[发明专利]用于HIV分析的试剂和方法在审
申请号: | 201680054086.3 | 申请日: | 2016-09-16 |
公开(公告)号: | CN108138243A | 公开(公告)日: | 2018-06-08 |
发明(设计)人: | S.潘迪特;A.尤斯吉里斯;L.帕尔默 | 申请(专利权)人: | 西门子医疗保健诊断公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6869 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 石克虎;罗文锋 |
地址: | 美国*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 寡核苷酸试剂 诊断和治疗 基因组 扩增子 检测 可检测 变体 扩增 感染 分析 发现 成功 | ||
1.组合物,其包含寡核苷酸引物对,所述寡核苷酸引物对包含正向寡核苷酸引物和反向寡核苷酸引物,所述正向寡核苷酸引物和反向寡核苷酸引物在与HIV核酸分子杂交后侧接包含所述HIV核酸分子的至少20个核苷酸的扩增子序列,所述HIV核酸分子与SEQ ID NO:1-11之一具有至少80%序列同一性,其中所述扩增子序列存在于所述HIV核酸分子的与SEQID NO:12-22之一具有至少80%序列同一性的区域中。
2.权利要求1的组合物,其中所述寡核苷酸引物对包含正向寡核苷酸引物和反向寡核苷酸引物,所述正向寡核苷酸引物包含与SEQ ID NO:23-39之一具有至少80%序列同一性的核酸序列的至少15个连续核苷酸,所述反向寡核苷酸引物包含和与SEQ ID NO:40-55之一具有至少80%序列同一性的核酸序列互补的至少15个连续核苷酸。
3.作为扩增反应混合物的组合物,所述组合物包含:
HIV核酸分子,其包含与SEQ ID NO:1-11之一具有至少80%同一性的序列;
正向寡核苷酸引物,其包含与SEQ ID NO:23-39之一具有至少80%序列同一性的核酸序列的至少15个连续核苷酸;
反向寡核苷酸引物,其包含和与SEQ ID NO:40-55之一具有至少80%序列同一性的核酸序列互补的至少15个连续核苷酸;
扩增子分子,其具有衍生自所述HIV核酸分子序列的一部分的序列和正向寡核苷酸引物的序列或反向寡核苷酸引物的序列。
4.权利要求3的组合物,其进一步包含一种或多种探针,其包含与SEQ ID NO:56-84之一具有至少80%序列同一性的核酸序列的至少15个连续核苷酸,其中所述扩增子分子与所述探针中的一种或多种杂交。
5.权利要求1至3中任一项的组合物,其进一步包含一种或多种探针,其包含与SEQ IDNO:56-84之一具有至少80%序列同一性的核酸序列的至少15个连续核苷酸。
6.试剂盒,其包含:
正向寡核苷酸引物,其包含与SEQ ID NO:23-39之一具有至少80%序列同一性的核酸序列的至少15个连续核苷酸;
反向寡核苷酸引物,其包含和与SEQ ID NO:40-55之一具有至少80%序列同一性的核酸序列互补的至少15个连续核苷酸;
一种或多种探针,其包含与SEQ ID NO:56-84之一具有至少80%序列同一性的核酸序列的至少15个连续核苷酸;和
包含HIV核酸分子的阳性对照样品,所述HIV核酸分子在存在所述正向和反向寡核苷酸引物的情况下经历一个或多个扩增循环时产生扩增子分子。
7.权利要求1至6中任一项的试剂盒或组合物,其中所述正向寡核苷酸引物包含SEQ IDNO 23的至少15个连续核苷酸,并且所述反向寡核苷酸引物包含与具有SEQ ID NO:40的序列的核酸序列互补的至少15个连续核苷酸。
8.权利要求1至7中任一项的试剂盒或组合物,其中所述正向寡核苷酸引物包含SEQ IDNO 23的序列,并且所述反向寡核苷酸引物包含与SEQ ID NO:40的序列互补的序列。
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