[发明专利]链霉菌重组质粒pIJ8600‑attM及其构建方法和其应用在审

专利信息
申请号: 201610697539.6 申请日: 2016-08-19
公开(公告)号: CN106591348A 公开(公告)日: 2017-04-26
发明(设计)人: 林岚 申请(专利权)人: 东南大学
主分类号: C12N15/76 分类号: C12N15/76;C12N15/66;C12N1/21;A01N63/02;A01P1/00;C12R1/01;C12R1/465
代理公司: 南京瑞弘专利商标事务所(普通合伙)32249 代理人: 陈国强
地址: 211189 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 霉菌 重组 质粒 pij8600 attm 及其 构建 方法 应用
【权利要求书】:

1.一种重组质粒,其特征在于:所述质粒是基于大肠杆菌-链霉菌穿梭质粒pIJ8600,采用限制性酶切以及DNA连接原理,插入了功能性的解酯酶基因attM片段构建而成;它包含来源于pUC18质粒的DNA复制起点(ori)、便于在大肠杆菌与链霉菌中筛选的阿泊拉霉素(Apra)抗性标记aac(3)IV、便于接合DNA转移到受体细胞的源于RK2质粒的转移起点(oriT)、多个限制性酶切位点组成的多克隆位点(MCS)、紧挨着多克隆位点(MCS)上游的由硫链丝菌素诱导驱动的强启动子tipAp以及位于多克隆位点(MCS)下游的转录终止子tfd以防止转录的通读;它还包含如上所述的解酯酶基因attM。

2.根据权利要求1所述的重组质粒,其特征在于:所述多个限制性酶切位点包括NdeI,XbaI,BamHI,BglII。

3.根据权利要求1所述的重组质粒,其特征在于:所述解酯酶基因attM的核苷酸序列见DNA序列数据库Genbank,登录号U59485,该基因全长为771bp,G+C含量为57%,编码256个氨基酸的解酯酶蛋白。

4.一种根据权利要求1所述的重组质粒的构建方法,其特征在于:经PCR扩增从根癌农杆菌Agrobacterium tumefaciens C58菌株得到的解酯酶基因attM编码区序列(CDS)与NdeI/BglII双酶切后的pIJ8600载体进行连接,获得携带attM的重组质粒pIJ8600-attM,插入的attM编码序列置于tipAp启动子之下,受硫链丝菌素的驱动而表达。

5.根据权利要求4所述的重组质粒的构建方法,其特征在于:该构建方法的具体步骤为:

步骤a,attM基因片段的克隆:

采用逆转录-PCR技术从根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)C58中扩增得到;用质量浓度1%琼脂糖凝胶电泳切胶回收目的条带,其中,琼脂糖凝胶电泳采用DNA凝胶回收试剂盒,DNA溶于pH为8.0、浓度为10MTris-HCl缓冲液中,贮于-20℃;

步骤b,限制性酶切:

上述纯化的PCR产物进行Nde I和Bgl II双酶切,酶切产物经质量浓度1%琼脂糖凝胶电泳、切胶回收;

pIJ8600质粒用Nde I和Bgl II双酶切;酶切产物经0.8%琼脂糖凝胶电泳、切胶回收;

步骤c,酶切的pIJ8600质粒与attM基因的连接:

酶切的attM基因片段与同样酶切的pIJ8600质粒进行DNA连接,16℃温育过夜;

步骤d,转化大肠杆菌DH5α克隆宿主:

上述全量连接反应产物通过化学转化法转入E.coli DH5α中;

步骤e,菌落PCR以及测序验证:

挑取LB/Apra平板上转化子10个,振荡培养6–8h,取1μl菌液作为模板进行菌落PCR鉴定;

经菌落PCR鉴定正确的转化子进行所插入基因attM的测序。

6.一种根据权利要求1所述的重组质粒在链霉菌QS信号分子γ-丁内酯的降解中的应用。

7.根据权利要求6所述的用途,其特征在于:包括:

(1)将其转化非致病性链霉菌(non-pathogenic Streptomycetes),然后返接到敏感宿主,以携带pIJ8600-attM质粒的非致病性链霉菌为媒介,发挥群感淬灭作用,精准摧毁病原链霉菌的致病性;

(2)携带pIJ8600-attM质粒的非致病性链霉菌用于空气、水体等环境中,某些放线菌所产有毒次生代谢物之清除。

8.根据权利要求7所述的用途,其特征在于:所述用途(1)中,所述病原链霉菌为疮痂链霉菌。

9.根据权利要求7所述的用途,其特征在于:所述用途(2)中,所述放线菌为灰黄链霉菌,其产有毒次生代谢物为缬氨霉素valinomycin。

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