[发明专利]使用靶向特异性DNA探针在生物样品中进行染色体多重分析的方法和系统在审

专利信息
申请号: 201680033726.2 申请日: 2016-06-23
公开(公告)号: CN107709578A 公开(公告)日: 2018-02-16
发明(设计)人: 拉梅什·瓦拉巴恩尼 申请(专利权)人: 拉梅什·瓦拉巴恩尼
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12Q1/6886
代理公司: 北京银龙知识产权代理有限公司11243 代理人: 金鲜英,张默
地址: 美国佛*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 使用 靶向 特异性 dna 探针 生物 样品 进行 染色体 多重 分析 方法 系统
【权利要求书】:

1.一种使用靶向特异性DNA探针在生物样品中进行染色体多重分析的方法,所述方法包括以下步骤:

a)使多个特定DNA探针与完整间期细胞内的至少一个特定染色体上的特定靶DNA序列结合;

b)将能够发射不同信号的荧光标记与多个DNA探针的部分连接,使得最终的DNA探针产生1至4种荧光信号,由此创建独特的信号,所述独特的信号的特征在于所述独特的信号的组合与任何给定的染色体上的靶标不同;以及

c)使DNA探针与染色体上的靶标杂交。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述特定靶DNA序列在包括DNA片段的至少一条特定染色体上,并且所述完整间期细胞是游离血浆DNA。

3.如权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述杂交选自由以下组成的组:在完整间期细胞上进行一次或多次原位杂交,以及在多孔板的一个或多个孔中进行悬浮杂交。

4.如前述权利要求中任一项所述的方法,其特征在于,所述杂交在单次杂交中可以以24条人染色体中至少一条上的靶标中的一个或多个作为目标。

5.如前述权利要求中任一项所述的方法,进一步包括使用嵌入于荧光显微镜和CCD相机中的特定激发/发射滤色块来记录完整间期细胞内的荧光信号的个体位置的步骤。

6.如前述权利要求中任一项所述的方法,其特征在于,与DNA探针连接的所述荧光标记选自由DEAC dUTP、FITC dUTP、花青素苷3-dUTP、花青素苷5-dUTP、红594 dUTP及其类似物或衍生物组成的组。

7.如前述权利要求中任一项所述的方法,其特征在于,基于每条染色体的预定结构,对至少所述完整间期细胞内不同位置上的DNA探针的个体荧光信号分组和分类成各自的染色体谱。

8.如权利要求1至4中任一项所述的方法,进一步包括将非荧光标记与所述多个DNA探针的部分连接的步骤,使得最终的DNA探针产生化学发光信号,所述化学发光信号的特征在于所述非荧光标记结合于与酶缀合的特定配体,酶-底物反应产生化学发光信号。

9.如权利要求8所述的方法,进一步包括使用荧光计在单个孔中针对来自每个反应的每个靶标记录总荧光强度,或使用光度计在单个孔中针对来自每个反应的每个靶标记录总化学发光强度。

10.如权利要求8或9所述的方法,其特征在于,与DNA探针连接的所述非荧光标记选自由生物素及其类似物或衍生物组成的组。

11.如权利要求10所述的方法,其特征在于,与所述非荧光标记生物素连接的配体-酶复合物可以是亲和素-聚HRP酶。

12.如权利要求11所述的方法,其特征在于,与所述HRP酶反应的底物可以是鲁米诺。

13.如前述权利要求中任一项所述的方法,其特征在于,针对靶标的所述DNA探针选自由人染色体1至22、X和Y组成的组。

14.如前述权利要求中任一项所述的方法,其特征在于,个体染色体谱被组合以便产生完整核型,所述个体染色体谱用于检测数量或结构上的染色体异常。

15.如前述权利要求中任一项所述的方法,其特征在于,所述生物样品的至少一种的来源选自由来自孕妇的外周血、来自癌症患者的外周血以及来自使用人工生殖技术如体外受精产生的胚胎的滋养层细胞组成的组。

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