[发明专利]一种提升测序平台文库拆分率的标签序列混库方法和装置有效
申请号: | 201610962942.7 | 申请日: | 2016-10-28 |
公开(公告)号: | CN108018607B | 公开(公告)日: | 2021-04-27 |
发明(设计)人: | 刘舒;伍梓靖 | 申请(专利权)人: | 深圳华大基因股份有限公司 |
主分类号: | C40B20/04 | 分类号: | C40B20/04;C12Q1/6869 |
代理公司: | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人: | 孙银行;彭家恩 |
地址: | 518083 广东省深圳市盐田*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 提升 平台 文库 拆分 标签 序列 方法 装置 | ||
1.一种提升测序平台文库拆分率的标签序列混库方法,其特征在于,所述方法包括:
将多个标签序列中每个位置的A、C碱基替换为同一个符号,将G、T碱基替换为另一个符号,从而将每个标签序列转换成由两种符号表示的序列;
选取标签序列转换后两两标签序列在大于2个位置有差异的序列进行混库。
2.根据权利要求1所述的标签序列混库方法,其特征在于,将标签序列中每个位置的A、C碱基替换为符号A,将G、T碱基替换为符号B。
3.根据权利要求1所述的标签序列混库方法,其特征在于,所述标签序列的长度是4-10个碱基。
4.根据权利要求3所述的标签序列混库方法,其特征在于,所述标签序列的长度是6-8个碱基。
5.根据权利要求1所述的标签序列混库方法,其特征在于,选取二者转换后在≥4个位置有差异的序列进行混库。
6.根据权利要求1-5任一项所述的标签序列混库方法,其特征在于,所述测序平台是Illumina Hiseq/Miseq测序平台。
7.一种提升测序平台文库拆分率的标签序列混库装置,其特征在于,所述装置包括:
序列转换单元,用于将多个标签序列中每个位置的A、C碱基替换为同一个符号,将G、T碱基替换为另一个符号,从而将每个标签序列转换成由两种符号表示的序列;
序列比对单元,用于选取标签序列转换后两两标签序列在大于2个位置有差异的序列进行混库。
8.根据权利要求7所述的标签序列混库装置,其特征在于,将标签序列中每个位置的A、C碱基替换为符号A,将G、T碱基替换为符号B。
9.根据权利要求7所述的标签序列混库装置,其特征在于,所述标签序列的长度是4-10个碱基。
10.根据权利要求9所述的标签序列混库装置,其特征在于,所述标签序列的长度是6-8个碱基。
11.根据权利要求7所述的标签序列混库装置,其特征在于,选取二者转换后在≥4个位置有差异的序列进行混库。
12.根据权利要求7-11任一项所述的标签序列混库装置,其特征在于,所述测序平台是Illumina Hiseq/Miseq测序平台。
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