[发明专利]分子标志物、内参基因及其应用、检测试剂盒以及检测模型的构建方法

说明书

本发明涉及生物技术领域，特别涉及及引组合物及其应用、检测试剂盒以及检测模型的构建方法。采用随访信息作为对比方法，本发明提供的试剂盒针对ER和PR阳性乳腺癌初诊患者术后3‑10年复发或死亡风险的预测准确性为70％，其中风险低组和风险高组的预测准确性分别为81.1％和54.4％。相应的FFPE病理检测结果的预测准确性分别为71.9％和56.8％。该试剂盒配套的风险预测模型只需分子标志物Ct值、患者年龄、pT分期、LN数量，无需依赖其他临床病理信息，对乳腺癌预后的评价性能优于单纯病理预测结果，可一定程度上减少因病理预测错误而导致的不当治疗，进一步完善了乳腺癌预后评价的技术方法。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，特别涉及分子标志物、内参基因及其应用、检测试剂盒以及检测模型的构建方法。

背景技术

乳腺癌是威胁全世界女性生命健康的主要原因之一，2013年美国癌症协会发布全美癌症统计显示乳腺癌发病率位居女性癌症之首，死亡率位居第二。最新的美国国家癌症中心数据显示，2013年美国女性新发乳腺癌232,340例，死亡39,620例。在美国，平均每8个妇女中就有一个患乳腺癌。中国虽然属于乳腺癌低发的国家，但近年发病率及死亡率明显上升。在全球每年新诊断出的130万例乳腺癌患者中，约15％来自中国。中国乳腺癌网的统计数据显示我国每年新增乳腺癌达3％-4％，超过世界水平1％-2％，发病率为女性易患肿瘤的第一位。亟待开发乳腺癌预防、诊断、预后、个体化治疗技术。

乳腺癌是一类具有高度异质性的肿瘤，其预后影响因素众多，具有相同临床分期、组织学分级及激素受体表达的乳腺癌患者接受相同的治疗方案，其预后也可能不同。如何准确判断乳腺癌患者的预后及制定相应的个体化治疗方案，避免过度治疗和不当治疗给患者带来的伤害和负担，是临床迫切需要解决的问题。

随着分子生物学技术的飞速发展，使用聚合酶链反应(PCR)、探针杂交及基因芯片等分子生物学方法发现并检测乳腺癌预后相关基因成为可能。2002年Van’t Veer等通过DNA芯片技术筛查117例乳腺癌病例，发现70个与乳腺癌预后相关的基因；2004年美国科学家又利用RT-PCR方法对675例乳腺癌样本进行验证，得到21个与预后相关的基因，GenomicHealth公司根据此研究开发了乳腺癌预后相关产品OncotypeOncotype是目前唯一一款被NCCN指南、ASCO临床指南及St Gallen临床共识3个全球最权威临床指南共同推荐的乳腺癌预后检测产品。此外，Yasuto Naoi等用DNA芯片技术对日本人群中ER阳性、淋巴结阴性乳腺癌患者癌组织样本进行研究，发现95个与预后相关的基因。TorstenO.Nielsen研究组发现，与临床因素及免疫组织化学染色相比，50个基因组合能够提供更多的乳腺癌预后预测信息，并且用FFPE样本代替新鲜样本或速冻样本进行检测，扩大了可检测样本范围。2002-2013年间乳腺癌预后相关检测产品OncotypeMammaprint、ProsIgna^TM、MapQuant Dx^TM相继获得FDA、CE认证。但目前这些产品均基于欧美人群研发，这些产品进入中国后不仅价格昂贵，基因及其检测模型是否适用中国人群也尚待验证。因此，开发经济有效的中国人乳腺癌预后检测技术具有重要意义。

发明内容

有鉴于此，本发明提供了分子标志物及其应用、检测试剂盒以及检测模型的构建方法。该试剂盒在乳腺癌预后评价检测性能上更优于临床病理评价结果，在一定程度上可以减少因病理诊断错误而发生的过度治疗和不当治疗，满足了乳腺癌病人的个体化精准治疗的需求，进一步完善了国内乳腺癌预后预测方面的技术方法。

为了实现上述发明目的，本发明提供以下技术方案：

本发明提供了基因组合物，包括分子标志物MAPT和/或MS4A1。

本发明提供了基因组合物，由分子标志物BCL2、PGR、SCUBE2、ESR1、MKi67、CCNB1、MYBL2、GRB7、ERBB2、MMP11、CD68、BAG1、MAPT和MS4A1组成。