[发明专利]一种大银鱼与太湖新银鱼的分子鉴别方法有效
申请号: | 201610829411.0 | 申请日: | 2016-09-18 |
公开(公告)号: | CN106399500B | 公开(公告)日: | 2019-06-28 |
发明(设计)人: | 李大命;张彤晴;潘建林;唐晟凯;刘燕山;钟立强;刘小维 | 申请(专利权)人: | 江苏省淡水水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人: | 傅婷婷;瞿网兰 |
地址: | 210017 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 银鱼 大银鱼 基因组DNA 分子鉴别 位点 鉴别 分子遗传鉴别 分子生物学 结果稳定性 扩增产物 有效地 重复率 测序 碱基 基因 填补 | ||
1.一种大银鱼与太湖新银鱼的分子遗传鉴别方法,其特征在于包含以下步骤:
(1)分别提取待鉴定的大银鱼与太湖新银鱼基因组DNA;
(2)以提取的基因组DNA为模板,PCR扩增大银鱼与太湖新银鱼的细胞色素b基因Ctyb;用于PCR扩增大银鱼与太湖新银鱼的细胞色素b基因的上游引物为L14321:SEQ ID NO.1,下游引物为H15634:SEQ ID NO.2;
(3)扩增产物纯化后,直接测序,Cytb基因第45位点碱基是T的为大银鱼,若该位点是C的为太湖新银鱼;所述的Cytb基因序列如下:
ATGGCCAACCTCCGAAAAACTCACCCTTTGCTGAAAATGACTAATCACGCTTTAGTCGACCTACCTGCCCCTTCAAACCTTTCAGTTTGGTGAAACTTTGGCTCCCTTTTGGGAATCTGCCTAGTTCTCCAAATCCTAACAGGCCTATTCATGGCCATGCACTACGCCCCCGAAACCGCGAATGCATTCTCTTCTGTCGCCCACATATGTCGGGACGTCAACAACGGCTGACTAATACGCAACATGCATGCCAACGGAGCATCTTTCTTCTTCATCTGTGTTTACCTCCACATCGGCCGAGGTCTTTACTACGGCTCATACCTTTACCAAGCAACATGAAATGTTGGAGTAGTCCTTCTCCTCCTGCTAATAATAACTGCCTTTGTAGGCTACGTCCTCCCCTGAGGACAAATGTCGTTCTGAGGGGCAACAGTAATCACCAACCTCCTCTCTGCCGCCCCCTACGTGGGATTCGACCTAGTTTTATGACTATGAGGGGGGTTCTCTGTAGACAATGCCACCCTCACTCGATTCTTCGCCTTCCACTTCATTCTCCCTTTCATCATTGCCGCCGCCACTGTCATTCACCTCCTTTTCCTCCACGAAACGGGATCAAACAACCCACTTGGCCTTAGCTCAGACGTAGATAAAATCCCTTTCTTGCCATACTATATTATCAAGGACGTAGTCGGCTTCCTAGTCTTTTTCCTCGCCTTCTTCTCAATCACCCTGTTCTTCCCCAACCTCCTCGGCGACCCAGATAATTTTACAGAGGCCAACCCCCTCGTCACCCCAGCCCACATTAAACCTGAGTGGTACTTTCTTTTCGCCTACGCTATCCTCCGGTCTATTCCCAGCAAACTGGGCGGTGTTTTAGCCCTCCTCTTCTCTATCCTGGTGCTCCTTCTAGTGCCATTCCTTCACACCTCTAAACAGCAAGGCCTAGCTTTTCGCCCACTCACCCAACTACTCTTCTGGTCTCTCGTGGCTGATGTTTTTATCCTTACATGAATCGGGGGAATACCTGTAGAACACCCCTACATCGTAATTGGCCAAATTGCTTCCGTAATCTACTTCTCCATCTTCCTGATTCTTTTCCCCTTTGTAGGCTGGGCCGAAAATAAAATCCTCAAATGAGCCT。
2.根据权利要求1所述的分子遗传鉴别方法,其特征在于PCR反应体系为50μL: 100ng/μL的模板DNA 1μL,PCR缓冲液 5μL,dNTP混合液4μL ,每种dNTP 0.1mmol/L, 10 μmol/L的上、下游引物各1μL,2μL 2.5 IU的Taq酶;双蒸水36μL;所述的PCR缓冲液由10mmol/L Tris-HCl,pH9.0, 0.5mmol/L KCl,30mmol/L MgCl2,0.01%(w/v)明胶组成。
3.根据权利要求1所述的分子遗传鉴别方法,其特征在于PCR扩增反应程序为:94 ℃预变性4 min,94 ℃变性40 s,55 ℃退火40 s,72 ℃延伸90 s,经35个循环后再72 ℃延伸10min。
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