[发明专利]一种判定中国人群rs125055单核苷酸多态性与儿童IBD之间的相关性的方法

权利要求书

1.一种判定中国人群rs125055单核苷酸多态性与儿童IBD之间的相关性的方法，其特征在于，所述方法是非标记探针的高分辨率溶解曲线法。

2.如权利要求1所述的判定中国人群rs125055单核苷酸多态性与儿童IBD之间的相关性的方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤：

(1)基因分型：取外周血基因组DNA，鉴定其基因型；

(2)统计学分析：单核苷酸多态性与疾病相关性分析通过儿童IBD患者与正常人群次等位基因频率比较，以及用卡方检验或Fisher’s精确概率法得出的Hardy-Weinberg平衡定律结果来分析，P值小于0.05认为是有统计学意义；

(3)针对ZMIZ1内含子区域的rs1250550设计非标记探针，用于鉴别三种基因型的单核苷酸多态性，所述rs1250550的扩增序列如SEQID NO:1所示。

3.如权利要求2所述的判定中国人群rs125055单核苷酸多态性与儿童IBD之间的相关性的方法，其特征在于，所述步骤(1)基因分型的具体流程为：

首先进行PCR，20mL体系含基因组DNA模板20ng，1′PCR缓存液(Takara，Japan)，200mM dNTPs，0.5U rTaq DNA聚合酶(Takara，Japan)，0.05mM正向引物，0.5mM反向引物。PCR反应在Bio-Rad S1000PCR仪上进行(Bio-Rad，美国)；

PCR扩增条件如下：94℃预变性2分钟，继之进行50个循环，包括94℃变性30s，55℃退火30s，72℃延伸20s，最后72℃延伸5min；

反应结束后，转移10mL PCR产物到HR-1专用的毛细管中，再加入1mL LCGreen Plus染料(Idaho Technology，USA)，最后以HRM in CFX96实时荧光系统C1000Thermal Cycler(Bio-Rad，美国)进行检测；

Rs1250550引物序列为：正向SEQ ID NO:2，反向SEQ ID NO:3。