[发明专利]一种提升测序平台文库拆分率的标签序列混库方法和装置有效

专利信息
申请号: 201610962942.7 申请日: 2016-10-28
公开(公告)号: CN108018607B 公开(公告)日: 2021-04-27
发明(设计)人: 刘舒;伍梓靖 申请(专利权)人: 深圳华大基因股份有限公司
主分类号: C40B20/04 分类号: C40B20/04;C12Q1/6869
代理公司: 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 代理人: 孙银行;彭家恩
地址: 518083 广东省深圳市盐田*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 提升 平台 文库 拆分 标签 序列 方法 装置
【权利要求书】:

1.一种提升测序平台文库拆分率的标签序列混库方法,其特征在于,所述方法包括:

将多个标签序列中每个位置的A、C碱基替换为同一个符号,将G、T碱基替换为另一个符号,从而将每个标签序列转换成由两种符号表示的序列;

选取标签序列转换后两两标签序列在大于2个位置有差异的序列进行混库。

2.根据权利要求1所述的标签序列混库方法,其特征在于,将标签序列中每个位置的A、C碱基替换为符号A,将G、T碱基替换为符号B。

3.根据权利要求1所述的标签序列混库方法,其特征在于,所述标签序列的长度是4-10个碱基。

4.根据权利要求3所述的标签序列混库方法,其特征在于,所述标签序列的长度是6-8个碱基。

5.根据权利要求1所述的标签序列混库方法,其特征在于,选取二者转换后在≥4个位置有差异的序列进行混库。

6.根据权利要求1-5任一项所述的标签序列混库方法,其特征在于,所述测序平台是Illumina Hiseq/Miseq测序平台。

7.一种提升测序平台文库拆分率的标签序列混库装置,其特征在于,所述装置包括:

序列转换单元,用于将多个标签序列中每个位置的A、C碱基替换为同一个符号,将G、T碱基替换为另一个符号,从而将每个标签序列转换成由两种符号表示的序列;

序列比对单元,用于选取标签序列转换后两两标签序列在大于2个位置有差异的序列进行混库。

8.根据权利要求7所述的标签序列混库装置,其特征在于,将标签序列中每个位置的A、C碱基替换为符号A,将G、T碱基替换为符号B。

9.根据权利要求7所述的标签序列混库装置,其特征在于,所述标签序列的长度是4-10个碱基。

10.根据权利要求9所述的标签序列混库装置,其特征在于,所述标签序列的长度是6-8个碱基。

11.根据权利要求7所述的标签序列混库装置,其特征在于,选取二者转换后在≥4个位置有差异的序列进行混库。

12.根据权利要求7-11任一项所述的标签序列混库装置,其特征在于,所述测序平台是Illumina Hiseq/Miseq测序平台。

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