[发明专利]一种利用Genomic-SSR和EST-SSR两类标记鉴评蝴蝶兰遗传多样性的方法有效
| 申请号: | 201611248966.2 | 申请日: | 2016-12-29 |
| 公开(公告)号: | CN107058487B | 公开(公告)日: | 2019-01-15 |
| 发明(设计)人: | 李佐;肖文芳;陈和明;吕复兵 | 申请(专利权)人: | 广东省农业科学院环境园艺研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 单香杰 |
| 地址: | 510640 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 遗传多样性 蝴蝶兰 引物组合 植物种质资源 标记检测 单一分子 种质 检测 | ||
1.一种鉴评蝴蝶兰遗传多样性的引物组合物,其特征在于,所述引物组合物由2对Genomic-SSR引物和8对EST-SSR引物组成,2对Genomic-SSR引物分别为G-1和G-2,G-1的序列如SEQ ID NO:1~2所示,G-2的序列如SEQ ID NO:3~4所示;8对EST-SSR引物分别为E-1、E-2、E-3、E-4、E-5、E-6、E-7、E-8,E-1的序列如SEQ ID NO:5~6所示,E-2的序列如SEQ IDNO:7~8所示,E-3的序列如SEQ ID NO:9~10所示,E-4的序列如SEQ ID NO:11~12所示,E-5的序列如SEQ ID NO:13~14所示,E-6的序列如SEQ ID NO:15~16所示,E-7的序列如SEQID NO:17~18所示,E-8的序列如SEQ ID NO:19~20所示。
2.权利要求1所述的引物组合物在鉴评蝴蝶兰遗传多样性中的应用。
3.一种鉴评蝴蝶兰遗传多样性的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)提取待分析蝴蝶兰的总DNA;
(2)对权利要求1所述的引物组合物进行荧光标记后,以步骤(1)的DNA为模板分别进行PCR反应;
(3)记录每对引物的扩增峰型,对获得的数据进行分析处理,评价蝴蝶兰种质的遗传多样性。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,提取待分析蝴蝶兰的总DNA时,以蝴蝶兰的嫩根作为提取样本。
5.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述PCR的扩增体系为DNA模板1µl、5µM的上下游引物1µl、5U/µl 的Taq酶0.1µl、缓冲液6µl、加水补充至15µl。
6.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述PCR的扩增程序为95℃,5min;94℃,30sec;58℃,35sec;35个循环;72℃,35sec,60℃,30min;15℃。
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