责任公司 11287	代理人：	林彦
地址：	美国华***	国省代码：	美国;US
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摘要：
搜索关键词：	前列腺癌致死性转移性甲基化状态遗传标记试剂盒时间点可用疗法告知
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【权利要求书】：

1.一种区分受试者的转移性-致死性前列腺癌PCa与惰性PCa的方法，包含：

从所述受试者获得原发肿瘤组织样品；

分析所述样品以检测位于一或多种选自以下各项的表观遗传基因座的胞嘧啶的甲基化状态：基因间1、基因间2、FHAD1、ALKBH5、KLHL8、ATP11A、基因间3和PI15；

基于所述分析获得每个所选表观遗传基因座的值；

计算β差值；以及

基于所述β差值判定所述样品是转移性-致死性PCa或惰性PCa，进而区分所述受试者的转移性-致死性前列腺癌PCa与惰性PCa。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述胞嘧啶是CpG对的一部分。

3.根据权利要求2所述的方法，其中所述CpG对位于CpG岛内。

4.根据权利要求1所述的方法，其中所述胞嘧啶位于CpG位点：cg01135464；CpG位点：cg02223001；CpG位点：cg02394978；CpG位点：cg07166550；CpG位点：cg16713292；CpG位点：cg21513610；CpG位点：cg22501793；和/或CpG位点：cg24349665内。

5.根据权利要求1所述的方法，其中所述胞嘧啶是所述所选表观遗传基因座内的CpG对内的所有胞嘧啶。

6.根据权利要求1所述的方法，其中所述计算β差值是利用来源于患有惰性PCa的受试者群体的参考水平。

7.根据权利要求6所述的方法，其中基因间1、基因间2、基因间3和/或PI15的正β差值将所述样品区分为转移性-致死性PCa。

8.根据权利要求6所述的方法，其中基因间1、基因间2、基因间3和/或PI15的负β差值将所述样品区分为惰性PCa。

9.根据权利要求6所述的方法，其中FHAD1、ALKBH5、KLHL8和/或ATP11A的负β差值将所述样品区分为转移性-致死性PCa。

10.根据权利要求6所述的方法，其中FHAD1、ALKBH5、KLHL8和/或ATP11A的正β差值将所述样品区分为惰性PCa。

11.根据权利要求1所述的方法，其中计算β差值是利用来源于患有转移性-致死性PCa的受试者群体的参考水平。

12.根据权利要求11所述的方法，其中基因间1、基因间2、基因间3和/或PI15相比于所述参考水平的负β差值将所述样品区分为惰性PCa。

13.根据权利要求11所述的方法，其中基因间1、基因间2、基因间3和/或PI15的正β差值将所述样品区分为转移性-致死性PCa。

14.根据权利要求11所述的方法，其中FHAD1、ALKBH5、KLHL8和/或ATP11A的正β差值将所述样品区分为惰性PCa。

15.根据权利要求11所述的方法，其中FHAD1、ALKBH5、KLHL8和/或ATP11A的负β差值将所述样品区分为转移性-致死性PCa。

16.根据权利要求1所述的方法，其中所述方法包含分析所述样品以检测位于基因间1；基因间2；FHAD1；ALKBH5；KLHL8；ATP11A；基因间3；以及PI15的胞嘧啶的甲基化状态。