[发明专利]一种水稻抗稻瘟病基因Pi2的功能分子标记Pi2-1及应用

权利要求书

1.一种检测水稻抗稻瘟病基因Pi2的功能分子标记Pi2-1的方法，其特征在于，包括以下步骤：

1)通过PCR法扩增及测序，获得水稻抗稻瘟病基因Pi2的1个抗病等位基因与1个感病等位基因序列；

2)将步骤1)所获得的序列进行比对，得到水稻抗稻瘟病基因Pi2的第1543-1545位点处存在ACA 3个碱基缺失，该差异位于Pi2基因的外显子；

3)利用引物对SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2对不同水稻的总DNA进行PCR扩增反应，所得扩增产物进行电泳检测验证，获得与水稻抗稻瘟病基因Pi2呈特异性带型的核苷酸片段；由引物对SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所扩增的抗稻瘟病基因Pi2的DNA片段包含水稻抗稻瘟病基因Pi2基因组序列的第1543-1545位核苷酸，该DNA片段即为水稻抗稻瘟病基因Pi2的功能分子标记Pi2-1；

4)对步骤3)所获得的功能分子标记扩增产物在不同的水稻品种中进行带型显色和基因型分型，若扩增产物为长度65bp的单一条带，则水稻品种为抗稻瘟病品种；若扩增产物为65bp和62bp两条带，则水稻品种为感稻瘟病品种。

2.根据权利要求1所述的一种检测水稻抗稻瘟病基因Pi2的功能分子标记Pi2-1的方法，其特征在于，所述步骤3)中的PCR扩增反应的反应体系如下：

3.根据权利要求1所述的一种检测水稻抗稻瘟病基因Pi2的功能分子标记Pi2-1的方法，其特征在于，所述电泳检测使用8％聚丙烯酰胺凝胶，凝胶组成如下：

4.检测水稻抗稻瘟病基因Pi2的功能分子标记Pi2-1的引物在筛选和鉴定水稻稻瘟病抗性品种中的应用，其特征在于，所述功能分子标记Pi2-1为利用引物对SEQ ID NO.1和SEQID NO.2扩增得到的含有水稻抗稻瘟病基因Pi2基因组序列第1543-1545位核苷酸的与水稻稻瘟病抗性相关的DNA片段；由引物对SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2从水稻基因组中扩增出抗稻瘟病基因Pi2的DNA片段，经电泳检测DNA片段大小，若扩增产物为长度65bp的单一条带，则水稻品种为抗稻瘟病品种；若扩增产物为65bp和62bp两条带，则水稻品种为感稻瘟病品种。