[发明专利]确定pH的方法和组合物

权利要求书

1.一种确定样品中pH的方法，包括：

a)提供核酸复合物，其包含

i)包含以下序列的第一单链核酸分子：

5’-CCCCTAACCCCTAAC*CC*CTAACC*CC*ATATATATCCTAGAACGACAGACAAACAGTGAGTC-3(SEQID NO.8)；

5’-CCC*CTAACC*CCTAACCC*CTAACC*CCATATATATCCTAGAACGACAGACAAACAGTGAGTC-3’(SEQ ID NO.9)；

5’-C*CCCTAACCCC*TAAC*CCCTAACCCC*ATATATATCCTAGAACGACAGACAAACAGTGAGTC-3’(SEQ ID NO.10)；或

5’-C*C*C*C*TAACCCCTAACCCCTAACCCCATATATATCCTAGAACGACAGACAAACAGTGAGTC-3’(SEQ ID NO.11)；

其中C*是5'-溴胞嘧啶或5'-甲基胞嘧啶，且其中所述第一单链核酸分子与作为第一标签的5'-ALEXA 488结合；

和

ii)部分地或全部地与所述第一单链分子互补的第二单链核酸分子，其中所述第二单链核酸分子包括以下核酸序列：

5′-GACTCACTGTTTGTCTGTCGTTCTAGGATAT*ATATTTTGTTATGTGTTATGTGTTAT-3’(SEQ IDNO:19)(I⁴ comp)，且其中T*与作为第二标签的ALEXA 647结合，

其中所述第一标签能够产生信号，其中所述信号的强度作为所述核酸复合物的构象的函数而变化，其反过来取决于样品的pH值；

b)使样品与核酸复合物接触；以及

c)测量所述信号的强度，并且由所测量的信号确定所述pH。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述样品是选自细胞、细胞提取物、细胞裂解物、组织、组织提取物、体液、血清、血液和血液制品的生物样品。

3.根据权利要求1所述的方法，其中所述信号的强度作为以下至少一者的函数而变化：所述第一标签与所述第二标签之间的距离、和所述第一标签与所述第二标签的相对朝向。

4.根据权利要求2所述的方法，其中所述信号的强度作为以下至少一者的函数而变化：所述第一标签与所述第二标签之间的距离、和所述第一标签与所述第二标签的相对朝向。

5.根据权利要求1所述的方法，其中所述样品是包含胞质溶胶或细胞器的细胞区域。

6.根据权利要求5所述的方法，其中所述细胞器包括线粒体、高尔基体、内质网、溶酶体、叶绿体、细胞核或内体。

7.根据权利要求1至4中任一项所述的方法，其中所述核酸复合物还包含靶向部分。

8.根据权利要求1至4中任一项所述的方法，其中所述第一单链核酸分子和/或所述第二单链核酸分子小于200个核苷酸。

9.根据权利要求7所述的方法，其中所述第一单链核酸分子和/或所述第二单链核酸分子小于200个核苷酸。