[发明专利]一种基于Cpf1的DNA体外拼接方法有效

专利信息
申请号: 201610877438.7 申请日: 2016-09-30
公开(公告)号: CN107881184B 公开(公告)日: 2021-08-27
发明(设计)人: 王金;雷超;赵国屏 申请(专利权)人: 中国科学院分子植物科学卓越创新中心
主分类号: C12N15/63 分类号: C12N15/63;C12N15/10;C12P19/34
代理公司: 上海一平知识产权代理有限公司 31266 代理人: 崔佳佳;马莉华
地址: 200032 上*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 cpf1 dna 体外 拼接 方法
【权利要求书】:

1.一种核酸构建物,其特征在于,所述的核酸构建物包括:

(a)第一核酸构建物,所述第一核酸构建物为双链DNA构建物,并且所述第一核酸构建物的序列中含有至少一个式I所示的Cpf1识别切割元件;

D1-D2-D3 (I)

式中,

D1为前间区序列邻近基序PAM;

D2为长度N2个核苷酸的Cpf1识别区,其中,N2为正整数17;

D3为长度为N3个核苷酸的Cpf1切割区,其中,N3为5或8;

以及

(b)第二核酸构建物,所述第二核酸构建物为RNA构建物,并且所述所述第二核酸构建物为结构如式II所示的crRNA元件;

R1-R2-R3 (II)

式中,

R1为5'的发夹区;

R2为长度M2个核苷酸的、与D2互补的Cpf1识别引导区,其中M2为正整数17;

R3为无。

2.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,所述的核酸构建物还包括:

(c)第三核酸构建物,所述第三核酸构建物为DNA构建物,并且所述第三核酸构建物的序列中含有至少一个式III所示的Cpf1识别切割元件;

E1-E2-E3 (III)

式中,

E1为前间区序列邻近基序PAM;

E2为长度N2个核苷酸的Cpf1识别区,其中,N2为正整数17;

E3为长度为N3个核苷酸的Cpf1切割区,其中,N3为5或8。

3.如权利要求2所述的核酸构建物,其特征在于,所述的构建物还包括:

(d)第四核酸构建物,所述第四核酸构建物为RNA构建物,并且所述所述第四核酸构建物为结构如式IV所示的crRNA元件;

S1-S2-S3 (IV)

式中,

S1为5'的发夹区;

S2为长度M2个核苷酸的、与E2互补的Cpf1识别引导区,其中M2为正整数17;

S3为无。

4.如权利要求3所述的核酸构建物,其特征在于,所述的式I所示的Cpf1识别切割元件与式III所示的Cpf1识别切割元件是相同的;和/或

所述的如式II所示的crRNA元件与式IV所示的crRNA元件是相同的。

5.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,所述的第一核酸构建物中含有2个或多个式I所示的Cpf1识别切割元件;和/或

所述的第三核酸构建物中含有2个或多个式III所示的Cpf1识别切割元件。

6.如权利要求2所述的核酸构建物,其特征在于,所述的第三核酸构建物中含有2个或多个式I所示的Cpf1识别切割元件。

7.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,所述的第一核酸构建物包括表达载体、核酸片段、质粒、染色体片段。

8.如权利要求2所述的核酸构建物,其特征在于,所述的第三核酸构建物包括核酸片段、质粒。

9.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,所述的第一核酸构建物包括一种或多种第一核酸构建物。

10.如权利要求2所述的核酸构建物,其特征在于,所述的第三核酸构建物包括一种或多种第三核酸构建物。

11.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,所述的R1的长度为M1个核苷酸,M1为20-32的正整数。

12.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,N2=M2。

13.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,N2为17。

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