[发明专利]一种用于检测人源性axin2基因表达水平的引物探针组合及其应用在审

专利信息
申请号: 201610253227.6 申请日: 2016-04-22
公开(公告)号: CN105755142A 公开(公告)日: 2016-07-13
发明(设计)人: 蒋明;于丽华;郭佳;徐月 申请(专利权)人: 同济大学苏州研究院
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 215101 江苏省*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 检测 人源性 axin2 基因 表达 水平 引物 探针 组合 及其 应用
【说明书】:

技术领域本发明属基因技术领域,本发明涉及一种用于检测人源性Axin2基因表达水平的引物探针组合。

背景技术Axin2是Axin家族的两个同源蛋白之一,是一种普遍存在于生物体内的蛋白质,其作为一种多功能的支架蛋白参与了多种生理病理过程,涉及到胚胎发育、细胞凋亡、糖原代谢等过程,在Wnt信号通路、应激反应蛋白激酶(SAPK)信号通路、转化生长因子β(TGFβ)信号通路和胰岛素信号转导通路中扮演重要角色,在肿瘤形成、胚胎发育等过程中具有重要的生物学功能。通过对Axin2的研究可研究肿瘤性疾病的发生发展机制。Axin是Wnt信号通路的抑制因子,Wnt信号通路可以调节细胞的增值、分化及运动。Axin对癌症的发生发展具有重要作用,研究发现原癌细胞中存在Axin基因,并且在癌细胞中引入野生型Axin基因可导致癌细胞死亡。对结直肠癌的研究发现结直肠癌中可存在Axin2突变基因,最主要的突变形式为羧基端缺失突变(mutant-typeAxin2,mtAxin2),突变的Axin2会干扰β-catenin的降解,引起β-catenin在核内的积聚进而激活Wnt信号转导系统。此外,Axin可以促进抑癌基因p53产物的磷酸化,进而提高抑癌基因p53基因的转录活性和细胞凋亡;并且在高表达Axin的转基因动物胸腺和脾内表现高水平的细胞凋亡。Axin在Wnt通路中的作用相对明确,但在SAPK/JNK和TGFβ信号通路中的作用研究还较少,对Axin在细胞分化、增殖、凋亡及肿瘤发生发展等过程中的作用仍有很多未知之处,需要进一步研究。

对Axin的研究手段除采用蛋白质组学方面的研究包括免疫沉淀(immunoprecipitation,IP)和Western印迹杂交研究外,分子生物学技术亦是很重要的研究手段,荧光定量PCR方法是简便快捷的研究方法,从基因表达方面对Axin的表达水平进行定量研究,可很好辅助Axin的功能研究,也可通过对Axin基因表达水平的研究探索肿瘤靶向药物的疗效。目前尚未有专门针对人源性Axin2基因表达水平研究的高特异性引物探针检测系统。

发明内容本发明通过设计特异性引物探针系统采用荧光定量PCR方法检测人源性Axin2基因的表达水平,便利了实验研究中Axin2基因表达水平的检测。本发明的工作原理是荧光定量PCR相对定量原理,采用beta-actin基因作为管家基因即参考基因,通过2-△△Ct法确定基因表达水平。

根据NCBI公布的humanAxin2mRNA序列(序列号:NM_004655.3)设计引物探针见表1:

表1.Axin2引物探针设计

引物名称序列F-axinGGTTCTGGCTATGTCTTTGCACCR-axinCTGTTTCTTACTGCCCACACGATP-axinFam- ATATCTCACTGTCGTTGGCGCTGG-BHQ1

选择beta-actin作为内参,根据NCBI公布的betaactin的mRNA序列(序列号:NM_031144.3)设计引物探针序列如下表2:

表2.beta-actin引物探针设计

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