[发明专利]一种利用SSR标记信息提高林木遗传评估精确度的方法

说明书

本发明公开了一种利用SSR标记信息提高林木遗传评估精确度的方法。该方法采用SSR标记构建的G矩阵进行林木遗传评估，首先测定待检测无性系苗所有个体的地径形成表型数据，并提取所有无性系的DNA，用134对SSR标记进行扩增，将扩增结果记录为0/1的SSR标记数据，然后计算无性系间的遗传一致性，计算其逆矩阵作为无性系的G矩阵；对表型数据进行分析，结合S4构建的G矩阵，估算环境误差和遗传方差，根据重复力公式计算求得重复力估计值。本发明的方法可精确提高林木遗传评估的效果，且无需依赖传统谱系的信息，不受遗传材料谱系信息的限制，试验材料无树种和试验林类型的限制，应用前景好。

技术领域

本发明属于林木遗传育种技术领域。更具体地，涉及一种利用SSR标记信息提高林木遗传评估精确度的方法。

背景技术

林木遗传改良需要通过田间对比试验和性状测定，以估算各种遗传参数和评价种源、家系、单株或无性系的表现，来培育符合林业生产需求的林木良种。对于通过一定交配设计获得的子代，可以利用谱系信息通过个体模型来估算更多的遗传参数(林元震和陈晓阳，R与ASReml-R统计分析教程，北京：中国林业出版社，2014)。然而对于种源试验或者无性系测定，谱系信息往往不清晰，即便是谱系清晰的子代测定，由于谱系提供的分子亲缘关系矩阵信息比较有限，从而导致林木遗传评估的精确度不够高，进而影响林木良种选育的可靠性。因此，有必要寻找一种提高林木遗传评估精确度的方法。

与其它分子标记技术相比，SSR标记具有易检测、共显性遗传、重复性好、数量丰富和多态性高以及遍布整个基因组等优点，在植物遗传研究中得到广泛应用(Schlotterer C2004.The evolution of molecular markers just amatter of fashion.Nat RevGenet,5:63～69)。但是，SSR标记以往多用于植物遗传图谱构建、比较作图、种质遗传多样性评价和亲缘关系鉴定的研究(林元震,郭海,刘纯鑫,刘天颐,黄少伟,陈晓阳.EST-SSR标记在木本植物中的开发和应用.植物生理学通讯,2009,45(12):1221-1225)。目前，未见有利用SSR标记信息提高林木遗传评估精确度的报道，发明一种精确提高林木遗传评估的分析方法迫在眉睫。

发明内容

本发明要解决的技术问题是克服现有的试验设计进行遗传评估时，不能提供谱系信息或者谱系信息比较有限时，无法精确估算遗传方差，进而不能准确估算林木遗传参数的问题，提供一种利用SSR标记信息提高林木遗传评估精确度的方法，采用SSR标记构建的G矩阵进行林木遗传评估，精确的林木遗传评估，无论对于良种选育或者良种鉴定，都非常重要。

本发明的目的是提供一种利用SSR标记信息提高林木遗传评估精确度的方法。

本发明上述目的通过以下技术方案实现：

一组能够提高林木遗传评估精确度的SSR标记，包括134对SSR标记，其上下游引物序列依次分别如SEQ ID NO.1～268所示。

所述SSR标记在提高林木遗传评估精确度方面的应用，也在本发明的保护范围之内。

一种利用SSR标记信息提高林木遗传评估精确度的方法，是采用SSR标记构建的G矩阵进行林木遗传评估。

具体地，所述利用SSR标记信息提高林木遗传评估精确度的方法，即采用SSR标记构建的G矩阵进行林木遗传评估的方法，包括如下步骤：

S1：测定若干个(如11个左右)待检测无性系盆栽苗所有个体的地径，形成表型数据；

S2：提取所有无性系的DNA，用134对SSR标记进行扩增，将扩增结果记录为0/1的SSR标记数据；

S3：根据SSR标记数据，计算无性系间的遗传一致性；

S4：根据无性系间的遗传一致性系数，计算其逆矩阵，作为无性系的G矩阵；