[发明专利]一种凡纳滨对虾生长相关的分子标记及其应用在审

专利信息
申请号: 201611216512.7 申请日: 2016-12-26
公开(公告)号: CN106834439A 公开(公告)日: 2017-06-13
发明(设计)人: 李富花;王全超;于洋;相建海 申请(专利权)人: 中国科学院海洋研究所
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 沈阳科苑专利商标代理有限公司21002 代理人: 马驰
地址: 266071*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 一种 凡纳滨 对虾 生长 相关 分子 标记 及其 应用
【说明书】:

发明属于水产育种技术领域,具体涉及一种凡纳滨对虾生长相关的分子标记及其应用。该标记位于SEQM1286的109bp位置,为T/C型突变,在该标记中CC基因型个体的生长速度高于TT基因型,提示CC基因型为生长优势基因型。本发明标记可以作为对虾育种的分子标记辅助对虾的遗传选育。

技术领域

本发明属于水产动物育种领域,具体涉及一种凡纳滨对虾生长相关的分子标记及其应用。

背景技术

凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei),又称南美白对虾(white Pacificshrimp),是我国乃至世界养殖产量最高的对虾品种,也是世界重要的经济贸易品种。由于其生长速度快、抗病力强,且经过淡化后可以在内陆低盐度甚至淡水区域养殖,因此该品种在我国的南北方和沿海内陆地区广泛养殖,我国每年的产量达100多万吨。

良种是凡纳滨对虾产业健康发展的基础和推动力,人工选育是培育生长速度快、成活率高的凡纳滨对虾良种的重要方法,然而,人工选育的周期长,成本高,且选择准确率易受到环境等外界因素的影响。分子标记辅助育种是指通过QTL定位或者关联分析的方法,挖掘出与性状直接相关的分子标记,实现对目标性状的直接选择,可以极大地提高选育效率和准确率。在对虾中,研究人员通过QTL定位方法定位到了若干生长相关的QTL位点,如在在日本对虾生长速度QTL定位中,研究人员定位到了一个与生长性状相关的主效AFLP标记,之后通过图位克隆的方法找到一个与生长相关的基因ELOVL(Elongation of very longchain fatty acids-like)(Lyons RE,Dierens LM,Tan SH,Preston NP,LiY.Characterization of AFLP markers associated with growth in the kurumaprawn,Marsupenaeus japonicus,and identification of a candidate gene.MarBiotechnol,2007,9:712-721),在凡纳滨对虾QTL定位中,也发现了生长相关的QTL位点(Andriantahina F,Liu X,Huang H.Genetic map construction and quantitativetrait locus(QTL)detection of growth-related traits in Litopenaeus vannameifor selective breeding applications.PLoS One,2013,8:e75206),但是并没有定位到与生长直接相关的基因或标记。因此在本发明旨在提供一种与生长性状显著相关的标记,该标记可以用作凡纳滨对虾生长性状的辅助选育。

发明内容

本发明的目的是提供一种与凡纳滨对虾生长相关的分子标记,并应用于对虾生长快品种的辅助培育。

为实现上述目的,本发明采用技术方案为:

一种与凡纳滨对虾生长相关的分子标记,与对虾生长性状显著相关的分子标记位于SEQ1286DNA序列的109bp位置,该标记为T/C型SNP标记。

进一步,一种用于检测所述的与对虾生长相关的分子标记的引物对,其特征在于:引物对为:

M1286F:GCGGGTCTTTTCCTCCTTCT

M1286R:GCCCATCTTCGCACTTCTTTC

进一步地,与对虾生长相关的分子标记的应用,CC基因型个体的生长速度高于TT基因型,在对虾育种过程中,通过SNP分型方法将该标记分型后,选择CC基因型个体进行留种,能够辅助实现生长性状的选择。

本发明所具有的优点:本方法提供的生长相关的分子标记能够从分子水平上对生长快个体进行选择,不受外界环境及个体大小的限制,能够在早期对生长快个体进行选择,提高选择的效率和准确率。

附图说明

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