[发明专利]LRP5作为用于鉴定免疫细胞特别是B细胞的表观遗传标志物在审

专利信息
申请号: 201680052685.1 申请日: 2016-09-22
公开(公告)号: CN108026578A 公开(公告)日: 2018-05-11
发明(设计)人: 斯文·欧莱克 申请(专利权)人: 艾皮恩蒂斯有限公司
主分类号: C12Q1/6881 分类号: C12Q1/6881
代理公司: 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 代理人: 王达佐;洪欣
地址: 德国*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: lrp5 作为 用于 鉴定 免疫 细胞 特别是 表观 遗传 标志
【权利要求书】:

1.鉴定样品中B细胞的方法,其包括分析哺乳动物低密度脂蛋白受体相关蛋白5(LRP5)的基因区中至少一个CpG位置的甲基化状态,其中优选地,所分析的所述基因区根据SEQ IDNo.1来定位,其中当与非B细胞相比时,所述基因区的去甲基化指示B细胞。

2.如权利要求1所述的方法,其中所述至少一个CpG位置存在于所分析的所述基因区的转录起始处上游的5'区、启动子区、5'或3'非翻译区、外显子、内含子、外显子/内含子边界和/或转录终止处下游的3'区中。

3.如权利要求1或2所述的方法,其中所述至少一个CpG位置选自以下CpG:其选自SEQID No.1的扩增子中的CpG位置1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23和24,并且优选地选自根据SEQ ID No.2或3的亚硫酸氢盐转化的序列的扩增子No.2249的片段中的CpG位置3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16和17。

4.如权利要求1至3中任一项所述的方法,其中所述亚硫酸氢盐可转化性分析包括:选自甲基化特异性酶消化、亚硫酸氢盐测序的方法,选自启动子甲基化、CpG岛甲基化、MSP、HeavyMethyl、MethylLight、Ms-SNuPE的分析,以及依靠检测扩增的DNA的其他方法。

5.如权利要求1至4中任一项所述的方法,其还包括基于将所分析的所述基因区中的所述甲基化频率的相对量与对照基因如GAPDH中的甲基化频率的相对量进行比较,来定量B细胞的相对量。

6.如权利要求1至5中任一项所述的方法,其中所述样品选自:哺乳动物体液,包括人血液样品,或者组织、器官或细胞类型的血液样品,血液淋巴细胞或其部分的样品。

7.如权利要求1至6中任一项所述的方法,其还包括将所述B细胞与选自以下的全部或至少一种细胞类型区分:滤泡辅助T细胞、细胞毒性T细胞、粒细胞、单核细胞、NK细胞和T辅助细胞。

8.如权利要求1至7中任一项所述的方法,其中在没有纯化和/或富集待鉴定的所述细胞的步骤情况下,优选使用全血和/或未经胰蛋白酶消化的组织实施所述方法。

9.如权利要求1至8中任一项所述的方法,其还包括基于所鉴定的所述B细胞来推断所述哺乳动物的免疫状态的步骤。

10.监测哺乳动物中B细胞水平的方法,其包括实施权利要求5至9中任一项所述的方法,以及此外将所鉴定的所述细胞的相对量与早期或平行取自相同哺乳动物的样品和/或与对照样品进行比较。

11.如权利要求1至10中任一项所述的方法,其还包括测量和/或监测响应于提供给所述哺乳动物的化学和/或生物物质的所述B细胞的量。

12.如权利要求1至11中任一项所述的方法,其中所述哺乳动物患有或可能患有自身免疫疾病、移植排斥、感染性疾病、癌症和/或过敏症。

13.试剂盒,其用于基于对LRP5基因区中的CpG位置的亚硫酸氢盐可及性的分析来鉴定、定量和/或监测哺乳动物中的B细胞,所述试剂盒包含用于实施权利要求1至12中任一项所述的方法的组分,特别地,所述试剂盒包含:a)亚硫酸氢盐试剂,和b)用于分析CpG位置的甲基化状态的材料,所述CpG位置选自SEQ ID NO.1所示区中的CpG位置,如选自SEQ IDNO.4-11所示序列的寡聚物中的CpG位置。

14.SEQ ID No.4-11中任一项所示的寡聚物,或者SEQ ID No.1、2或3所示的扩增子。

15.权利要求13所述的试剂盒或者权利要求14所述的寡聚物或扩增子在鉴定、定量和/或监测哺乳动物中的B细胞中的用途。

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