[发明专利]一种基于Cpf1的DNA体外拼接方法有效
| 申请号: | 201610877438.7 | 申请日: | 2016-09-30 |
| 公开(公告)号: | CN107881184B | 公开(公告)日: | 2021-08-27 |
| 发明(设计)人: | 王金;雷超;赵国屏 | 申请(专利权)人: | 中国科学院分子植物科学卓越创新中心 |
| 主分类号: | C12N15/63 | 分类号: | C12N15/63;C12N15/10;C12P19/34 |
| 代理公司: | 上海一平知识产权代理有限公司 31266 | 代理人: | 崔佳佳;马莉华 |
| 地址: | 200032 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基于 cpf1 dna 体外 拼接 方法 | ||
1.一种核酸构建物,其特征在于,所述的核酸构建物包括:
(a)第一核酸构建物,所述第一核酸构建物为双链DNA构建物,并且所述第一核酸构建物的序列中含有至少一个式I所示的Cpf1识别切割元件;
D1-D2-D3 (I)
式中,
D1为前间区序列邻近基序PAM;
D2为长度N2个核苷酸的Cpf1识别区,其中,N2为正整数17;
D3为长度为N3个核苷酸的Cpf1切割区,其中,N3为5或8;
以及
(b)第二核酸构建物,所述第二核酸构建物为RNA构建物,并且所述所述第二核酸构建物为结构如式II所示的crRNA元件;
R1-R2-R3 (II)
式中,
R1为5'的发夹区;
R2为长度M2个核苷酸的、与D2互补的Cpf1识别引导区,其中M2为正整数17;
R3为无。
2.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,所述的核酸构建物还包括:
(c)第三核酸构建物,所述第三核酸构建物为DNA构建物,并且所述第三核酸构建物的序列中含有至少一个式III所示的Cpf1识别切割元件;
E1-E2-E3 (III)
式中,
E1为前间区序列邻近基序PAM;
E2为长度N2个核苷酸的Cpf1识别区,其中,N2为正整数17;
E3为长度为N3个核苷酸的Cpf1切割区,其中,N3为5或8。
3.如权利要求2所述的核酸构建物,其特征在于,所述的构建物还包括:
(d)第四核酸构建物,所述第四核酸构建物为RNA构建物,并且所述所述第四核酸构建物为结构如式IV所示的crRNA元件;
S1-S2-S3 (IV)
式中,
S1为5'的发夹区;
S2为长度M2个核苷酸的、与E2互补的Cpf1识别引导区,其中M2为正整数17;
S3为无。
4.如权利要求3所述的核酸构建物,其特征在于,所述的式I所示的Cpf1识别切割元件与式III所示的Cpf1识别切割元件是相同的;和/或
所述的如式II所示的crRNA元件与式IV所示的crRNA元件是相同的。
5.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,所述的第一核酸构建物中含有2个或多个式I所示的Cpf1识别切割元件;和/或
所述的第三核酸构建物中含有2个或多个式III所示的Cpf1识别切割元件。
6.如权利要求2所述的核酸构建物,其特征在于,所述的第三核酸构建物中含有2个或多个式I所示的Cpf1识别切割元件。
7.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,所述的第一核酸构建物包括表达载体、核酸片段、质粒、染色体片段。
8.如权利要求2所述的核酸构建物,其特征在于,所述的第三核酸构建物包括核酸片段、质粒。
9.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,所述的第一核酸构建物包括一种或多种第一核酸构建物。
10.如权利要求2所述的核酸构建物,其特征在于,所述的第三核酸构建物包括一种或多种第三核酸构建物。
11.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,所述的R1的长度为M1个核苷酸,M1为20-32的正整数。
12.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,N2=M2。
13.如权利要求1所述的核酸构建物,其特征在于,N2为17。
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