[发明专利]一种基于肽核酸探针的酪蛋白激酶-1基因突变检测试剂及应用在审
申请号: | 201610270438.0 | 申请日: | 2016-04-27 |
公开(公告)号: | CN105695619A | 公开(公告)日: | 2016-06-22 |
发明(设计)人: | 唐景峰;周策凡;陈兴珍;张毅;秦文英 | 申请(专利权)人: | 湖北工业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 武汉科皓知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 42222 | 代理人: | 张火春 |
地址: | 430068 湖北*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 核酸 探针 蛋白激酶 基因突变 检测 试剂 应用 | ||
1.一种用于酪蛋白激酶-1CK1基因突变检测的试剂,其特征在于,包括用于阻断野生型 CK1基因扩增的野生型PNA序列、用于特异性扩增G72D、F101L突变型CK1基因序列的一组引 物对及突变型PNA荧光探针:
所述检测CK1基因G72D突变正向引物如序列表中SEQIDNO.1;
所述检测CK1基因G72D突变反向引物如序列表中SEQIDNO.2;
所述检测CK1基因F101L突变正向引物如序列表中SEQIDNO.3;
所述检测CK1基因F101L突变反向引物如序列表中SEQIDNO.4;
所述检测CK1基因G72D突变PNA荧光探针如序列表中SEQIDNO.5;
所述检测CK1基因F101L突变PNA荧光探针如序列表中SEQIDNO.6;
所述特异性结合包含CK1基因72密码子野生型PNA序列如序列表中SEQIDNO.7;
所述特异性结合包含CK1基因101密码子野生型PNA序列如序列表中SEQIDNO.8;
修饰所述5'端的所述荧光报告基团为:FAM、HEX、TET、JOE、VIC、ROX、Cy3或Cy5,修饰所 述3'端的淬灭基团为:TAMRA、Eclipse、BHQ1、BHQ2、BHQ3或DABCYL。
2.根据权利要求1所述的用于酪蛋白激酶-1CK1基因突变检测的试剂,其特征在于,所 述的检测试剂还包括PCR反应液、72密码子和101密码子突变型参考品、72密码子和101密码 子野生型参考品,其中PCR反应液包括:DEPC水、具有5'→3'外切活性的DNA聚合酶、dNTPs、 10×PCRBuffer、RNASIN、M-MLV逆转录酶、oligo(dT)和含Mg离子的溶液。所述72密码子突 变型参考品为含SEQNO.9的重组质粒DNA;所述72密码子野生型参考品为含SEQNO.10的重 组质粒DNA;所述101密码子突变型参考品为含SEQNO.11的重组质粒DNA;所述101密码子野 生型参考品为含SEQNO.12的重组质粒DNA。
3.根据权利要求2所述的用于酪蛋白激酶-1CK1基因突变检测的试剂,其特征在于,所 述具有5'→3'外切活性的DNA聚合酶为Taq酶。
4.根据权利要求3所述的用于酪蛋白激酶-1CK1基因突变检测的试剂,其特征在于,所 述PCR反应液各组分在PCR扩增反应体系中的终浓度为:Taq酶0.01U/μl~0.05U/μl,dNTPs 0.2~0.6mM,10×PCRBuffer1×,RNASIN40U/μl~60U/μl,M-MLV逆转录酶200U/μl~ 320U/μl,MgCl21.5~5.0mM,溶剂为DEPC水;所述正向引物的终浓度为0.05~0.9μM,所述 反向引物的终浓度为0.05~0.9μM,所述oligo(dT)终浓度为0.05~0.9μM,所述互补PNA序 列终浓度为0.05~0.9μM,所述荧光探针的终浓度为0.05~0.9μM。
5.根据权利要求1-4所述的用于酪蛋白激酶-1CK1基因突变检测的试剂,其特征在于, 所述的试剂进行实时荧光定量PCR的反应程序为:42℃逆转录20min;94℃预变性,2min;95 ℃变性,30s,58℃,45s,此时收集荧光,进行40个循环。
6.权利要求1-5所述的试剂在制备检测癌细胞的检测试剂中的应用,所述癌细胞为睾 丸生殖细胞癌、肝癌。
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