[发明专利]用于导出视野中呈现的选定细胞的生物标志物阳性百分比值的方法

权利要求书

1.一种非疾病诊断治疗目的的导出视野中呈现的所有细胞中一个亚组的生物标志物阳性百分比（PBP）值的方法，包括：

（i）生成表示视野中呈现的所有细胞的细胞核的第一荧光信号的图像，其中该生成步骤由以下步骤组成：

-（a）获得来自视野中呈现的所有细胞的细胞核的荧光发射的像素数据，这些细胞被荧光团染色；

-（b）评估观察到的每个像素的像素强度值，如果该值低于用户定义的下限，则将该值重置为零；

-（c）编制非零像素强度值的直方图分布；和

-（d）将高于用户定义的直方图阈值的非零像素强度值重置为 1，以获得表示视野中呈现的所有细胞的细胞核的第一荧光信号的图像；

并将每个细胞核的所述第一荧光信号扩大3个像素至整个细胞的直径以构建所述视野中呈现的所有细胞的第一掩模；

（ii）构建表示所述视野中呈现的表达亚组生物标志物的所有区域的第二荧光信号的第二掩模；

（iii）以提供第四掩模的方式来结合所述第一掩模和所述第二掩模，所述第四掩模由表示所述视野中同时表达所述亚组生物标志物的所有细胞的荧光信号组成；

（iv）通过将所述第四掩模以像素为单位测量的总面积除以所述第一掩模以像素为单位测量的总面积来导出针对表达所述亚组生物标志物的所有细胞的PBP值。

2.一种非疾病诊断治疗目的的导出视野中呈现的所有细胞中多个亚组的生物标志物阳性百分比（PBP）值的方法，包括：

（i）生成表示视野中呈现的所有细胞的细胞核的第一荧光信号的图像，其中该生成步骤由以下步骤组成：

-（a）获得来自视野中呈现的所有细胞的细胞核的荧光发射的像素数据，这些细胞被荧光团染色；

-（b）评估观察到的每个像素的像素强度值，如果该值低于用户定义的下限，则将该值重置为零；

-（c）编制非零像素强度值的直方图分布；和

-（d）将高于用户定义的直方图阈值的非零像素强度值重置为 1，以获得表示视野中呈现的所有细胞的细胞核的第一荧光信号的图像；

并将每个细胞核的所述第一荧光信号扩大3个像素至整个细胞的直径以构建所述视野中呈现的所有细胞的第一掩模；

（ii）构建表示所述视野中呈现的表达亚组生物标志物的所有区域的第二荧光信号的第二掩模；

（iii）构建表示所述视野中呈现的表达所关注的第一生物标志物的所有区域的第三荧光信号的第三掩模；

（iv）以提供第四掩模的方式来结合所述第一掩模和所述第二掩模，所述第四掩模由表示所述视野中同时表达所述亚组生物标志物的所有细胞的荧光信号组成；

（v）以提供第五掩模的方式来结合所述第一掩模和所述第三掩模，所述第五掩模由表示所述视野中同时表达所关注的所述第一生物标志物的所有细胞的第一亚组的荧光信号组成；

（vi）通过将所述第四掩模以像素为单位测量的总面积除以所述第一掩模以像素为单位测量的总面积来导出针对表达所述亚组生物标志物的所有细胞的PBP值；

（vii）以提供第六掩模的方式来结合所述第四掩模和所述第五掩模，所述第六掩模由表示所述视野中同时表达所述亚组生物标志物和所关注的所述第一生物标志物的所有细胞的所述第一亚组的荧光信号组成：

（viii）通过将所述第六掩模以像素为单位测量的总面积除以所述第四掩模以像素为单位测量的所述总面积来导出针对表达所述亚组生物标志物和所关注的所述第一生物标志物的所有细胞的所述第一亚组的PBP值。

3.根据权利要求2所述的方法，还包括：

（ix）构建表示所述视野中呈现的表达所关注的第二生物标志物的所有区域的第四荧光信号的第七掩模；

（x）以提供第八掩模的方式来结合所述第一掩模和所述第七掩模，所述第八掩模由表示所述视野中同时表达所关注的所述第二生物标志物的所有细胞的第二亚组的荧光信号组成；

（xi）以提供第九掩模的方式来结合所述第四掩模和所述第八掩模，所述第九掩模由表示所述视野中同时表达所述亚组生物标志物和所关注的所述第二生物标志物的所有细胞的所述第二亚组的荧光信号组成；

（xii）通过将所述第九掩模以像素为单位测量的总面积除以所述第四掩模以像素为单位测量的所述总面积来导出针对表达所述亚组生物标志物和所关注的所述第二生物标志物的所有细胞的所述第二亚组的PBP值。