[发明专利]一种用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合以及应用和方法有效
| 申请号: | 201611169209.6 | 申请日: | 2016-12-16 |
| 公开(公告)号: | CN106755396B | 公开(公告)日: | 2019-12-06 |
| 发明(设计)人: | 曹有龙;尹跃;赵建华;安巍 | 申请(专利权)人: | 宁夏农林科学院枸杞工程技术研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司: | 11371 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人: | 钱学宇<国际申请>=<国际公布>=<进入 |
| 地址: | 750000 宁夏回族*** | 国省代码: | 宁夏;64 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 枸杞 构建 毛细管电泳技术 数据分析处理 电泳分辨率 基因测序 结果基础 理论支持 引物组合 应用研究 灵敏度 多态性 可用 筛选 应用 开发 | ||
本发明提供了一种用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合以及应用和方法,属于DNA指纹图谱技术领域。本发明在枸杞基因测序结果基础上首次开发筛选出了具有多态性的15个SSR引物对,该15个SSR引物对可用于构建枸杞DNA指纹图谱,并结合毛细管电泳技术构建得到的枸杞DNA指纹图谱,具有电泳分辨率高、灵敏度高、数据分析处理便捷等特点,为DNA指纹图谱的在枸杞上的进一步应用研究提供了坚实的理论支持。
技术领域
本发明涉及DNA指纹图谱技术领域,具体而言,涉及一种用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合以及应用和方法。
背景技术
枸杞是我国传统的中药材,在中药材领域具有重要的地位。宁夏作为枸杞地道产区,枸杞种植历史悠久,在枸杞育种、栽培、加工等方面成果颇丰。近年来,随着枸杞育种方法的不断进步,新的枸杞品种也不断涌现,这些枸杞种质资源有许多优异品种未能被合理利用。因此,将这些枸杞种质资源进行有效分类和鉴定,对枸杞种质资源的研究、品种创新尤为重要。
DNA指纹图谱技术对植物品种进行分离和鉴定的有效手段。DNA指纹图谱是指DNA样品用特定分子标记技术处理显示出具有特定DNA片段的总称。DNA指纹图谱技术最早用于在刑侦或亲子鉴定上确定人的身份,而后随着生物技术的进步与发展,DNA指纹图谱技术在很多植物上得到广泛的应用。目前,常用于构建DNA指纹图谱的分子标记有SSR、AFLP、SRAP、SCoT、RAPD、SNP以及ISSR。不同分子标记构建的DNA指纹图谱各有其特点。其中,以ISSR、SSR、SRAP应用最广泛。
目前,DNA指纹图谱的在枸杞上的应用研究并不多,由其是以SSR分子标记技术来构建枸杞DNA指纹图谱的更未见报道。
发明内容
本发明的目的在于提供一种用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合,该引物组合可用于构建出枸杞DNA指纹图谱。
本发明的另一目的在于提供上述引物组合在构建枸杞DNA指纹图谱中的应用。
本发明的另一目的在于提供构建枸杞DNA指纹图谱的方法,该方法所构建出的枸杞DNA指纹图谱能够准确反应出枸杞DNA指纹图谱的信息。
本发明的另一目的在于提供采用上述方法得到的枸杞DNA指纹图谱在鉴定枸杞种质资源中的应用。
本发明是这样实现的:
一种用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合,其包括第1-15引物对,上述第1-15引物对的碱基序列分别如SEQ ID NO.1-2、SEQ ID NO.3-4、SEQ ID NO.5-6、SEQ ID NO.7-8、SEQ ID NO.9-10、SEQ ID NO.11-12、SEQ ID NO.13-14、SEQ ID NO.15-16、SEQ ID NO.17-18、SEQ ID NO.19-20、SEQ ID NO.21-22、SEQ ID NO.23-24、SEQ ID NO.25-26、SEQ IDNO.27-28、SEQ ID NO.29-30所示。
上述的用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合在构建枸杞DNA指纹图谱中的应用。
一种构建枸杞DNA指纹图谱的方法,其包括:用上述的用于构建枸杞DNA指纹图谱的引物组合的第1-15引物对分别对多个枸杞种质的DNA进行PCR扩增,得到扩增产物;
将上述扩增产物分别进行电泳,得到扩增带型数;
将上述扩增带型数进行编码处理,得到每一种上述枸杞种质的DNA对应上述第1-15引物对的第1-15编号,串联上述第1-15编号形成字符串。
上述的构建枸杞DNA指纹图谱的方法所得到的枸杞DNA指纹图谱在鉴定枸杞种质资源中的应用。
与现有技术相比,本发明的有益效果是:
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